| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | DH1 | 2,204,804 | Δ120 bp | intergenic (‑239/‑54) | tqsA ← / → mdtJ | AI‑2 transporter TqsA/spermidine export protein MdtJ |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | DH1 | = 2204803 | 0 (0.000) | 348 (0.620) | 203/296 | 1.0 | 99.9% | intergenic (‑238/‑174) | tqsA/mdtJ | AI‑2 transporter TqsA/spermidine export protein MdtJ |
| ? | DH1 | 2204924 = | 1 (0.000) | intergenic (‑359/‑53) | tqsA/mdtJ | AI‑2 transporter TqsA/spermidine export protein MdtJ | |||||
Only 100 of 353 total aligned reads displayed.
AGTGAAAATATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTTACCCATCTTCGTACCTCATCCACTATCTTGCTCGTAGGTGAGCAGCACTGGCGCAACGCGCTTTAGTCCTTTCTTCTGCCAAAGCTTGCGCTATGCGCGGGGCTTGACCACTTTACTTTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAA > DH1/2204653‑2204952 | tGAAAATATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTgg > 5:1956545‑M1/1‑149 (MQ=255) gAAAATATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggt < 3:602936‑M1/151‑4 (MQ=255) aaaaTATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggt < 1:1076660‑M1/150‑4 (MQ=255) aaTATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttc < 3:473911‑M1/151‑7 (MQ=255) atatTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcg > 2:2110922‑M1/1‑144 (MQ=255) atatTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcg > 1:646865‑M1/1‑144 (MQ=255) tatTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgc > 1:145598‑M1/1‑143 (MQ=255) ttttGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATTTTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctg > 5:1461808‑M1/1‑141 (MQ=255) ttttGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctg > 6:1942057‑M1/1‑141 (MQ=255) tGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaat > 5:1364464‑M1/1‑138 (MQ=255) tGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaa < 5:290548‑M1/150‑13 (MQ=255) gAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaatt > 5:717915‑M1/1‑137 (MQ=255) gAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaat < 8:1426365‑M1/150‑14 (MQ=255) gTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaa < 5:438405‑M1/151‑17 (MQ=255) gTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaatta > 3:2082736‑M1/1‑135 (MQ=255) tAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaag < 3:1367328‑M1/150‑18 (MQ=255) aTTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcg > 1:1818322‑M1/1‑131 (MQ=255) ttCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcga > 2:1228997‑M1/1‑130 (MQ=255) tCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaa > 1:77066‑M1/1‑129 (MQ=255) ttAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaat > 1:498765‑M1/1‑127 (MQ=255) tAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaatt > 8:2137411‑M1/1‑126 (MQ=255) tAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaat < 8:932056‑M1/150‑25 (MQ=255) aaGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaatta < 2:1134190‑M1/151‑27 (MQ=255) tATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaat > 1:1829411‑M1/1‑121 (MQ=255) aTGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaat > 4:1697059‑M1/1‑120 (MQ=255) aTGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaat > 3:845759‑M1/1‑120 (MQ=255) tGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaata > 3:1252824‑M1/1‑119 (MQ=255) tGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaata > 7:2043822‑M1/1‑119 (MQ=255) tACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattc > 3:1082133‑M1/1‑116 (MQ=255) aCAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattc < 1:958253‑M1/150‑36 (MQ=255) cAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctg > 4:2158668‑M1/1‑114 (MQ=255) cAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattct > 6:1321708‑M1/1‑114 (MQ=255) aaaTCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctct < 4:1860361‑M1/151‑39 (MQ=255) aaaTCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctct < 7:2178314‑M1/151‑39 (MQ=255) aGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcag < 7:318591‑M1/151‑44 (MQ=255) ggCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcagg < 8:1763457‑M1/151‑45 (MQ=255) cGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTATTATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggag < 5:1797121‑M1/151‑47 (MQ=255) cGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcagg > 6:937277‑M1/1‑105 (MQ=255) tgtTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggaga > 4:870020‑M1/1‑103 (MQ=255) tCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaagg < 7:1266743‑M1/150‑51 (MQ=255) cAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGTGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggac < 1:1940342‑M1/151‑53 (MQ=255) cTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaat > 8:1078744‑M1/1‑96 (MQ=255) tACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatg > 5:231161‑M1/1‑95 (MQ=255) tACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatg > 2:852110‑M1/1‑95 (MQ=255) aCCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgt < 2:732452‑M1/151‑58 (MQ=255) aCAATTATCATCCGCGATGCCGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttt > 5:1337101‑M1/1‑87 (MQ=255) ttATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattgg > 8:673180‑M1/1‑83 (MQ=255) atcatcCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATACTTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattgga < 5:1729958‑M1/150‑70 (MQ=255) catcCGCGATGTAGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattt < 8:2229968‑M1/151‑73 (MQ=255) tcCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggatttt > 7:469611‑M1/1‑77 (MQ=255) cgATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattag < 2:895566‑M1/151‑79 (MQ=255) cgATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttatt > 2:1781691‑M1/1‑73 (MQ=255) gATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattagg > 6:384030‑M1/1‑72 (MQ=255) gACGAGAAGCAACACTGCTGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtct < 6:1031111‑M1/151‑83 (MQ=255) gACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtc < 1:872373‑M1/150‑82 (MQ=255) cGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctgg < 4:126790‑M1/151‑85 (MQ=255) cGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctgg < 6:1680269‑M1/151‑85 (MQ=255) gagaAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggg > 5:613443‑M1/1‑66 (MQ=255) agaAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctgtct > 3:134419‑M1/1‑65 (MQ=255) gCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattg < 4:2002213‑M1/151‑91 (MQ=255) gCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattg > 5:1818176‑M1/1‑61 (MQ=255) cacTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctac > 6:1198809‑M1/1‑57 (MQ=255) aaTATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtac < 2:1649960‑M1/150‑110 (MQ=255) tattatGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTATACATTggtttcgatgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaacgacaatgtatatttattggattttattaggtctggatattgctacagaaattaccggtacgcg > 5:2047956‑M1/1‑39 (MQ=255) attatGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggatattgctacagaaattacaggtacgctg > 8:1220763‑M1/1‑38 (MQ=255) tatGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtc > 5:1663443‑M1/1‑36 (MQ=255) atGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtca < 7:1059697‑M1/151‑117 (MQ=255) aCAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatga < 1:1303876‑M1/151‑121 (MQ=255) cAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgcttaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaa < 4:1152660‑M1/151‑122 (MQ=255) cAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatga > 1:1598414‑M1/1‑30 (MQ=255) cAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatga > 8:566495‑M1/1‑30 (MQ=255) aaatTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaa < 6:591506‑M1/150‑122 (MQ=255) aTTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaat > 3:174270‑M1/1‑28 (MQ=255) tGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatggg > 4:536703‑M1/1‑25 (MQ=255) tGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgg < 4:1455691‑M1/150‑126 (MQ=255) gTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggc < 2:240895‑M1/151‑128 (MQ=255) ttCAGGACGTTATTTTCTACATTtgtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctagagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggc < 7:1971370‑M1/150‑128 (MQ=255) tCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcg > 2:1385565‑M1/1‑22 (MQ=255) tCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcg > 5:891589‑M1/1‑22 (MQ=255) cAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcga < 3:1542724‑M1/150‑130 (MQ=255) aGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagc < 3:263537‑M1/151‑132 (MQ=255) gTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtc > 2:645330‑M1/1‑15 (MQ=255) tATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagt < 2:498461‑M1/150‑138 (MQ=255) aTTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtga < 1:2111276‑M1/151‑140 (MQ=255) aTTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtg < 7:1401001‑M1/150‑139 (MQ=255) tttCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtgag < 8:1997247‑M1/150‑141 (MQ=255) ttCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtgagg < 6:2011792‑M1/150‑142 (MQ=255) tACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtgagggaa > 6:78853‑M1/1‑6 (MQ=255) aCATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagagggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtgaggga < 7:1853079‑M1/148‑144 (MQ=255) aCATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtgagggaaat < 1:386932‑M1/151‑147 (MQ=255) aCATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtgagggaaa < 5:486013‑M1/150‑146 (MQ=255) aCATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtgagggaa < 7:1621959‑M1/149‑145 (MQ=255) aCATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtgaggga < 6:230785‑M1/148‑144 (MQ=255) aCATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtgaggga < 2:950841‑M1/148‑144 (MQ=255) aCATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattacaggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtgagggaaat > 6:505114‑M1/1‑5 (MQ=255) cATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtgagggaaatg < 7:1566718‑M1/151‑148 (MQ=255) cATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtgagggaaatg < 6:996356‑M1/151‑148 (MQ=255) cATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtgagggaaatg < 8:1473664‑M1/151‑148 (MQ=255) aTTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtgagggaaatgg > 7:760415‑M1/1‑3 (MQ=255) tggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtgagggaaatggc < 4:785662‑M1/150‑150 (MQ=255) | AGTGAAAATATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTTACCCATCTTCGTACCTCATCCACTATCTTGCTCGTAGGTGAGCAGCACTGGCGCAACGCGCTTTAGTCCTTTCTTCTGCCAAAGCTTGCGCTATGCGCGGGGCTTGACCACTTTACTTTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAA > DH1/2204653‑2204952 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |