| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | DH1 | = 2478888 | 224 (0.390) | 313 (0.570) | 187/290 | 1.9 | 56.0% | noncoding (5/1204 nt) | repeat_region | repeat region |
| ? | DH1 | 2480088 = | 276 (0.500) | intergenic (‑73/‑63) | insH1/fnr | transposase/fumarate and nitrate reduction regulatory protein | |||||
Only 100 of 550 total aligned reads displayed.
AGGTTATCTTTTGCTGTAAACATTAAACAATTTGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGTTTCTTCGCCATTTAAGGCGTTATCCCCAGTTTTT > DH1/2478739‑2479036 | aGGATATCTTTTGCTGTAAACATTAAACAATTTGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGa < 4:197328‑M1/151‑2 (MQ=255) tATCTTTTGCTGTAAACATTAAACAATTTGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGaa < 8:2195814/150‑1 (MQ=255) aTCTTTTGCTGTAAACATTAAACAATTTGTTCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATATATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGactta < 4:1404434‑M1/150‑6 (MQ=255) tttGCTTTAAACATTAAACAATTTGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTg < 3:253681/149‑1 (MQ=255) tttGCTGTAAACATTAAACAATTTGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttactt < 2:502740‑M1/149‑9 (MQ=255) tttGCTGTAAACATTAAACAATTTGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGt < 4:789399/148‑1 (MQ=255) gCTGTAAACATTAAACAATTTGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGaa < 3:1909124/150‑1 (MQ=255) gCTGTAAACATTAAACAATTTGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGAAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAAt < 3:2112115/151‑1 (MQ=255) gCTGTAAACATTAAACAATTTGTGCCAGCTTGTTAACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttagttgctcc > 6:12845‑M1/1‑138 (MQ=255) cTGTAAACATTAAACAATTTGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccc > 5:579677‑M1/1‑137 (MQ=255) tGTAAACATTAAACAATTTGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATa > 3:1982634/1‑150 (MQ=255) gTAAACATTAAACAATTTGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATaa < 7:1912525/150‑1 (MQ=255) tAAACATTAAACAATTTGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctcccta > 6:779433‑M1/1‑134 (MQ=255) aaaCATTAAACAATTTGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATTGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaa < 5:1439631‑M1/151‑19 (MQ=255) aaaCATTAAACAATTTGTGCCAGCTTGATCACACTTTAATCAAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATACCAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCg > 1:415102/1‑151 (MQ=255) aaCATTAAACAATTTGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaa < 4:988929‑M1/151‑20 (MQ=255) aaCATTAAACAATTTGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaa > 6:875127‑M1/1‑132 (MQ=255) cATTAAACAATTTGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaa > 7:1767739‑M1/1‑130 (MQ=255) tAAACAATTTGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatg > 6:970882‑M1/1‑127 (MQ=255) tAAACAATTTGTGCCAGCTTGTTCAAACTTTTATGTAAAGTTACACTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATATAATATCGGAATTATCTGCTGTTAAGGTTTGATTAGacttacttgctccctaaaaagatg > 4:1193138‑M1/1‑127 (MQ=255) aaaCAATTTGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgt > 1:1123227‑M1/1‑126 (MQ=255) aaaCAATTTGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAAt > 2:1778288/1‑151 (MQ=255) aaCAATTTGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAAtt > 8:1018596/1‑151 (MQ=255) aaCAATTTGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAAtt < 6:2129773/151‑1 (MQ=255) tttGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATtcttct > 8:1712589/1‑151 (MQ=255) tgCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattga < 6:337634‑M1/150‑35 (MQ=255) tgCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGc > 5:2226403/1‑151 (MQ=255) gCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgac > 7:1389884‑M1/1‑115 (MQ=255) cAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGATTAGacttacttgctccctaaaaagattttaaaattgacaa > 5:850702‑M1/1‑113 (MQ=255) aGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgactaat < 5:133500‑M1/151‑40 (MQ=255) gCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaat > 4:1730964‑M1/1‑111 (MQ=255) gCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGTTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACt < 7:2019854/151‑1 (MQ=255) tGTTCACACTTTTATGTAAAGATACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGAc < 2:705948/147‑1 (MQ=255) gTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaa < 3:146333‑M1/151‑45 (MQ=255) ttCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGtc > 2:1035976/1‑151 (MQ=255) ttCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATACATAGACATATATTTACATCTAATATCGCAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGtc > 2:336502/1‑151 (MQ=255) tttATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGTAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggct < 7:1484589‑M1/150‑53 (MQ=255) ttATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggctt < 3:108502‑M1/150‑54 (MQ=255) tAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgaaaaatatcaattacggcttgagc > 4:888508‑M1/1‑92 (MQ=255) tAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATttcttc > 1:83561/1‑150 (MQ=255) aaaGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagc > 1:1524867‑M1/1‑91 (MQ=255) aGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaggatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacc > 7:244718‑M1/1‑89 (MQ=255) aGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacc < 5:1596567‑M1/151‑63 (MQ=255) aCCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatg < 3:354012‑M1/151‑67 (MQ=255) ttAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGatttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcc > 6:1607566‑M1/1‑81 (MQ=255) aacaacTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccg < 8:2083022‑M1/151‑73 (MQ=255) aacaacTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGa < 7:1583558/150‑1 (MQ=255) caacTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccgg > 4:676322‑M1/1‑77 (MQ=255) caacTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccgg > 6:593529‑M1/1‑77 (MQ=255) aacTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGAtttt > 8:29698/1‑151 (MQ=255) ttAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGATTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGAttttttg > 8:1383398/1‑150 (MQ=255) tAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTTGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTtct > 7:206928/1‑151 (MQ=255) tAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagc > 5:38763‑M1/1‑72 (MQ=255) aaGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcg < 7:694623‑M1/151‑81 (MQ=255) aaGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcg < 8:811209‑M1/151‑81 (MQ=255) aGGGTTTTCAAATAGATAGACATTTTTTTTCATCTAATATCTGAATTCTCTGCTGTTATGGTTTGCTTATGGAACTTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTGATTTCATTTCTTCTTGTTTGAGCAGATTTTTtctg < 4:508727/150‑2 (MQ=21) aGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcga < 4:107898‑M1/151‑82 (MQ=255) ggTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaat > 2:2229456‑M1/1‑68 (MQ=255) gTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaatt > 5:1144261‑M1/1‑67 (MQ=255) tttCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTCTTAAGGATTGCTTAGacttacttgctacctaaaaagatctaaaaattgacaaatatcaataacggcttcagcagacctatgatcccggaaaagccaatta > 2:1493356‑M1/1‑65 (MQ=255) tCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTaaa < 7:894457/150‑1 (MQ=255) tCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAAt > 3:526682/1‑151 (MQ=255) aaaTAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacgg < 2:1954536‑M1/151‑91 (MQ=255) agatagaCATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgc > 7:433157‑M1/1‑57 (MQ=255) agatagaCATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatccaggaaaagcgaattatacggcgc > 5:187339‑M1/1‑57 (MQ=255) gatagaCATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcat > 8:1864593‑M1/1‑56 (MQ=255) tagaCATATATTCACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAAt > 2:117209/1‑151 (MQ=255) agaCATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattc > 2:1377078‑M1/1‑53 (MQ=255) gaCATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCa < 2:993496/151‑1 (MQ=255) cATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGc > 1:2046182/1‑151 (MQ=255) tatTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattcagtctggc > 6:113351‑M1/1‑46 (MQ=255) atTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTAtt < 4:2054397/151‑1 (MQ=255) atTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTAt < 1:1837616/150‑1 (MQ=255) tACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattcagtctggcggt < 5:484480‑M1/150‑109 (MQ=255) aCATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattcagtctggcggtt < 7:603729‑M1/150‑110 (MQ=255) aCATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCCAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAg < 5:2054413/150‑1 (MQ=255) cATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGAc > 3:73677/1‑151 (MQ=255) cATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGAc > 7:1175435/1‑151 (MQ=255) cTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGt > 8:1144467/1‑151 (MQ=255) aaTCTCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGttt < 2:2097548/151‑1 (MQ=255) aaTATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattcagtctggcggttgtgctat < 1:1316621‑M1/151‑117 (MQ=255) atatCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattcagtctggcggttgtgctatc > 7:1246343‑M1/1‑34 (MQ=255) atatCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGttt > 4:338973/1‑150 (MQ=255) atatCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGTttc < 1:68781/151‑1 (MQ=255) cGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGTttcttc < 8:494010/150‑1 (MQ=255) cGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGTTTCTTCg < 1:168703/151‑1 (MQ=255) gAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattcagtctggcggttgtgctatccattgc > 8:631203‑M1/1‑28 (MQ=255) gAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattcagtctggcggttgtgctatccattgc > 3:1737131‑M1/1‑28 (MQ=255) aTTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattcagtctggcggttgtgctatccattgcca < 2:1407991‑M1/151‑126 (MQ=255) aTTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattcagtctggcggttgtgctatccattgcc > 5:713662‑M1/1‑26 (MQ=255) ctgctgTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattcagtctggcggttgtgctatccattgccaggatt > 4:2116722‑M1/1‑21 (MQ=255) ctgctgTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattcagtctggcggttgtgctatccattgccagga < 2:574563‑M1/149‑129 (MQ=255) ctgctgTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGTTTCTTCGCCAttt < 1:1374035/148‑1 (MQ=255) tgctgTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGTTTCTTCGCCATTTAAgg > 6:1915266/1‑151 (MQ=40) gctgTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGTTTCTTCGCCATTTAAGGc > 4:1326580/1‑151 (MQ=39) tttAAGGTTTGCTTTGGTAAGGTGCTAATAAGCGGTGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGTTTCTTCGCCATTTAAGGCg < 6:525137/148‑1 (MQ=255) aaGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattcagtctggcggttgtgctatccattgccaggattgcagcatc < 3:1564916‑M1/151‑139 (MQ=255) ttGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattcagtctggcggttgtgctatccattgccaggattgcagcatcagcc < 1:498168‑M1/150‑143 (MQ=255) ttGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattcagtctggcggttgtgctatccattgccaggattgcagcatcagcc > 2:803924‑M1/1‑8 (MQ=255) tAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattcagtctggcggttgtgctatccattgccaggattgcagcatcagccagcttt > 1:2199202‑M1/1‑3 (MQ=255) | AGGTTATCTTTTGCTGTAAACATTAAACAATTTGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGTTTCTTCGCCATTTAAGGCGTTATCCCCAGTTTTT > DH1/2478739‑2479036 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |