| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | DH1 | 2,204,804 | Δ120 bp | intergenic (‑239/‑54) | tqsA ← / → mdtJ | AI‑2 transporter TqsA/spermidine export protein MdtJ |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | DH1 | = 2204803 | 0 (0.000) | 233 (0.460) | 161/296 | 2.1 | 100% | intergenic (‑238/‑174) | tqsA/mdtJ | AI‑2 transporter TqsA/spermidine export protein MdtJ |
| ? | DH1 | 2204924 = | 0 (0.000) | intergenic (‑359/‑53) | tqsA/mdtJ | AI‑2 transporter TqsA/spermidine export protein MdtJ | |||||
Only 100 of 236 total aligned reads displayed.
AGTGAAAATATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTTACCCATCTTCGTACCTCATCCACTATCTTGCTCGTAGGTGAGCAGCACTGGCGCAACGCGCTTTAGTCCTTTCTTCTGCCAAAGCTTGCGCTATGCGCGGGGCTTGACCACTTTACTTTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAA > DH1/2204653‑2204952 | gTGAAAATATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTAAGGACAATTAGTTCAGGACGTTATTTTCTAGATTg > 4:244939‑M1/1‑150 (MQ=255) tatTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTTTGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTcgtttcgc > 6:573678‑M1/1‑143 (MQ=255) atTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgc < 7:885595‑M1/150‑9 (MQ=255) ttttGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctg > 4:35922‑M1/1‑141 (MQ=255) ttGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctga > 3:1864092‑M1/1‑139 (MQ=255) aGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaatta < 2:1008645‑M1/151‑16 (MQ=255) gTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaatta > 3:1269779‑M1/1‑135 (MQ=255) gTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaatta > 3:1213249‑M1/1‑135 (MQ=255) ttAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaatta > 1:1509166‑M1/1‑134 (MQ=255) tAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagc > 1:1979784‑M1/1‑133 (MQ=255) aaTTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATAATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTcgtttcgctgaattaagcg > 5:138727‑M1/1‑132 (MQ=255) aTTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcga < 3:1568707‑M1/151‑21 (MQ=255) tCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaa > 7:2029766‑M1/1‑129 (MQ=255) tCTTAAGCTATGATAAAAATCAGGCGTGGTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACCCTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGGTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaa < 8:287768‑M1/150‑22 (MQ=255) aaGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaatt < 2:1594063‑M1/150‑26 (MQ=255) gATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACGGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataa < 4:831890‑M1/150‑33 (MQ=255) gATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataat < 3:1776028‑M1/151‑34 (MQ=255) aTACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataatt > 6:728116‑M1/1‑117 (MQ=255) aCAAATCAGGCGTGTTCATCTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattct < 2:1404196‑M1/151‑37 (MQ=255) aCAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattct > 1:1241908‑M1/1‑115 (MQ=255) aCAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattc < 4:202701‑M1/150‑36 (MQ=255) aaTCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctctt < 4:1082936‑M1/151‑40 (MQ=255) aTCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttg > 3:1370695‑M1/1‑111 (MQ=255) cGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggag < 3:1246518‑M1/151‑47 (MQ=255) cGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggag < 1:1205957‑M1/151‑47 (MQ=255) gtgtTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggaga < 1:703854‑M1/151‑48 (MQ=255) tCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaagg < 6:1785672‑M1/150‑51 (MQ=255) aaCTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggaca < 1:1165297‑M1/151‑54 (MQ=255) aaCTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggaca < 8:838970‑M1/151‑54 (MQ=255) aCTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggaca > 8:1198253‑M1/1‑97 (MQ=255) cTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaat > 8:75318‑M1/1‑96 (MQ=255) tACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatg > 2:1953993‑M1/1‑95 (MQ=255) aCCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatg < 7:1796758‑M1/150‑57 (MQ=255) gAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtata < 5:773864‑M1/151‑61 (MQ=255) aGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTGAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatat < 2:1355839‑M1/151‑62 (MQ=255) gACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatattt < 1:25812‑M1/151‑64 (MQ=255) aaTTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaaagtatatttatt > 6:296781‑M1/1‑85 (MQ=255) ttATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattgg > 5:2008844‑M1/1‑83 (MQ=255) tATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattgg < 7:545183‑M1/150‑69 (MQ=255) aatccGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattt < 4:1142784‑M1/150‑73 (MQ=255) atcCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggatttt < 5:447005‑M1/151‑74 (MQ=255) ccGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggatttta < 8:515453‑M1/150‑75 (MQ=255) cgcgATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttatt < 4:1692174‑M1/151‑77 (MQ=255) cgcgATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttatt < 5:85106‑M1/151‑77 (MQ=255) ggaTGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaatttaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattag < 6:2023057‑M1/150‑79 (MQ=255) cgATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattag < 4:731645‑M1/151‑79 (MQ=255) gATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattagg > 6:496667‑M1/1‑72 (MQ=255) aTGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggt > 7:702327‑M1/1‑71 (MQ=255) aTGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggt < 4:1095326‑M1/151‑81 (MQ=255) gACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtct < 5:1670256‑M1/151‑83 (MQ=255) gACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtct < 3:1084837‑M1/151‑83 (MQ=255) gACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtc < 4:185493‑M1/150‑82 (MQ=255) aCGAGAAGGAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctg < 6:1299633‑M1/151‑84 (MQ=255) aCGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctg > 6:1072349‑M1/1‑68 (MQ=255) gagaAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggc > 4:974747‑M1/1‑66 (MQ=255) gagaAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggc > 6:1409991‑M1/1‑66 (MQ=255) aaGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctat > 5:1149707‑M1/1‑63 (MQ=255) aaGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctat > 4:435680‑M1/1‑63 (MQ=255) aaGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctat > 2:233052‑M1/1‑63 (MQ=255) aaGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctat < 6:1678228‑M1/151‑89 (MQ=255) acacTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgcta < 2:568757‑M1/151‑94 (MQ=255) agtgaggatattTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGTCGTTATTTTCTTCTTTggtttctctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttatttgattttattaggtctggctattgctaga < 4:1046460‑M1/146‑96 (MQ=255) acTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctac > 5:1787177‑M1/1‑56 (MQ=255) gCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacag < 4:95068‑M1/149‑97 (MQ=255) cGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaa > 1:1438837‑M1/1‑52 (MQ=255) tAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttaataggtctggctattgctacagaaattac > 3:251144‑M1/1‑48 (MQ=255) aaTTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattacc < 5:1050875‑M1/151‑105 (MQ=255) tGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggt > 7:1378366‑M1/1‑44 (MQ=255) tAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtac > 5:1645573‑M1/1‑42 (MQ=255) aaTATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacg < 6:985193‑M1/151‑111 (MQ=255) aaTATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacg > 6:389481‑M1/1‑41 (MQ=255) aaTATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtac < 7:324822‑M1/150‑110 (MQ=255) ttatGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgt > 2:1773939‑M1/1‑37 (MQ=255) ggACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTAGATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaat < 5:1320347‑M1/151‑119 (MQ=255) gACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatg > 1:1742941‑M1/1‑32 (MQ=255) aCAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTAAATTggtttcgctgaattaagcgaaaattataataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtatggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcattg > 2:1022468‑M1/1‑31 (MQ=255) cAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatga > 3:1627385‑M1/1‑30 (MQ=255) tttGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatg > 3:1531190‑M1/1‑27 (MQ=255) tGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgcttaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgg < 5:1862535‑M1/150‑126 (MQ=255) tGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatggg > 7:393512‑M1/1‑25 (MQ=255) tGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgg < 8:1943905‑M1/150‑126 (MQ=255) gTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggc < 7:1199696‑M1/151‑128 (MQ=255) tCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcg > 3:611322‑M1/1‑22 (MQ=255) tCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcg > 6:1518651‑M1/1‑22 (MQ=255) cAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcg > 1:378000‑M1/1‑21 (MQ=255) ggACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcg < 3:501552‑M1/151‑133 (MQ=255) gACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgt > 1:631038‑M1/1‑18 (MQ=255) cGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtca < 6:450505‑M1/151‑136 (MQ=255) cGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtc > 7:608831‑M1/1‑16 (MQ=255) tATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtg > 8:1271705‑M1/1‑13 (MQ=255) ttttCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtg > 6:352960‑M1/1‑11 (MQ=255) ttCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtgagg < 6:1219074‑M1/150‑142 (MQ=255) tCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtgaggg > 2:989527‑M1/1‑8 (MQ=255) aCATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtgagggaa < 2:439912‑M1/149‑145 (MQ=255) aCATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtgagggaa < 8:581087‑M1/149‑145 (MQ=255) aCATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtgagggaa < 5:654722‑M1/149‑145 (MQ=255) aCATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtgaggga < 6:907652‑M1/148‑144 (MQ=255) cATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtgagggaaatg > 2:794750‑M1/1‑4 (MQ=255) tggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtgagggaaatggc < 4:1268658‑M1/150‑150 (MQ=255) tggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtgagggaaatggc < 1:544054‑M1/150‑150 (MQ=255) | AGTGAAAATATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTTACCCATCTTCGTACCTCATCCACTATCTTGCTCGTAGGTGAGCAGCACTGGCGCAACGCGCTTTAGTCCTTTCTTCTGCCAAAGCTTGCGCTATGCGCGGGGCTTGACCACTTTACTTTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAA > DH1/2204653‑2204952 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |