| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | DH1 | 2,204,804 | Δ120 bp | intergenic (‑239/‑54) | tqsA ← / → mdtJ | AI‑2 transporter TqsA/spermidine export protein MdtJ |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | DH1 | = 2204803 | 0 (0.000) | 233 (0.460) | 161/296 | 2.1 | 100% | intergenic (‑238/‑174) | tqsA/mdtJ | AI‑2 transporter TqsA/spermidine export protein MdtJ |
| ? | DH1 | 2204924 = | 0 (0.000) | intergenic (‑359/‑53) | tqsA/mdtJ | AI‑2 transporter TqsA/spermidine export protein MdtJ | |||||
Only 100 of 235 total aligned reads displayed.
CAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTTACCCATCTTCGTACCTCATCCACTATCTTGCTCGTAGGTGAGCAGCACTGGCGCAACGCGCTTTAGTCCTTTCTTCTGCCAAAGCTTGCGCTATGCGCGGGGCTTGACCACTTTACTTTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAGTGAGGGAAATGGC > DH1/2204774‑2205072 | gtgaaaatattttgagttaattcttaagctatgatacaaatcaggcgtgttcaactaccgaggacaattatcatccgcgatgacgagaagcaacactgcggataattgtaatattaaggacaattagttcaggacgttattttctagattg > 4:244939‑M2/151‑151 (MQ=255) aaaatattttgagttaattcttaagctatgatacaaatcaggcgtgttcaactaccgaggacaattatcatccgcgatgacgagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGtt > 4:1083528‑M2/148‑151 (MQ=255) tattttgagttaattcttaagctatgatacaaatcaggcgtgttcaactaccgaggacaattatcatccgcgatgacgagaagcaacactgcggataattgtaatattttggacaatttgttcaggacgttattttctacattCGTTTCGc > 6:573678‑M2/144‑151 (MQ=255) attttgagttaattcttaagctatgatacaaatcaggcgtgttcaactaccgaggacaattatcatccgcgatgacgagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGc < 7:885595‑M2/8‑1 (MQ=255) attttgagttaattcttaagctatgatacaaatcaggcgtgttcaactaccgaggacaattatcatccgcgatgacgagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCt > 4:203025‑M2/143‑151 (MQ=255) tttgatttaattcttaagctatgatacaaatcaggcgtgttcaactaccgaggacaattatcatccgcgatgacgagaagcaacactgctgataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTg < 1:760907‑M2/10‑1 (MQ=255) gagttaattcttaagctatgatacaaatcaggcgtgttcaactaccgaggacaattatcatccgcgatgacgagaagcaacgctgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAAtt < 2:244595‑M2/14‑1 (MQ=255) agttaattcttaagctatgatacaaatcaggcgtgttcaactaccgaggacaattatcatccgcgatgacgagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTa < 4:845123‑M2/15‑1 (MQ=255) agttaattcttaagctatgatacaaatcaggcgtgttcaactaccgaggacaattatcatccgcgatgacgagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTa < 2:1474238‑M2/15‑1 (MQ=255) agttaattcttaagctatgatacaaatcaggcgtgttcaactaccgaggacaattatcatccgcgatgacgagaagcaacactgcggataatagtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTa < 5:1068347‑M2/15‑1 (MQ=255) gttaattcttaagctatgatacaaatcaggcgtgttcaactaccgaggacaattatcatccgcgatgacgagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTa > 3:1213249‑M2/136‑150 (MQ=255) aattcttaagctatgatacaaatcaggcgtgttcaactaccgaggacaattatcatccgcgatgacgagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCg < 6:255192‑M2/19‑1 (MQ=255) tcttaagctatgatacaaatcaggcgtgttcaactaccgaggacaattatcatccgcgatgacgagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGaa > 7:2029766‑M2/130‑150 (MQ=255) tcttaagctatgataaaaatcaggcgtggtcaactaccgaggacaattatcatccgcgatgacgagaagcaaccctgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacggtattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGaa < 8:287768‑M2/21‑1 (MQ=255) taagctatgatacaaatcaggcgtgttcaactaccgaggacaattatcatccgcgatgacgagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGaaaa < 1:1480450‑M2/23‑1 (MQ=255) taagctatgatacaaatcaggcgtgttcaactaccgaggacaattatcatccgcgatgacgagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAAt < 3:580194‑M2/24‑1 (MQ=255) aagctatgatacaaatcaggcgtgttcaactaccgaggacaattatcatccgcgatgacgagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTa < 3:1574036‑M2/26‑1 (MQ=255) gatacaaatcaggcgtgttcaactaccgaggacaattatcatccgcgatgacgagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAaataa < 4:1245933‑M2/32‑1 (MQ=255) atacaaatcaggcgtgttcaactaccgaggacaattatcatccgcgatgacgagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAAtt > 6:728116‑M2/118‑151 (MQ=255) acaaatcaggcgtgttcaactaccgaggacaattatcatccgcgatgacgagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATtct > 1:1241908‑M2/116‑151 (MQ=255) aaatcaggcgtgttcaactaccgaggacaattatcatccgcgatgacgagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTctct > 2:1651102‑M2/114‑151 (MQ=255) atcaggcgtgttcaactaccgaggacaattatcatccgcgatgacgagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTg > 2:201438‑M2/112‑151 (MQ=255) atcaggcgtgttcaactaccgaggacaattatcatccgcgatgacgagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTg > 3:1370695‑M2/112‑151 (MQ=255) atcaggcgtgttcaactaccgaggacaattatcatcagcgatgacgagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAATCGAAAAATAAaataattatatt > 2:810480‑M2/112‑145 (MQ=255) cacgcgtgttcaactaccgaggacaattatcatccgcgatgacgagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGc < 5:478142‑M2/41‑1 (MQ=255) cgtgttcaactaccgaggacaattatcatccgcgatgacgagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGgag < 1:1205957‑M2/46‑1 (MQ=255) gtgttcaactaccgaggacaattatcatccgcgatgacgagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAgg > 3:1086700‑M2/105‑148 (MQ=255) tcaactaccgaggacaattatcatccgcgatgacgagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAgg < 6:1785672‑M2/50‑1 (MQ=255) aactaccgaggacaattatcatccgcgatgacgagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACa < 1:1165297‑M2/53‑1 (MQ=255) aactaccgaggacaattatcatccgcgatgacgagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACa < 8:838970‑M2/53‑1 (MQ=255) actaccgaggacaattatcatccgcgatgacgagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACa > 8:1198253‑M2/98‑150 (MQ=255) ctaccgaggacaattatcatccgcgatgacgagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAAt > 8:75318‑M2/97‑151 (MQ=255) accgaggacaattatcatccgcgatgacgagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATg < 7:1796758‑M2/56‑1 (MQ=255) gaggacaattatcatccgcgatgacgagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGtat > 3:1275289‑M2/92‑150 (MQ=255) aggacaattatcatccgcgatgacgagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttgaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTatat < 2:1355839‑M2/61‑1 (MQ=255) aattatcatccgcgatgacgagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAAAGTAtatttatt > 6:296781‑M2/86‑151 (MQ=255) tatcatccgcgatgacgagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTgg < 7:545183‑M2/68‑1 (MQ=255) tatcatccgcgatgacgagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTgg > 6:1224296‑M2/83‑150 (MQ=255) tcatccgcgatgacgagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGAtt > 7:36874‑M2/81‑151 (MQ=255) catccgcgatgacgagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGAttt > 5:241287‑M2/80‑151 (MQ=255) atccgcgatgacgagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGAtttt > 3:1794455‑M2/79‑151 (MQ=255) atccgcgatgacgagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGAtttt > 4:46593‑M2/79‑151 (MQ=255) ccgcgatgacgagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTtta < 8:515453‑M2/74‑1 (MQ=255) cgcgatgacgagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTttatt < 1:2006281‑M2/76‑1 (MQ=255) cgcgatgacgagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTttatt < 5:85106‑M2/76‑1 (MQ=255) cgcgatgacgagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTttatt < 4:1692174‑M2/76‑1 (MQ=255) gcgatgacgagaagcaacactgccgataattttaatattatggacaatttgatcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTttatta < 6:933642‑M2/77‑1 (MQ=255) cgatgacgagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTCTATTTATTGGATTttatt > 4:377619‑M2/74‑149 (MQ=255) cgatgacgagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAg < 4:731645‑M2/78‑1 (MQ=255) gatgacgagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAgg > 6:496667‑M2/73‑151 (MQ=255) atgacgagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGt < 4:1095326‑M2/80‑1 (MQ=255) atgacgagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGt > 7:702327‑M2/72‑151 (MQ=255) gacgagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCt < 5:1670256‑M2/82‑1 (MQ=255) acgagaaggaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTg < 6:1299633‑M2/83‑1 (MQ=255) acgagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTg > 6:1072349‑M2/69‑151 (MQ=255) gagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGc > 6:1409991‑M2/67‑151 (MQ=255) gagaagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGc > 4:974747‑M2/67‑151 (MQ=255) aagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTAt < 6:1678228‑M2/88‑1 (MQ=255) aagcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTAt > 5:1149707‑M2/64‑151 (MQ=255) agcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTAtt < 2:1131612‑M2/89‑1 (MQ=255) gcaacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTg < 2:634229‑M2/90‑1 (MQ=255) caacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGc < 3:749992‑M2/91‑1 (MQ=255) caacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGc < 1:1830284‑M2/91‑1 (MQ=255) aacactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCt < 5:1836704‑M2/92‑1 (MQ=255) cactgcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTAc < 4:1862777‑M2/94‑1 (MQ=255) agtgaggatatttgtaatattatggacaatttgttcaggtcgttattttcttctttGGTTTCTCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTTGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGctaga < 4:1046460‑M2/95‑3 (MQ=255) gcggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAg < 4:95068‑M2/96‑1 (MQ=255) ggataattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTATGTCTGGCTATTGCTACAGAAAt > 2:455813‑M2/52‑151 (MQ=255) taattgtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTAATAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTAc > 3:251144‑M2/49‑151 (MQ=255) gtaatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGt < 1:346333‑M2/107‑1 (MQ=255) taatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTAc > 5:1645573‑M2/43‑151 (MQ=255) aatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACg < 6:985193‑M2/110‑1 (MQ=255) aatattatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACg > 6:389481‑M2/42‑151 (MQ=255) ttatggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGt > 2:1773939‑M2/38‑151 (MQ=255) atggacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCa < 5:1604866‑M2/116‑1 (MQ=255) ggacaatttgttcatgacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCaa < 1:463258‑M2/117‑1 (MQ=255) ggacaatttgttcaggacgttattttctagattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAAt < 5:1320347‑M2/118‑1 (MQ=255) gacaatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAAt < 3:1250431‑M2/118‑1 (MQ=255) caatttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGa > 3:1627385‑M2/31‑150 (MQ=255) ttgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATgg > 6:1547077‑M2/27‑151 (MQ=255) tgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTTAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATgg < 5:1862535‑M2/125‑1 (MQ=255) tgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATggg > 7:393512‑M2/26‑151 (MQ=255) tgttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATgg < 8:1943905‑M2/125‑1 (MQ=255) gttcaggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGc < 7:1199696‑M2/127‑1 (MQ=255) caggacgttattttctacattGGTTTCTCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGa < 3:1545741‑M2/129‑1 (MQ=255) caggacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAg < 3:1067639‑M2/130‑1 (MQ=255) gacgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGt > 4:1322203‑M2/19‑151 (MQ=255) cgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTc > 7:608831‑M2/17‑150 (MQ=255) cgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCa < 6:450505‑M2/135‑1 (MQ=255) cgttattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCa < 7:1617178‑M2/135‑1 (MQ=255) tattttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAGTg > 8:1271705‑M2/14‑151 (MQ=255) ttttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAGTg > 6:352960‑M2/12‑149 (MQ=255) tttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAGTGAgg > 5:800248‑M2/11‑151 (MQ=255) ttctacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAGTGAgg < 3:1932138‑M2/141‑1 (MQ=255) tacattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAGTGAGGgaat > 1:603909‑M2/7‑150 (MQ=255) acattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAGTGAGGGaa < 5:654722‑M2/144‑1 (MQ=255) acattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAGTGAGGGaa < 8:581087‑M2/144‑1 (MQ=255) acattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAGTGAGGGAAAt > 1:690228‑M2/6‑151 (MQ=255) acattGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAGTGAGGGAAAt < 1:1652210‑M2/146‑1 (MQ=255) attGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAGTGAGGGAAATgg > 2:1010371‑M2/4‑151 (MQ=255) | CAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTTACCCATCTTCGTACCTCATCCACTATCTTGCTCGTAGGTGAGCAGCACTGGCGCAACGCGCTTTAGTCCTTTCTTCTGCCAAAGCTTGCGCTATGCGCGGGGCTTGACCACTTTACTTTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAGTGAGGGAAATGGC > DH1/2204774‑2205072 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |