| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | DH1 | = 1702500 | 257 (0.500) | 245 (0.490) | 162/292 | 1.9 | 50.6% | noncoding (5/1205 nt) | repeat_region | repeat region |
| ? | DH1 | 1703700 = | 228 (0.460) | noncoding (1205/1205 nt) | repeat_region | repeat region | |||||
Only 100 of 493 total aligned reads displayed.
GACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATTGTCATCATTAT > DH1/1703551‑1703850 | ggaagaaattaaagagttgtgtcagaatcataatattcctgttgaattaatccagtgtcgggttaatgaaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttagtt < 7:953184‑M2/2‑1 (MQ=255)ggaagaaattaaagagttgtgtcagaatcataatattcctgttgaattaatccagtgtcgggttaatgaaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttagtt < 7:1036590‑M2/2‑1 (MQ=255) aCAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGtt > 7:1876016/1‑150 (MQ=11) aagaaattaaagagttgtgtcagaatcataatattcctgttgaattaatccagtgtcgggttaatgaaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttagTTc > 5:200775‑M2/148‑150 (MQ=255) agaaattaaagagttgtgtcagaatcataatattcctgttgaattaatccagtgtcgggttaatgaaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttagTTCAc < 5:753238‑M2/5‑1 (MQ=255) caaaaTCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTCACgg < 6:1555800/150‑1 (MQ=18) aaaaTCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCGCCTTCCGTAGTGCACGGc > 8:1236185/1‑151 (MQ=9) aaaaTCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTCACGGc < 7:525331/151‑1 (MQ=34) attaaagagttgtgtcagaatcataatattcctgttgaattaatccagtgtcgggttaatgaaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttagTTCACGGc > 2:992960‑M2/143‑150 (MQ=255) ttaaagagttgtgtcagaatcataatattcctgttgaattaatccagtgtcgggttaatgaaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttagTTCACGGCAt > 1:30570‑M2/142‑151 (MQ=255) ttaaagagttgtgtcagaatcataatattcctgttgaattaatccagtgtcgggttaatgaaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttagTTCACGGCAt > 4:112939‑M2/142‑151 (MQ=255) aaTCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTCACGGCAt < 3:1974511/151‑1 (MQ=35) aaTCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTCACGGCAt < 1:1627833/151‑1 (MQ=35) agagttgtgtcagaatcataatattcctgttgaattaatccagtgtcgggttaatgaaatagaaacctatatggatggtttgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttagTTCACGGCATgccg > 7:1969440‑M2/138‑150 (MQ=255) agagttgtgtcagaatcataatattcctgttgaattaatccagtgtcgggttaatgaaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttagTTCACGGCATGCCt > 7:1516203‑M2/138‑151 (MQ=255) ttttCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACATTCCTTAGTTCACGGCATGCCttt > 3:1639695/1‑151 (MQ=255) gttgtgtcagaatcataatattcctgttgaattaatccagtgtcgggttaatgaaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttagTTCACGGCATGCCtttt < 2:398478‑M2/17‑1 (MQ=255) gttgtgtcagaatcataatattcctgttgaattaatccagtgtcgggttaatgaaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttagTTCACGGCATGCCtttt < 4:1585097‑M2/17‑1 (MQ=255) tgtgtcagaatcataatattcctgttgaattaatccagtgtcgggttaatgaaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttagTTCACGGCATGCCTTTTa < 3:1832532‑M2/18‑1 (MQ=255) tgtgtcagaatcataatattcctgttgaattaatccagtgtcgggttaatgaaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttagTTCACGGCATGCCTTTTAt > 8:311655‑M2/133‑151 (MQ=255) tgtcagaatcataatattcctgttgaattaatccagtgtcgggttaatgaaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttagTTCACGGCATGCCTTTTAttt > 8:1641978‑M2/131‑151 (MQ=255) ggTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTCACGGCATGCCTTTTAt < 1:1093754/148‑1 (MQ=255) cTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTgg > 2:1227645/1‑151 (MQ=255) tGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTggt > 6:1847790/1‑151 (MQ=255) gACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTg < 5:902418/148‑1 (MQ=255) aCGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTggtat < 2:871033/151‑1 (MQ=255) ggCGCTTACTGCTGAATTCTCTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCGTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTGTggtatcg < 6:675783/151‑1 (MQ=255) cataatattcctgttgaattaatccagtgtcgggttaatgaaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttagTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTggtatc < 3:256352‑M2/29‑1 (MQ=255) tgctgAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGa > 7:107751/1‑149 (MQ=255) gctgAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGc < 3:823949/151‑1 (MQ=255) tgaattaatccagtgtcgggttaatgaaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttagTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCAtt < 8:202019‑M2/43‑1 (MQ=255) aaTTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGCTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTa < 6:1776715/151‑1 (MQ=255) aattaatccagtgtcgggttaatgaaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcacccctgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttagTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTAc > 5:1727452‑M2/106‑150 (MQ=255) aattaatccagtgtcgggttaatgaaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttagTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACa < 5:611793‑M2/46‑1 (MQ=255) attaatccagtgtcgggttaatgaaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttatTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACa > 8:1781556‑M2/105‑150 (MQ=255) attaatccagtgtcgggttaatgaaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttagTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACa > 6:1707572‑M2/105‑150 (MQ=255) ttaatccagtgtcgggttaatgaaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttagTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACaa > 1:270461‑M2/104‑150 (MQ=255) cTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACaaaat > 8:1092349/1‑151 (MQ=255) agtgtcgggttaatgaaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcaacactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttacTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTCTTATAGGTATCGAATCATTACaaaaaaaaat > 6:2014731‑M2/97‑151 (MQ=255) gCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAAtt < 1:137665/151‑1 (MQ=255) tgtcgggttaatgaaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttagTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTc > 7:1320918‑M2/95‑151 (MQ=255) ggggttaatgaaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggagatattccgttagTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGa < 8:1898048‑M2/60‑1 (MQ=255) cgggttaatgaaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttagTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGa < 1:1772223‑M2/60‑1 (MQ=255) gTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACt > 3:1390418/1‑151 (MQ=255) aaGTTGATGACTCATGATGACCCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGAGTAt > 7:770877/1‑151 (MQ=255) atgaaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttagTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCtt < 3:1102867‑M2/67‑1 (MQ=255) atgaCTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACa < 1:100839/151‑1 (MQ=255) aaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttagTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTATGACTATCTTAc > 3:1224883‑M2/82‑150 (MQ=255) 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tatatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttagTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCt > 7:1436209‑M2/71‑150 (MQ=255) gaACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATAATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTa < 7:37233/150‑1 (MQ=255) atatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttagTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTa < 1:1200424‑M2/81‑1 (MQ=255) atatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagtttcggcgatattccgttagTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCt < 8:626158‑M2/80‑1 (MQ=255) tatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttagTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATg > 1:471399‑M2/69‑151 (MQ=255) 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tcATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTCACGGCATGCATTTTATTTCTCGTATATCTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTATGACTATCTTACAGGAGTGACCTATGTTTTAAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACATCgcc > 2:261087/1‑149 (MQ=255) gtggatcgtagttttggcgatattccgttagTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGcc < 7:1162337‑M2/120‑1 (MQ=255) cATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGcc > 1:1466549/1‑151 (MQ=255) atatCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGccc > 4:1727083/1‑151 (MQ=255) tatCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTACCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCt > 7:576837/1‑151 (MQ=255) cAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACg > 5:1371617/1‑151 (MQ=255) cAGGGAC‑TGTTCGCACCTTCCTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACgg < 3:482347/151‑1 (MQ=255) cTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGAtg > 4:1234944/1‑151 (MQ=255) tgtcgatattccgttagTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGAtgct < 2:1711941‑M2/133‑1 (MQ=255) tCGCACCTTCCTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGAtgctgc < 1:646996/150‑1 (MQ=255) tattccgttagTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGAtt > 3:1457171‑M2/12‑151 (MQ=255) agcttccttAGTTCACGGCATGCATTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGAtt < 6:1219108/149‑1 (MQ=255) attccgttagTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATTg < 3:315773‑M2/141‑1 (MQ=255) ttccttAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATTGtc > 4:595365/1‑151 (MQ=255) cgttagTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATTGtcat < 2:142438‑M2/145‑1 (MQ=255) ccttAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATTGtca < 8:1441161/150‑1 (MQ=255) gttagTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATTGtcatc > 3:1914278‑M2/6‑151 (MQ=255) gttagTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATTGtcatc > 5:1503519‑M2/6‑151 (MQ=255) ttagTTCACGGCAGGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTGATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATTgtcatg > 8:804672‑M2/5‑149 (MQ=255) tagTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATTGtcatca < 6:1369533‑M2/147‑1 (MQ=255) agTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATTGTcatcat < 7:1216589‑M2/148‑1 (MQ=255) agTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATTGTcatcat > 4:44666‑M2/3‑150 (MQ=255) | GACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATTGTCATCATTAT > DH1/1703551‑1703850 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |