New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 3583428 = | NA (NA) | 314 (0.610) | 184/298 | 1.0 | 51.8% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
? | NC_000913 | = 4542049 | 292 (0.570) | coding (13/597 nt) | fimE | tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA |
Only 100 of 866 total aligned reads displayed.
TATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAGGCCATGATGCAGGCGGTTTGTTACGGGGCAACGGGAGCCAGAGATTATTGTCTTATTCTGTTGGCATATCGGCATGGGATGCGTATTAGTGAACTGCTTGATCTGCATTATCAGGACCTTGACC > NC_000913/4541899‑4542199 | tATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATGTATTGGGCTAATTTTCACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGGGAGTAAActtc > 2:24240/1‑151 (MQ=255) agcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTAAAcgtc < 3:1256337‑M2/8‑1 (MQ=255) gATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCGtt > 4:481019/1‑151 (MQ=255) tatTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCGTTAt > 7:1527407/1‑151 (MQ=255) cataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTAAACGTCGTTAt < 6:1907516‑M2/13‑1 (MQ=255) ttAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCGTTATCt < 2:839980/150‑1 (MQ=255) tAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCGTTATCtt < 8:212771/150‑1 (MQ=255) ctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTAAACGTCGTTATCTTAcc > 4:973165‑M2/133‑151 (MQ=255) aTGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGAGAGTAAACGTCggtgatgctgc > 6:422624‑M2/1‑140 (MQ=255) tgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTAAACGTCGTTATCTTACCg > 5:1584541‑M2/132‑151 (MQ=255) aaTTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCggtgatgctgccaac > 8:1101041‑M2/1‑136 (MQ=255) aaTTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCggtgatgctgccaac < 3:1602315‑M2/151‑16 (MQ=255) ttGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATAAATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTTTGAGTAAACGTCggtcatgctgacaactt < 7:294733‑M2/151‑18 (MQ=255) cTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCggtgatgctgccaacttactg < 2:939674‑M2/151‑22 (MQ=255) cTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCGTTATCTTACCGGTAaaga > 2:1594310/1‑149 (MQ=255) gATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGtt < 4:139563/151‑1 (MQ=255) agcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTAAACGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTc < 7:729281‑M2/32‑1 (MQ=255) aTAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCggtgatgctgccaacttactgatt < 2:669740‑M2/151‑25 (MQ=255) cacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTAAACGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAg < 3:1139741‑M2/34‑1 (MQ=255) aGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCggtgatgctgccaacttactgattta > 7:864025‑M2/1‑125 (MQ=255) aGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTc > 2:1729961/1‑149 (MQ=255) ctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaacTAAACGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAGGcc > 5:940470‑M2/115‑151 (MQ=255) cacaTCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAGGcc > 4:295023/1‑151 (MQ=255) cacaTCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTAACCGATTCAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAGGcc > 5:1883996/1‑151 (MQ=255) acaTCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCcgtgatgctgccaacttactgatttagtgt < 3:1964028‑M2/151‑31 (MQ=255) ggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTAAACGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAGGcc < 4:16508‑M2/37‑1 (MQ=255) aTCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtat < 4:592790‑M2/151‑33 (MQ=255) aTCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtat > 1:60038‑M2/1‑119 (MQ=255) aTCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGCGAGTAAACGTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtat > 7:1335670‑M2/1‑119 (MQ=255) cacggctggcacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtaattaccTAAACGACGTTATCTTAAAGGTAAAGAAGTTCAGGCCatg > 8:1901169‑M2/111‑150 (MQ=255) cACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatg < 8:591761‑M2/150‑34 (MQ=255) cACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTAGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAGGCCatgat > 6:716629/1‑151 (MQ=255) cTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatg < 3:802341‑M2/151‑37 (MQ=255) cTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCGATATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAGGCCATGATGc > 3:1738319/1‑151 (MQ=255) cGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtg < 1:272782‑M2/151‑40 (MQ=255) gtgtgtGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAGGCCATGATGCAggg > 8:517597/1‑150 (MQ=255) gtgtgtGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAGGCCATGATGCAGGc < 1:1782449/151‑1 (MQ=255) gtgtgtGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAGGCCATGATGCAGGc < 1:139816/151‑1 (MQ=255) tgtgtgGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtt < 5:717345‑M2/151‑42 (MQ=255) gtgtgGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAGGCCATGATGCAGGCg < 2:1254858/150‑1 (MQ=255) tgtgGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAGGCCATGATGCAGGCGGt > 4:681216/1‑151 (MQ=255) gtgGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCTGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttt > 3:275334‑M2/1‑107 (MQ=255) gtgGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgttttt < 6:609941‑M2/151‑45 (MQ=255) ggTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttg > 3:405240‑M2/1‑105 (MQ=255) ttATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgagg < 1:1291375‑M2/151‑49 (MQ=255) cgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTAAACGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAGGCCATGATGCAGGCGGTTTGTTACg < 4:1146264‑M2/59‑1 (MQ=255) cgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTAAACGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAGGCCATGATGCAGGCGGTTTGTTACg > 3:994619‑M2/93‑151 (MQ=255) cTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgct < 2:739503‑M2/151‑53 (MQ=255) tttttATCTATTGGGCTAATTTTGTCCGATTGAGGTTTCCTATTGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCGTTATCTTAGCGGTAAAGAAGTTCAGGCCTTGATGCAGGCGGTTTGTTACgg < 8:1257591/150‑1 (MQ=255) gtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTAAACGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAGGCCATGATGCAGGCGGTTTGTTACGGGGc < 6:1302996‑M2/63‑1 (MQ=255) cgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTAAACGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAGGCCATGATGCAGGCGGTTTGTTACGGGGCa < 5:371924‑M2/64‑1 (MQ=255) ctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTAAACGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAGGCCATGATGCAGGCGGTTTGTTACGGGGCAACggg > 4:853879‑M2/83‑151 (MQ=255) aTTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggct > 8:1401204‑M2/1‑89 (MQ=255) aTTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAGGCCATGATGCAGGCGGTTTGTTACGGGGCAACGGGa < 1:100206/151‑1 (MQ=255) caaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTAAACGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAGGCCATGATGCAGGCGGTTTGTTACGGGGCAACGGGa < 1:1858645‑M2/70‑1 (MQ=255) gggCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctg > 8:708756‑M2/1‑86 (MQ=255) aaTTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAGGCCATGATGCAGGCGGTTTGTTACGGGGCAACGGGAGCCagag < 4:1939823/150‑1 (MQ=255) aTTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttct < 5:1131237‑M2/150‑71 (MQ=255) tggatctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaatacgttggagtcattaccTAAACGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAGGCCATGATGCAGGCGGTTTGTTACGGGGCAACGGGAGCCAGAGat < 2:1083924‑M2/79‑1 (MQ=255) ggagctgcatgacaaagtcatctggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTAAACGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAGTCCATGATGCAGGCGGTTTGTTACGGGGCAACTGGAGCCAGAGatt < 1:166665‑M2/80‑1 (MQ=255) ttGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTGAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAGGCCATGATGCAGGCGGTTTGTTACGGGGCAACGGGAGCCAGAGatta < 8:323810/150‑1 (MQ=255) tGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAGGCCATGATGCAGGCGGTTTGTTACGGGGCAACGGGAGCCAGAGattat < 6:254768/150‑1 (MQ=255) tGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAGGCCATGATGCAGGCGGTTTGTTACGGGGCAACGGGAGCCAGAGattat < 3:682298/150‑1 (MQ=255) gctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTAAACGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAGGCCATGATGCAGGCGGTTTGTTACGGGGCAACGGGAGCCAGAGATTATTg > 1:738261‑M2/68‑151 (MQ=255) ccGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtaagatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctg < 3:556468‑M2/151‑79 (MQ=255) tgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTAAACGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAGGCCATGATGCAGGCGGTTTGTTACGGGGCAACGGGAGCCAGAGATTATTGTCTTAt > 2:415013‑M2/62‑151 (MQ=255) gacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTAAACGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAGGCCATGATGCAGGCGGTTTGTTACGGGGCAACGGGAGCCAGAGATTATTGTCTTAtt > 5:1410327‑M2/61‑151 (MQ=255) gAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAGGCCATGATGCAGGCGGTTTGTTACGGGGCAACGGGAGCCAGAGATTATTGTCTTAtt < 4:1310133/150‑1 (MQ=255) gTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctg > 3:1446012‑M2/1‑64 (MQ=255) tttCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAGGCCATGATGCAGGCGGTTTGTTACGGGGCAACGGGAGCCAGAGATTATTGTCTTATTCTGtt > 5:844685/1‑151 (MQ=255) ttCCTATAGTTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgt > 7:954506‑M2/1‑62 (MQ=255) cTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttc < 7:1665682‑M2/149‑91 (MQ=255) ataGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagct > 8:1705484‑M2/1‑57 (MQ=255) attcattcAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCggtgatgctgccaacttacttatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactga > 2:1931201‑M2/1‑51 (MQ=255) ttcattcaAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAGGCCATGATGCAGGCGGTTTGTTACGGGGCAACGGGAGCCAGAGATTATTGTCTTATTCTGTTGGCATATCGGCAt > 7:1175955/1‑151 (MQ=255) ttcaAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggt < 7:1792443‑M2/151‑106 (MQ=255) ttcaAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAGGCCATGATGCAGGCGGTTTGTTACGGGGCAACGGGAGCCAGAGATTATTGTCTTATTCTGTTGGCATATCGGCATggg > 1:10850/1‑150 (MQ=255) ttcaAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAGGCCATGATGCAGGCGGTTTGTTACGGGGCAACGGGAGCCAGAGATTATTGTCTTATTCTGTTGGCACATCGGCATggg > 7:615363/1‑150 (MQ=255) aacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTAAACGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAGGCCATGATGCAGGCGGTTTGTTACGGGGCAACGGGAGCCAGAGATTATTGTCTTATTCTTTTGGCATATCGGCATGGGATg < 4:389410‑M2/115‑1 (MQ=255) aaTATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAGGCCATGATGCAGGCGGTTTGTTACGGGGCAACGGGAGCCAGATATTATTGTCTTATTCTGTTGGCATATCGGCATGGGATGCg < 6:1617723/151‑1 (MQ=255) atatCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgt < 4:1830576‑M2/151‑113 (MQ=255) atCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgta < 7:1999950‑M2/150‑114 (MQ=255) cAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAGGCCATGATGCAGGCGGTTTGTTACGGGGCAACGGGAGCCAGAGATTATTGTCTTATTCTGTTGGCATATCGGCATGGGATGCGTATTAg < 2:1378968/148‑1 (MQ=255) cAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAGGCCATGATGCAGGCGGTTTGTTACGGGGCAACGGGAGCCAGAGATTATTGTCTTATTCTGTTGGCATATCGGCATGGGATGCGTATTAGTg > 6:1543908/1‑150 (MQ=255) tcaataagttggagtcattaccTAAACGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAGGCCATGATGCAGGCGGTTTGTTACGGGGCAACGGGAGCCAGAGATTATTGTCTTATTCTGTTGGCATATCGGCATGGGATGCGTATTAGTGAACt > 7:407263‑M2/23‑151 (MQ=255) caataagttggagtcattaccTAAACGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAGGCCATGATGCAGGCGGTTTGTTACGGGGCAACGGGAGCCAGAGATTATTGTCTTATTCTGTTGGCATATCGGCATGGGATGCGTATTAGCGAACt < 1:1571899‑M2/129‑1 (MQ=255) aGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaa > 6:175239‑M2/1‑28 (MQ=255) aGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaa < 7:1077423‑M2/149‑122 (MQ=255) tactaTTGTGAGTAAACGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAGGCCATGATGCAGGCGGTTTGTTACGGGGCAACGGGAGCCAGAGATTATTGTCTTATTCTGTTGGCATATCGGCATGGGATGCGTATTAGTGAACTGCTTGATCTg > 5:1786235/1‑151 (MQ=255) aTTGTGAGTAAACGTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggac > 5:2003397‑M2/1‑16 (MQ=255) cattaccTAAACGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAGGCCATGATGCAGGCGGTTTGTTACGGGGCAACGGGAGCCAGAGATTATTGTCTTATTCTGTTGGCATATCGGCATGGGATGCGTATTAGTGAACTGCTTGATCTGCAtt > 8:1606953‑M2/8‑150 (MQ=255) gtgAGTAAACGTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatca > 6:1087812‑M2/1‑13 (MQ=255) taccTAAACGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAGGCCATGATGCAGGCGGTTTGTTACGGGGCAACGGGAGCCAGAGATTATTGTCTTATTCTGTTGGCATATCGGCATGGGATGCGTATTAGTGAACTGCTTGATCTGCATTATc < 5:1229812‑M2/146‑1 (MQ=255) tAAACGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTGAGGCCATGATGCAGGCGGTTTGTTACGGGGCATCGGGAGCCAGAGATTATTGTCTTATTCTGTTGGGATATCGGCATGGGATGCGTATTAGTGAACTGCTTGATCTGCATTATCAGga < 8:899377/150‑1 (MQ=255) aaaCGTCggtgatgctgccaactttctgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagggcta > 1:196381‑M2/1‑7 (MQ=255) aaaCGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAGGCCATGATGCAGGCGGTTTGTTACGGGGCAACGGGAGCCAGAGATTATTGTCTTATTCTGTTGGCATATCGGCATGGGATGCGTATTAGTGAACTGCTTGATCTGCATTATCAGgacc > 1:427636/1‑151 (MQ=255) aaaCGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAGGCCATGATGCAGGCGGTTTGTTACGGGGCAACGGGAGCCAGAGATTATTGTCTTATTCTGTTGGCATATCGGCATGGGATGCGTATTAGTGAACTGCTTGATCTGCATTATCAGgac < 1:923894/150‑1 (MQ=255) cgtcgtTATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAGGCCATGATGCAGGCGGTTTGTTACGGGGCAACGGGAGCCAGAGATTATTGTCTTATTCTGTTGGCATATCGGCATGGGATGCGTATTAGTGAACTGCTTGATCTGCATTATCAGgaccttg > 5:1491137/1‑151 (MQ=255) cGTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatct > 4:1556074‑M2/1‑4 (MQ=255) cgtTATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAGGCCATGATGCAGGCGGTTTGTTACGGGGCAACGGGAGCCAGAGATTATTGTCTTATTCTGTTGGCATATCGGCATGGGATGCGTATTAGTGAACTGCTTGATCTGCATTATCAGgaccttgac < 5:484061/150‑1 (MQ=255) | TATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAGGCCATGATGCAGGCGGTTTGTTACGGGGCAACGGGAGCCAGAGATTATTGTCTTATTCTGTTGGCATATCGGCATGGGATGCGTATTAGTGAACTGCTTGATCTGCATTATCAGGACCTTGACC > NC_000913/4541899‑4542199 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |