| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,673,557 | Δ120 bp | intergenic (‑56/‑237) | mdtJ ← / → tqsA | multidrug efflux system transporter/pheromone AI‑2 transporter |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1673557 | 1673676 | 120 | 450 [0] | [0] 451 | mdtJ/tqsA | multidrug efflux system transporter/pheromone AI‑2 transporter |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1673556 | 0 (0.000) | 443 (1.110) | 223/296 | 0.0 | 100% | intergenic (‑55/‑357) | mdtJ/tqsA | multidrug efflux system transporter/pheromone AI‑2 transporter |
| ? | NC_000913 | 1673677 = | 0 (0.000) | intergenic (‑176/‑236) | mdtJ/tqsA | multidrug efflux system transporter/pheromone AI‑2 transporter | |||||
Only 100 of 450 total aligned reads displayed.
GCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAAGTAAAGTGGTCAAGCCCCGCGCATAGCGCAAGCTTTGGCAGAAGAAAGGACTAAAGCGCGTTGCGCCAGTGCTGCTCACCTACGAGCAAGATAGTGGATGAGGTACGAAGATGGGTAAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATT > NC_000913/1673406‑1673703 | aTTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgt > 5:430697‑M1/1‑148 (MQ=255) aTTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgt < 7:1484133‑M1/151‑4 (MQ=255) ttCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgt > 3:1435917‑M1/1‑146 (MQ=255) ttCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATCCAGCGAAACCAAtgta < 8:1395347‑M1/150‑5 (MQ=255) tCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtag < 7:905362‑M1/150‑6 (MQ=255) tCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtct > 6:1539555‑M1/1‑145 (MQ=255) tGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataact > 4:993067‑M1/1‑137 (MQ=255) gACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCAGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataac < 5:477419‑M1/149‑14 (MQ=255) ccgCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtc < 3:1199363‑M1/150‑17 (MQ=255) aCGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtc < 1:1056384‑M1/151‑17 (MQ=255) cTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctg > 2:1394796‑M1/1‑132 (MQ=255) ctcccatTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctg < 4:1207575‑M1/147‑20 (MQ=255) cccATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaaca < 4:493091‑M1/151‑24 (MQ=255) aTTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaat < 5:294953‑M1/151‑27 (MQ=255) ttCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctaaacaaatt < 7:187520‑M1/150‑28 (MQ=255) tCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCATTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtactgaacaaattgt > 8:907350‑M1/1‑122 (MQ=255) tCATTGACAGATTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACGAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattg < 8:1489292‑M1/150‑29 (MQ=255) tGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtcca < 8:161733‑M1/150‑33 (MQ=255) gACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccata < 4:1131082‑M1/151‑35 (MQ=255) aCAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataa < 5:224336‑M1/151‑36 (MQ=255) aGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataata < 7:389227‑M1/151‑38 (MQ=255) aGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataata < 1:682307‑M1/151‑38 (MQ=255) gCGTACCGTTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatat < 1:445551‑M1/151‑39 (MQ=255) cGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatatt < 5:630585‑M1/151‑40 (MQ=255) aCCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattac > 7:287240‑M1/1‑109 (MQ=255) aCCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattac < 5:1498336‑M1/150‑42 (MQ=255) aCCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattac > 8:738509‑M1/1‑109 (MQ=255) aCCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattac > 3:942703‑M1/1‑109 (MQ=255) cGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaat > 7:1137065‑M1/1‑107 (MQ=255) gTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaatt > 6:1198108‑M1/1‑105 (MQ=255) aaTTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatc < 1:728777‑M1/151‑49 (MQ=255) aTTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatcc < 8:675141‑M1/151‑50 (MQ=255) tGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagt > 6:223180‑M1/1‑97 (MQ=255) tGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagt > 4:1473684‑M1/1‑97 (MQ=255) gTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGATAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgca < 2:1296387‑M1/148‑53 (MQ=255) gTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcag < 6:131385‑M1/149‑54 (MQ=255) gTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcag < 1:905967‑M1/149‑54 (MQ=255) tAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtg < 6:458042‑M1/150‑56 (MQ=255) gCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttg > 7:480550‑M1/1‑93 (MQ=255) cAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgc > 3:159321‑M1/1‑92 (MQ=255) aaaagcaatacctaataaaATCAAAT‑AATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgctt < 5:1287423‑M1/142‑62 (MQ=255) aTAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatcagcagtgttgctt > 5:136369‑M1/1‑90 (MQ=255) tAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttc > 5:860332‑M1/1‑89 (MQ=255) tAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttc > 8:426152‑M1/1‑89 (MQ=255) aGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttct > 6:1027969‑M1/1‑88 (MQ=255) aGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttc < 4:1573581‑M1/150‑63 (MQ=255) aGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtc < 4:280064‑M1/151‑68 (MQ=255) ccTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatc > 5:370234‑M1/1‑81 (MQ=255) ccTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatc < 4:799491‑M1/151‑71 (MQ=255) taataaAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgc > 2:783019‑M1/1‑79 (MQ=255) aataaAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcg < 4:954807‑M1/149‑72 (MQ=255) aataaAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcg < 1:1008730‑M1/149‑72 (MQ=255) ataaAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcgg < 4:1051452‑M1/151‑75 (MQ=255) taaAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcgg > 8:1016359‑M1/1‑76 (MQ=255) aaaaTCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcgga < 3:452839‑M1/150‑76 (MQ=255) aaTCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaactaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttgtcgtcttcgcggatga < 4:533475‑M1/151‑79 (MQ=255) aTCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatcggcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgat > 2:1087251‑M1/1‑72 (MQ=255) aTCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgat > 2:869401‑M1/1‑72 (MQ=255) ccAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgata < 5:789762‑M1/150‑81 (MQ=255) ccAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgata > 4:383363‑M1/1‑70 (MQ=255) cAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataat < 5:1091619‑M1/151‑83 (MQ=255) aaataTACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtc < 6:1075099‑M1/151‑87 (MQ=255) atatACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcct < 1:1463933‑M1/151‑89 (MQ=255) aTTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCTCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtag < 6:304097‑M1/151‑95 (MQ=255) gTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttg < 7:1310927‑M1/151‑98 (MQ=255) ccTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttga < 6:655112‑M1/150‑99 (MQ=255) cTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaac > 8:807278‑M1/1‑51 (MQ=255) ccTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacac < 8:1075229‑M1/148‑103 (MQ=255) ccTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcgcatgataattgtcctcggtagtagaacacgcc > 3:798374‑M1/1‑46 (MQ=255) cTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcct > 6:795423‑M1/1‑45 (MQ=255) agagAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgattt > 2:537924‑M1/1‑40 (MQ=255) agaATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgt < 2:258210‑M1/151‑114 (MQ=255) gaATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgatagttgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgt > 6:1422635‑M1/1‑37 (MQ=255) aaTTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgttaattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtat < 3:240105‑M1/151‑116 (MQ=255) tattTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcat > 7:1016310‑M1/1‑33 (MQ=255) attTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcat < 1:1222841‑M1/150‑119 (MQ=255) attTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcat < 6:907766‑M1/150‑119 (MQ=255) attTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcat < 7:577840‑M1/150‑119 (MQ=255) ttttAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcat > 3:613124‑M1/1‑31 (MQ=255) tttAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatag < 2:985795‑M1/150‑121 (MQ=255) aaTTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataccgtcctgaacaaattggccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagctt < 8:131132‑M1/150‑124 (MQ=255) aTTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattctccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtaggtgaacacgcctgatttgtctcatagcttaa < 3:1048268‑M1/151‑126 (MQ=255) ttCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtcgataatatttcaattatccgcactgttgcttctcgtcatcccggatgataaatgtcctcggtagttgaacacgcctgaattgtatcatagctaaaga > 1:1264042‑M1/1‑23 (MQ=255) ttCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaaga < 8:300956‑M1/150‑128 (MQ=255) ttCGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaaga < 2:635295‑M1/150‑128 (MQ=255) cGCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaatt > 6:393553‑M1/1‑21 (MQ=255) gCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaatta < 3:1382606‑M1/151‑132 (MQ=255) gCTTAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaatta < 5:566764‑M1/151‑132 (MQ=255) tAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaact > 7:690709‑M1/1‑17 (MQ=255) tAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaact > 7:1221217‑M1/1‑17 (MQ=255) tAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaac < 4:226137‑M1/150‑134 (MQ=255) tAATTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaa < 1:356628‑M1/149‑133 (MQ=255) aTTCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactc > 2:317770‑M1/1‑15 (MQ=255) ttCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaagtca > 1:288167‑M1/1‑14 (MQ=255) tCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaa < 6:181311‑M1/150‑138 (MQ=255) tCAGCGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaa < 6:732604‑M1/150‑138 (MQ=255) cGAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatat < 5:1166544‑M1/151‑143 (MQ=255) gAAACCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatatt < 2:429485‑M1/151‑144 (MQ=255) aaCCAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattgtccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatatttt < 3:758351‑M1/151‑146 (MQ=255) ccAAtgtagaaaataacgtcctgaacaaattggccataatattacaattatccgcagtgttgcttctcgtcatcgcggatgataattgtcctcggtagttgaacacgcctgatttgtatcatagcttaagaattaactcaaaatattttca < 7:829155‑M1/151‑148 (MQ=255) | GCCATTTCCCTCACTGACGCTCGCCCATTTCATTGACAGCGTACCGGTAATTTCTGTAGCAATAGCCAGACCTAATAAAATCCAATAAATATACATTGTCCTTCTCCTGCAAGAGAATTATTTTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAAGTAAAGTGGTCAAGCCCCGCGCATAGCGCAAGCTTTGGCAGAAGAAAGGACTAAAGCGCGTTGCGCCAGTGCTGCTCACCTACGAGCAAGATAGTGGATGAGGTACGAAGATGGGTAAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATT > NC_000913/1673406‑1673703 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |