| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 295,082 | IS5 (–) +4 bp | intergenic (‑283/+54) | yagM ← / ← yagN | CP4‑6 prophage; uncharacterized protein/CP4‑6 prophage; uncharacterized protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 273955 = | NA (NA) | 465 (1.100) | 203/300 | 0.2 | 96.0% | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region |
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| * | ? | NC_000913 | = 275149 | NA (NA) | 442 (1.050) | 225/300 | 0.0 | 95.8% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 295082 = | 19 (0.050) | intergenic (‑283/+57) | yagM/yagN | CP4‑6 prophage; uncharacterized protein/CP4‑6 prophage; uncharacterized protein | |||||
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GTACAGAAAATGTATCTATAAAATCGAGGACATCTTTACGTAACCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTGAATGCGCTCATTTTGCCACCTCAGTGATTGAGATATTGGCAAAGAAAGCTTTAAGCATTATTGAATTAGTAGGGGTAGTAATGAAGGCAGAAGGAAACGTT > NC_000913/294932‑295232 | ggacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTa < 5:523995‑M2/3‑1 (MQ=255) aGAAAATGTATCTATAAAATCGAGGACATCTTTACGTAACCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAAg > 6:482827‑M2/1‑150 (MQ=255) acaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAACTc > 5:1435823‑M2/145‑151 (MQ=255) aTGTATCTATAAAATCGAGGACATCTTTACGTAACCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAAggaagg > 1:801430‑M2/1‑145 (MQ=255) aaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAACTCAGCTg > 6:685470‑M2/140‑151 (MQ=255) tATCTATAAAATCGAGGACATCTTTACGTAACCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAAggaaggtgc < 6:1140443‑M2/151‑10 (MQ=255) tATCTATAAAATCGAGGACATCTTTACGTAACCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAAggaaggtgc < 4:923709‑M2/151‑10 (MQ=255) aaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAACTCAGCTGt < 3:89103‑M2/13‑1 (MQ=255) 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aTCGAGGACATCTTTACGTAACCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAAggaaggtgcgaataagcgg < 5:822615‑M2/151‑20 (MQ=255) cGAGGACATCTTTACGTAACCAGTAATCCCGGCCATTGATTTGTTTTCGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATATGTCCTGACAAAGCCATATACGAATGGTTTGAGATTTCTAGCTAATCATTTTAGCTAAggaaggtgcgaataagcgggg < 2:28368‑M2/151‑22 (MQ=255) ggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCtg < 2:613590‑M2/25‑1 (MQ=255) gAGGACATCTTTACGTAACCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAAggaaggtgcgaataagcgggga > 7:645633‑M2/1‑129 (MQ=255) aGGACATCTTTACGTAACCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAAggaaggtgcgaataagcgggga < 3:729337‑M2/150‑23 (MQ=255) aGGACATCTTTACGTAACCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAAggaaggtgcgaataagcgggga < 2:972292‑M2/150‑23 (MQ=255) gcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTg > 5:231331‑M2/117‑147 (MQ=255) ttACGTAACCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattctt > 7:957142‑M2/1‑119 (MQ=255) tACGTAACCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGt > 8:369849/1‑151 (MQ=255) cGTAACCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggc < 7:1334440‑M2/151‑36 (MQ=255) gTAACCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggct < 8:726808‑M2/151‑37 (MQ=255) tAACCAGTAATGGCGGGCAATGATATGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTGCTGACAAAGCCATTTACGAAAGGTTTGAGATTTTTAGCTAATGATTTTACCTAAggaaggtgcgaataagcgcggaaaatcttctcggctg < 6:1273558‑M2/151‑38 (MQ=255) tAACAAGTAATGGCGGCCATTTATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCATGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGATAAgtaatgttagaataagagggtaaattcttatctgctg < 1:1611311‑M2/151‑38 (MQ=255) atgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCg < 7:298786‑M2/42‑1 (MQ=255) aaCCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctg > 3:557776‑M2/1‑113 (MQ=255) 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cactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTGa > 1:972909‑M2/100‑150 (MQ=255) cggcCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttc > 5:585583‑M2/1‑101 (MQ=255) ccATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatt < 3:1031668‑M2/151‑54 (MQ=255) cggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTGAATgcgc < 7:1611142‑M2/57‑1 (MQ=255) aaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTGAATGCGCTCAttt < 5:1563890‑M2/63‑1 (MQ=255) 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gCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatccccagttt > 7:901559‑M2/1‑5 (MQ=255) cCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTGAATGCGCTCATTTTGCCACCTCAGTGATTGAGATATTGGCAAAGAAAGCTTTAAGCATTATTGAATTAGTAGGGGTAGTAATGAAGGCAGAAGGAAACGt < 3:1256190‑M2/150‑1 (MQ=255) | GTACAGAAAATGTATCTATAAAATCGAGGACATCTTTACGTAACCAGTAATGGCGGCCATTGATTTGTTTTGGGCGAGGTAGCCCCTCAGGCAATTTGTCCTGACAAAGCCATTTACGAATGGTTTGAGATTTGTAGCTAATGATTTTAGCTAACTCAGCTGTTGAAATGAGCTGTGATTGAGATGTATCCGGGAGTTTGAATGCGCTCATTTTGCCACCTCAGTGATTGAGATATTGGCAAAGAAAGCTTTAAGCATTATTGAATTAGTAGGGGTAGTAATGAAGGCAGAAGGAAACGTT > NC_000913/294932‑295232 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |