Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 1,199,869 | IS3 (+) +3 bp | coding (936‑938/1128 nt) | intE ← | e14 prophage; putative integrase |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1094245 = | NA (NA) | 355 (0.840) | 204/300 | 0.1 | 96.1% | noncoding (1258/1258 nt) | IS3 | repeat region |
? | NC_000913 | 1199869 = | 14 (0.030) | coding (938/1128 nt) | intE | e14 prophage; putative integrase | |||||
* | ? | NC_000913 | = 1095502 | NA (NA) | 420 (1.000) | 218/298 | 0.0 | 96.7% | noncoding (1/1258 nt) | IS3 | repeat region |
? | NC_000913 | = 1199871 | 14 (0.030) | coding (936/1128 nt) | intE | e14 prophage; putative integrase |
Only 100 of 790 total aligned reads displayed.
TAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGCAGGTGAACCCTCTCCCCAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTTTACTAAAATTCATCGTCAATGTATTGGCTTTAACCTGCGCTCCGCGCTCTGCTTGTGAAGTTGAACGAAAAAAATGCACTAAGTATGCACTGACTGCATAGTCACGGCAGCGGGCTACTACATCGCGTAAACTCCAGTTAATCGCATTG > NC_000913/1199722‑1200021 | tAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGCAGGTGAACCCTCTCCCCAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTt < 2:494159‑M2/151‑2 (MQ=255) aaataatgcgggcaacggtgtttaattatatcgaatgtgattacaatcggtggcggcggcacagttggtgtggcggcctcagtccggaacaatttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaGCttt > 5:1580770‑M2/147‑151 (MQ=255) aaataatgcgggcaacggtgtttaattatatcgaatgtgattacaatcggtggcggcggcacagttggtgtggcggcctcagtccggaacaatttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaGCttt > 7:529258‑M2/147‑151 (MQ=255) aaCGTTCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGCAGGTGAACCCTCTCCCCAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTtg < 1:431893‑M2/151‑3 (MQ=255) aaCGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATATAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGCAGGTGAACCCTCTCCCCAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTtg > 2:581535‑M2/1‑149 (MQ=255) aataatgcgggcaacggtgtttaattatatcgaatgtgattacaatcggtggcggcggcacagttggtgtggcggcctcagtccggaacaatttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaGCttt > 6:13241‑M2/146‑150 (MQ=255) gATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGCAGGTGAACCCTCTCCCCAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTtgatc < 6:51019‑M2/151‑6 (MQ=255) aatgcgggcaacggtgtttaattatatcgaatgtgattacaatcggtggcggcggcacagttggtgtggcggcctcagtccggaacaatttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaGCTTTACt > 8:736242‑M2/143‑150 (MQ=255) aTCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGCAGGTGAACCCTCTCCCCAGTCAAATCTTGCTAAATCTCTCGCTtgatct < 2:912669‑M2/151‑7 (MQ=255) cGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGCAGGTGAACCCTCTCCCCAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTtgatctta > 4:361393‑M2/1‑143 (MQ=255) ttgttgttgTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGCAGGTGAACCCTCTCCCCAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTtgatcttaccc < 7:1266046‑M2/150‑12 (MQ=255) aacggtgtttaattatatcgaatgtgattacaatcggtggcggcggcacagttggtgtggcggcctcagtccggaacaatttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaGCTTTACTAAAATTCATc > 3:197453‑M2/134‑151 (MQ=255) tgttgtGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGCAGGTGAACCCTCTCCCCAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTtgatcttacccagca > 3:403632‑M2/1‑135 (MQ=255) cggtgtttaattatatcgaatgtgattacaatcggtggcggcgacacagttggtgtggcggcctcagtccggaacaatttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaGCTTTACTAAAATTCATCGt < 8:1148873‑M2/20‑1 (MQ=255) ttgtGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGCAGGTGAACCCTCTCCCCAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCCCTtgatcttacccagcaat < 4:1151433‑M2/150‑18 (MQ=255) ggtgtttaattatatcgaatgtgattacaatcggtggcggcggcacagttggtgtggcggcctcagtccggaacaatttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaGCTTTACTAAAATTCATCGTc < 8:296850‑M2/21‑1 (MQ=255) tttaattatatcgaatgtgattacaatcggtggcggcggcacagttggtgtggcggcctcagtccggaacaatttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaGCTTTACTAAAATTCATCGTCAATg > 4:493549‑M2/127‑151 (MQ=255) gtTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGCAGGTGAACCCTCTCCCCAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTtgatcttacccagcaatagtgg < 5:710336‑M2/151‑23 (MQ=255) ttttATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGCAGGTGAACCCTCTCCCCAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTtgatcttacccagcaatagtgg < 7:607676‑M2/150‑23 (MQ=255) ttaattatatcgaatgtgattacaatcggtggcggcggcacagttggtgtggcggcctcagtccggaacaatttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaGCTTTACTAAAATTCATCGTCAATGt > 4:825154‑M2/126‑151 (MQ=255) taattatatcgaatgtgattacaatcggtggcggcggcacagttggtgtggcggcctcagtccggaacaatttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaGCTTTACTAAAATTCATCGTCAATGt > 2:1267495‑M2/125‑150 (MQ=255) ttATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGCAGGTGAACCCTCTCCCCAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTtgatcttacccagcaatagtggacc < 1:656042‑M2/151‑26 (MQ=255) aTGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGCAGGTGAACCCTCTCCCCAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTtgatcttacccagcaatagtggacacg < 2:685424‑M2/151‑28 (MQ=255) aTGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGCAGGTGAACCCTCTCCCCAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTtgatcttacccagcaatagtggacacg > 7:203829‑M2/1‑124 (MQ=255) aTGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGCAGGTGAACCCGCTCCCCAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTtgatcttacccagcaatagtggacacg > 4:1487304‑M2/1‑124 (MQ=255) tatcgaatgtgattacaatcggtggcggcggcacagttggtgtggcggcctcagtccggaacaatttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaGCTTTACTAAAATTCATAGTCAATCTATTGACt > 6:1586657‑M2/119‑151 (MQ=255) aCCAGGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGCAGGTGAACCCTCTCCCCAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTtgatcttacccagcaatagtggacacgcgg > 5:343486‑M2/1‑121 (MQ=255) aCCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGCAGGTGAACCCTCTCCCCAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTtgatcttacccagcaatagtggacacgcgg < 3:968690‑M2/151‑31 (MQ=255) atcgaatgtgattacaatcggtggcggcggcacagttggtgtggcggcctcagtccggaacaatttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaGCTTTACTAAAATTCATCGTCAATGTATTGGCtt < 2:1654503‑M2/34‑1 (MQ=255) cgaatgtgattacaatcggtggcggcggcacagttggtgtggcggcctcagtccggaacaatttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaGCTTTAATAAAATTCATCGTCAATGtattggatat > 8:1013597‑M2/116‑146 (MQ=255) aaGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATTTCGCAGGTGAACCCTCTCCCCAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggct < 5:1380833‑M2/150‑33 (MQ=255) agtagtTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGCAGGTGAACCCTCTCCCCAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaa > 1:1494443‑M2/1‑117 (MQ=255) gtagtTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGCAGGTGAACCCTCTCCCCAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggcta < 1:862056‑M2/149‑34 (MQ=255) tttGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGCAGGTGAACCCTCTCCCCAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagt > 8:1705528‑M2/1‑110 (MQ=255) tgtgtgTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGCAGGTGAACCCTCTCCCCAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaa < 7:818905‑M2/150‑43 (MQ=255) gtggcggcggcacaggtggtgtggcggcctcagtccggaacaatttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaGCTTTACTAAAATTCATCGTCAATGTATTGGCTTTAACCTGCGCTCCGCGctct < 4:1276933‑M2/54‑1 (MQ=255) aaCCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGCAGGTGAACCCTCTCCCCAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtc > 7:1602483‑M2/1‑99 (MQ=255) cggcggcacagttggtgtggcggcctcagtccggaacaatttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaGCTTTACTAAAATTCATCGTCAATGTATTGGCTTTAACCTGCGCTCCGCGCTCTGCtt < 7:1615435‑M2/58‑1 (MQ=255) gcggcacagttggtgtggcggcctcagtccggaacaatttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaGCTTTACTAAAATTCATCGTCAATGTATTGGCTTTAACCTGCGCTCCGCGCTCTGCTtgt < 6:12671‑M2/60‑1 (MQ=255) gTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGCAGGTGAACCCTCTCCCCAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggtg < 6:414237‑M2/151‑60 (MQ=255) gTTCTTTATACAGACGTGCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGCAGGTGAACCCTCTCCCCAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggt > 1:754248‑M2/1‑92 (MQ=255) gcacagttggtgtggcggcctcagtccggaacaatttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaGCTTTACTAAAATTCATCGTCAATGTATTGGCTTTAACCTGCGCTCCGCGCTCTGCTTGTGaa < 1:1623247‑M2/63‑1 (MQ=255) cTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGCAGGTGAACCCTCTCCCCAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggtgact < 6:681321‑M2/151‑63 (MQ=255) ataCAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGCAGGTGCACCCTCTCCCCAGGCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggcaaagtcagtaaactctcagtcagaggagcatcac < 3:322048‑M2/150‑66 (MQ=255) ataCAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGCAGGTGAACCCTCTCCCCAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggtgactcac < 7:436118‑M2/150‑66 (MQ=255) ataCAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGCAGGTGAACCCTCTCCCCAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggtgactcac < 8:137564‑M2/150‑66 (MQ=255) tggtgtggcggcctcagtccggaacaatttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaGCTTTACTAAAATTCATCGTCAATGTATTGGCTTTAACCTGCGCTCCGCGCTCTGCTTGTGAAGTTGAAc > 3:559475‑M2/82‑151 (MQ=255) aCAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGCAGGTGAACCCTCTCCCCAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggtgactcacatg > 3:1601103‑M2/1‑83 (MQ=255) aGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGCAGGTGAACCCTCTCCCCAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggtgactcacatgac < 4:1073425‑M2/151‑71 (MQ=255) aCGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGCAGGTGAACCCTCTCCCCAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggtgactcacatgacaa > 6:1440086‑M2/1‑79 (MQ=255) cGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGCAGGTGAACCCTCTCCCCAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggtgactcacatgacaaa > 7:888789‑M2/1‑78 (MQ=255) ttCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGCAGGTGAACCCTCTCCCCAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggtgactcacatgacaaaa < 1:1021161‑M2/150‑75 (MQ=255) ttCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGCAGGTGAACCCTCTCCCCAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggtgactcacatgacaaaa < 5:1503667‑M2/150‑75 (MQ=255) ggcctcagtccggaacaatttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaGCTTTACTAAAATTCATCGTCAATGTATTGGCTTTAACCTGCGCTCCGCGCTCTGCTTGTGAAGTTGAACGAAAAAAAt > 4:16289‑M2/73‑151 (MQ=255) gtccggaacaatttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaGCTTTACTAAAATTCATCGTCAATGTATTGGCTTTAACCTGCGCTCCGCGCTCTGCTTGTGAAGTTGAACGAAAAAAATGCACTa > 1:1141527‑M2/66‑150 (MQ=255) gtccggaacaatttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaGCTTTACTAAAATTCATCGTCAATGTATTGGCTTTAACCTGCGCTCCGCGCTCTGCTTGTGAAGTTGAACGAAAAAAATGCACTa > 7:336813‑M2/66‑150 (MQ=255) ggaacaatttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaGCTTTACTAAAATTCATCGTCAATGTATTGGCTTTAACCTGCGCTCCGCGCTCTGCTTGTGAAGTTGAACGAAAAAAATGCACTAAGTAt < 2:1389001‑M2/90‑1 (MQ=255) ccTTTGCTCATGGAATGTCGCAGGTGAACCCTCTCCCCAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggtgactcacatgacaaaaacagtatcaacc < 4:5995‑M2/150‑87 (MQ=255) ttGCTCATGGAATGTCGCAGGTGAACCCTCTCCCCAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggtgactcacatgacaaaaacagtatcaaccagt > 5:799854‑M2/1‑61 (MQ=255) acaatttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaGCTTTACTAAAATTCATCGTCAATGTATTGGCTTTAACCTGCGCTCCGCGCTCTGCTTGTGAAGTTGAACGAAAAAAATGCACTAAGTATGCa < 3:1142350‑M2/93‑1 (MQ=255) cTCATGGAATGTCGCAGGTGAACCCTCTCCCCAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggtcactcacatgacaaaaacagtatcaaccagtaaa < 4:696391‑M2/150‑93 (MQ=255) tttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaGCTTTACTAAAATTCATCGTCAATGTATTGGCTTTAACCTGCGCTCCGCGCTCTGCTTGTGAAGTTGAACGAAAAAAATGCACTAAGTATGCactg > 8:1253730‑M2/55‑150 (MQ=255) ggAATGTCGCAGGTGAACCCTCTCCCCAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggtgactcacatgacaaaaacagtatcaaccagtaaaaaaccc < 7:1161768‑M2/151‑99 (MQ=255) ggAATGTCGCAGGTGAACCCTCTCCCCAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggtgactcacatgacaaaaacagtatcaaccagtaaaaaacc > 5:204348‑M2/1‑53 (MQ=255) aaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaGCTTTACTAAAATTCATCGTCAATGTATTGGCTTTAACCTGCGCTCCGCGCTCTGCTTGTGAAGTTGAACGAAAAAAATGCACTAAGTATGCACTGACTGc > 4:1365651‑M2/50‑150 (MQ=255) acaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaGCTTTACTAAAATTCATCGTCAATGTATTGGCTTTAACCTGCGCTCCGCGCTCTGCTTGTGAAGTTGAACGAAAAAAATGCACTAAGTATGCACTGACTGCAt > 1:1254079‑M2/48‑150 (MQ=255) aTGTCGCAGGTGAACCCTCTCCCCAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggtgactcacatgacaaaaacagtatcaaccagtaaaaaaccccgt > 3:1371241‑M2/1‑50 (MQ=255) agaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaGCTTTACTAAAATTCATCGTCAATGTATTGGCTTTAACCTGCGCTCCGCGCTCTGCTTGTGAAGTTGAACGAAAAAAATGCACTAAGTATGCACTGACTGCATAGTc < 5:1237977‑M2/107‑1 (MQ=255) aacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaGCTTTACTAAAATTCATCGTCAATGTATTGGCTTTAACCTGCGCTCCGCGCTCTGCTTGTGAAGTTGAACGAAAAAAATGCACTAAGTATGCACTGACTGCATAGTCAc < 6:1029432‑M2/109‑1 (MQ=255) acctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaGCTTTACTAAAATTCATCGTCAATGTATTGGCTTTAACCTGCGCTCCGCGCTCTGCTTGTGAAGTTGAACGAAAAAAATGCACTAAGTATGCACTGACTGCATAGTCACg > 8:1445486‑M2/42‑151 (MQ=255) aGGTGAACCCTCTCCCCAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggtgactcacatgacaaaaacagtatcaaccagtaaaaaaccccgtaaacagc > 1:198538‑M2/1‑43 (MQ=255) aGGTGAACCCTCTCCCCAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtaagaggtgactcacatgacaaaaacagaatcaaccagtaaaaaaccccgtaaacagc < 8:419980‑M2/151‑109 (MQ=255) tcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaGCTTTACTAAAATTCATCGTCAATGTATTGGCTTTAACCTGCGCTCCGCGCTCTGCTTGTGAAGTTGAACGAAAAAAATGCACTAAGTATGCACTGACTGCATAGTCACGgcc > 2:788987‑M2/39‑150 (MQ=255) gTGAACCCTCTCCCCAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggtgactcacatgacaaaaacagtatcaaccagtaaaaaaccccgtaaacagcat > 7:1503983‑M2/1‑41 (MQ=255) gcttaggcctgtgtcaatattaggggggtaggatcaGCTTAACTAAAATTCATCGTCAATGTATTGGCTTTAACCTGCGCTCCGCGCTCTGCTTGTCAAGTTCAACCAAAAAAATCAACTAAGTATGCACTGACTGCATAGTCACGGCAGc < 6:829464‑M2/115‑1 (MQ=255) aaCCCTCTCCCCAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggtgactcacatgacaaaaacagtatcaaccagtaaaaaaccccgtaaacagcattcg > 2:315874‑M2/1‑38 (MQ=255) ttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaGCTTTACTAAAATTCATCGTCAATGTATTGGCTTTAACCTGCGCTCCGCGCTCTGCTTGTGAAGTTGAACGAAAAAAATGCACTAAGTATGCACTGACTGCATAGTCACGGCAGCgg > 1:532983‑M2/35‑151 (MQ=255) tgtgtccatattacgtgggtaggatcaGCTTTACTAAAATTCATCGTCAATGTATTGGCTTTAACCTGCGCTCCGCGCTCTGCTTGTGAAGTTGAACGAAAAAAATGCACTAAGTATGCACTGACTGCATAGTCACGGCAGCGGGctact > 4:953818‑M2/28‑150 (MQ=255) ccccAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggtgactcacatgacaaaaacagtatcaaccagtaaaaaaccccgtaaacagcattcgcctga > 8:536924‑M2/1‑30 (MQ=255) ccccAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTTTACTAAAATTCATCGTCAATGTATTGGCTTTAACCTGCGCTCCGCGCTCTGCTTGTGAAGTTGAACGAAAAAAATGCACTAAGTATGCACTGACTGCATAGTCACGGCAGCGGGctact > 6:169697/1‑150 (MQ=255) ccAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggtgactcacatgacaaaaacagtatcaaccagtaaaaaaccccgtaaacagcattcgcctgaatttc > 1:325111‑M2/1‑28 (MQ=255) gtccatattacgtgggtaggatcaGCTTTACTAAAATTCATCGTCAATGTATTGGCTTTAACCTGCGCTCCGCGCTCTGCTTGTGAAGTTGAACGAAAAAAATGCACTAAGTATGCACTGACTGCATAGTCACGGCAGCGGGCTACTACAt > 3:701348‑M2/25‑151 (MQ=255) cAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTtgatcttacccagcattagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggtgactcacatgacaaaaagagtatcaaccagtaaaaaaccccgtaaacagcattcgcctgaatttcg > 3:803109‑M2/1‑27 (MQ=255) tattacgtgggtaggatcaGCTTTACTAAAATTCATCGTCAATGTATTGGCTTTAACCTGCGCTCCGCGCTCTGCTTGTGAAGTTGAACGAAAAAAATGCACTAAGTATGCACTGACTGCATAGTCACGGCAGCGGGCTACTACATCGCGt > 5:504855‑M2/20‑151 (MQ=255) attacgtgggtaggatcaGCTTTACTAAAATTCATCGTCAATGTATTGGCTTTAACCTGCGCTCCGCGCTCTGCTTGTGAAGTTGAACGAAAAAAATGCACTAAGTATGCACTGACTGCATAGTCACGGCAGCGGGCTACTACATCGCGTa < 5:1128883‑M2/133‑1 (MQ=255) ttacgtgggtaggatcaGCTTTACTAAAATTCATCGTCAATGTATTGGCTTTAACCTGCGCTCCGCGCTCTGCTTGTGAAGTTGAACGAAAAAAATGCACTAAGTATGCACTGACTGCATAGTCACGGCAGCGGGCTACTACATCGCGTa > 7:1032356‑M2/18‑150 (MQ=255) tCTTGCTAAATCTCTCGCTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggtgactcacatgacaaaaacagtatcaaccagtaaaaaaccccgtaaacagcattcgcctgaatttcgcagtgaa > 8:901829‑M2/1‑19 (MQ=255) ttGCTAAATCTCTCGCTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggtgactcacatgacaaaaacagtatcaaccagtaaaaaaccccgtaaacagcattcgcctgaatttcgcagtgaagcc < 8:1600671‑M2/151‑135 (MQ=255) gtgggtaggatcaGCTTTACTAAAATTCATCGTCAATGTATTGGCTTTAACCTGCGCTCCGCGCTCTGCTTGTGAAGTTGAACGAAAAAAATGCACTAAGTATGCACTGACTGCATAGTCACGGCAGCGCGCTACTACAACGCGAAAACTc > 2:1544295‑M2/14‑151 (MQ=255) tAAATCTCTCGCTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggtgactcacatgacaaaaacagtatcaaccagtaaaacaccccgtaaacagcattcgcctgaatttcgcagtgaagccctg < 6:321875‑M2/150‑138 (MQ=255) ggtaggatcaGCTTTACTAAAATTCATCGTCAATGTATTGGCTTTAACCTGCGCTCCGCGCTCTGCTTGTGAAGTTGAACGAAAAAAATGCACTAAGTATGCACTGACTGCATAGTCACGGCAGCGGGCTACTACATCGCGTAAACTCCAg < 5:914242‑M2/141‑1 (MQ=255) aaTCTCTCGCTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggtgactcacatgacaaaaacagtatcaaccagtaaaaaaccccgtaaacagcattcgcctgaatttcgcagtgaagccctga < 5:442824‑M2/149‑139 (MQ=255) atgatcaGCTTTACTAAAATTCATCGTCAATGTATTGGCTTTAACCTGCGCTCCGCGCTCTGCTTGTGAAGTTGAACGAAAAAAATGCACTAAGTATGCACTGACTGCATAGTCACGGCAGCGGGCTACTACATCGCGTAAACTCCAGtt < 6:1177525‑M2/143‑1 (MQ=255) ggatcaGCTTTACTAAAATTCATCGTCAATGTATTGGCTTTAACCTGCGCTCCGCGCTCTGCTTGTGAAGTTGAACGAAAAAAATGCACTAAGTATGCACTGACTGCATAGTCACGGCAGCGGGCTACTACATCGCGTAAACTCCAGTTa > 1:95736‑M2/7‑150 (MQ=255) ggatcaGCTTTACTAAAATTCATCGTCAATGTATTGGCTTTAACCTGCGCTCCGCGCTCTGCTTGTGAAGTTGAACGAAAAAAATGCACTAAGTATGCACTGACTGCATAGTCACGGCAGCGGGCTACTACATCGCGTAAACTCCAGTTa > 3:1046233‑M2/7‑150 (MQ=255) tctcGCTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggtgactcacatgacaaaaacagtatcaaccagtaaaaaaccccgtaaacagcattcgcctgaatttcgcagtgaagccctgaagcttg < 2:1149264‑M2/151‑145 (MQ=255) atcaGCTTTACTAAAATTCATCGTCAATGTATTGGCTTTAACCTGCGCTCCGCGCTCTGCTTGTGAAGTTGAACGAAAAAAATGCACTAAGTATGCACTGACTGCATAGTCACGGCAGCGGGCTACTACATCGCGTAAACTCCAGTTAATc < 5:1302878‑M2/147‑1 (MQ=255) cGCTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggtgactcacatgacaaaaacagtatcaaccagtaaaaaaccccgtaaacagcattcgcctgaatttcgcagtgaagccctgaagcttgctg > 3:1261575‑M2/1‑4 (MQ=255) gCTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggtgactcacatgacaaaaacagtatcaaccagtaaaaaaccccgtaaacagcattcgcctgaatttcgcagtgaagccctgaagcttgctga > 8:613673‑M2/1‑3 (MQ=255) gCTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggtgactcacatgacaaaaacagtatcaaccagtaaaaaacaccgtaaacagcattcgcctgaatttcgcagtgaagccctgaagcttgctg < 1:1379751‑M2/150‑148 (MQ=255) | TAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGCAGGTGAACCCTCTCCCCAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTTTACTAAAATTCATCGTCAATGTATTGGCTTTAACCTGCGCTCCGCGCTCTGCTTGTGAAGTTGAACGAAAAAAATGCACTAAGTATGCACTGACTGCATAGTCACGGCAGCGGGCTACTACATCGCGTAAACTCCAGTTAATCGCATTG > NC_000913/1199722‑1200021 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |