| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,673,557 | Δ120 bp | intergenic (‑56/‑237) | mdtJ ← / → tqsA | multidrug efflux system transporter/pheromone AI‑2 transporter |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1673557 | 1673676 | 120 | 426 [0] | [0] 424 | mdtJ/tqsA | multidrug efflux system transporter/pheromone AI‑2 transporter |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1673556 | 0 (0.000) | 418 (1.000) | 221/296 | 0.0 | 100% | intergenic (‑55/‑357) | mdtJ/tqsA | multidrug efflux system transporter/pheromone AI‑2 transporter |
| ? | NC_000913 | 1673677 = | 0 (0.000) | intergenic (‑176/‑236) | mdtJ/tqsA | multidrug efflux system transporter/pheromone AI‑2 transporter | |||||
Only 100 of 424 total aligned reads displayed.
TTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAAGTAAAGTGGTCAAGCCCCGCGCATAGCGCAAGCTTTGGCAGAAGAAAGGACTAAAGCGCGTTGCGCCAGTGCTGCTCACCTACGAGCAAGATAGTGGATGAGGTACGAAGATGGGTAAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTT > NC_000913/1673528‑1673826 | catttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaatt > 8:37821‑M2/150‑150 (MQ=255) atttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGt > 1:278726‑M2/149‑151 (MQ=255) atttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGt < 3:1362707‑M2/3‑1 (MQ=255) ttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGt > 8:1240548‑M2/147‑149 (MQ=255) ttccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGt > 2:952918‑M2/147‑149 (MQ=255) tccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAg < 2:621753‑M2/5‑1 (MQ=255) ccctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGa > 2:1623205‑M2/145‑150 (MQ=255) ctcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGaaa > 4:18245‑M2/143‑150 (MQ=255) tcactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAAt > 5:1264704‑M2/142‑151 (MQ=255) cactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAAt > 4:1032838‑M2/141‑150 (MQ=255) cactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATa < 5:421903‑M2/11‑1 (MQ=255) cactgacgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATa < 2:80908‑M2/11‑1 (MQ=255) acgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTc < 5:1229433‑M2/16‑1 (MQ=255) cgctcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTcc > 3:206381‑M2/135‑151 (MQ=255) tcgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTg > 1:591179‑M2/132‑150 (MQ=255) cgcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGaa < 8:796204‑M2/21‑1 (MQ=255) cgcccatttcaatgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGaa < 6:825859‑M2/21‑1 (MQ=255) gcccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAAc < 1:1292146‑M2/22‑1 (MQ=255) gcccatttcattgacagagtaccggtaatttctgtagcaatagcgagacataataaaatccaataaatatacattgtccttctcctccaagagaattattttaatattctcttaattcagctaaaccaaTCTATAAAATAACGTCCTCAAc > 6:949340‑M2/130‑151 (MQ=255) cccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACa < 7:1268121‑M2/23‑1 (MQ=255) ccatttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACaa < 7:601685‑M2/24‑1 (MQ=255) ttcattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAAtt < 2:1423575‑M2/27‑1 (MQ=255) cattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGt < 4:551601‑M2/29‑1 (MQ=255) cattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGt < 8:1118997‑M2/29‑1 (MQ=255) cattgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTc > 8:523881‑M2/122‑151 (MQ=255) attgacagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTcc > 1:879105‑M2/121‑151 (MQ=255) acagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACTTCCTGAACAAATTGTCCata > 5:694612‑M2/117‑150 (MQ=255) cagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCataat > 1:986596‑M2/116‑151 (MQ=255) cagcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCataat > 6:1479395‑M2/116‑151 (MQ=255) ttaggtctggctatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACa < 1:194835‑M2/23‑1 (MQ=255) gcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAatat < 4:819985‑M2/38‑1 (MQ=255) gcgtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAatat < 2:1471409‑M2/38‑1 (MQ=255) gtaccggtaatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATAtt > 3:1014111‑M2/112‑150 (MQ=255) taatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTAt > 1:739850‑M2/105‑151 (MQ=255) aatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTAt < 4:1555207‑M2/47‑1 (MQ=255) aatttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATc < 5:1360131‑M2/48‑1 (MQ=255) atttctgtagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATcc > 6:354670‑M2/103‑151 (MQ=255) tagcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAgtgt > 1:1627047‑M2/96‑151 (MQ=255) agcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGtt < 2:174589‑M2/57‑1 (MQ=255) gcaatagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTg > 1:1052080‑M2/94‑151 (MQ=255) tagccagacctaataaaatccaataaatatacattgtcgttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTtc > 8:594987‑M2/90‑151 (MQ=255) agccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTtct < 7:1320598‑M2/63‑1 (MQ=255) acccagacctaataaaatccaataaatatagattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTtc < 6:613024‑M2/62‑1 (MQ=255) ccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCttctct > 8:1644236‑M2/87‑150 (MQ=255) ccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCg < 8:878155‑M2/65‑1 (MQ=255) ccagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCg > 2:305818‑M2/87‑151 (MQ=255) cagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGt > 3:909161‑M2/86‑151 (MQ=255) cagacctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGt > 3:1524863‑M2/86‑151 (MQ=255) cctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATc > 3:588756‑M2/82‑151 (MQ=255) cctaataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATc < 4:765570‑M2/70‑1 (MQ=255) aataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATcgcg > 3:1088999‑M2/79‑151 (MQ=255) aataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATcgc < 7:513431‑M2/72‑1 (MQ=255) aataaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATcg < 8:720947‑M2/71‑1 (MQ=255) aaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGgat > 6:159647‑M2/76‑151 (MQ=255) aaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGgat < 7:1178096‑M2/76‑1 (MQ=255) aaaatccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGga < 8:1024079‑M2/75‑1 (MQ=255) ccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATaa < 4:958341‑M2/81‑1 (MQ=255) ccaataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATa < 7:390518‑M2/80‑1 (MQ=255) ataaatatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTg < 4:1238664‑M2/84‑1 (MQ=255) atatacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCt < 1:379816‑M2/88‑1 (MQ=255) atacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAACATACCGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTc < 6:429549‑M2/89‑1 (MQ=255) atacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTc < 7:165394‑M2/89‑1 (MQ=255) atacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTc < 6:732407‑M2/89‑1 (MQ=255) atacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTc < 2:907026‑M2/89‑1 (MQ=255) atacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCg < 5:530619‑M2/90‑1 (MQ=255) tacattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGCATGATAATTGTCCTCgg > 2:1170498‑M2/61‑151 (MQ=255) acattgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGt > 8:1400242‑M2/60‑151 (MQ=255) attgtccttctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGt > 2:1559295‑M2/58‑149 (MQ=255) ctcctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCATCGGTAGTtgaaaa > 6:1282184‑M2/49‑147 (MQ=255) cctgcaagagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGcc > 2:37575‑M2/47‑151 (MQ=255) agagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGAttt < 6:467436‑M2/111‑1 (MQ=255) gagaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTg < 7:889663‑M2/112‑1 (MQ=255) agaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGt > 1:1505359‑M2/39‑151 (MQ=255) agaattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGt < 8:323417‑M2/113‑1 (MQ=255) aattattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTAt < 5:1446530‑M2/115‑1 (MQ=255) attattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTAt > 8:257726‑M2/36‑150 (MQ=255) attattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATc < 1:1140292‑M2/116‑1 (MQ=255) attattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTCTAt > 7:82615‑M2/36‑150 (MQ=255) tattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCa < 7:1490019‑M2/117‑1 (MQ=255) tattttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCa < 4:382778‑M2/117‑1 (MQ=255) tttaattttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGc > 2:514694‑M2/31‑151 (MQ=255) tttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTa > 3:542962‑M2/25‑148 (MQ=255) tttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTa > 5:788551‑M2/25‑148 (MQ=255) tttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATACGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATATCTTa > 1:507028‑M2/25‑148 (MQ=255) ttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTGCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGa > 6:1662355‑M2/24‑150 (MQ=255) ttcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATAATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGa < 5:902164‑M2/127‑1 (MQ=255) tcgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGaa < 6:860395‑M2/128‑1 (MQ=255) cgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAAtt < 3:785688‑M2/130‑1 (MQ=255) cgcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAAt < 2:842393‑M2/129‑1 (MQ=255) gcttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAAtt > 5:166281‑M2/21‑150 (MQ=255) ttaattcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAAc > 8:750559‑M2/19‑151 (MQ=255) attcagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACCTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGAGGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCAGATTTGTATCATAGCTTAATAATTaacac > 5:1517793‑M2/16‑148 (MQ=255) cagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCaaa < 7:671371‑M2/138‑1 (MQ=255) cagcgaaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCaaa < 6:114479‑M2/138‑1 (MQ=255) aaaccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATAttt < 3:333184‑M2/144‑1 (MQ=255) accaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGGAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTc < 6:1060671‑M2/146‑1 (MQ=255) ccaaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCTTAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCa < 3:1478746‑M2/147‑1 (MQ=255) aaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACt > 4:250758‑M2/3‑151 (MQ=255) aaTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACt > 4:1411047‑M2/3‑151 (MQ=255) aTGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACtt < 5:1032737‑M2/150‑1 (MQ=255) | TTAATTTTCGCTTAATTCAGCGAAACCAAAGTAAAGTGGTCAAGCCCCGCGCATAGCGCAAGCTTTGGCAGAAGAAAGGACTAAAGCGCGTTGCGCCAGTGCTGCTCACCTACGAGCAAGATAGTGGATGAGGTACGAAGATGGGTAAATGTAGAAAATAACGTCCTGAACAAATTGTCCATAATATTACAATTATCCGCAGTGTTGCTTCTCGTCATCGCGGATGATAATTGTCCTCGGTAGTTGAACACGCCTGATTTGTATCATAGCTTAAGAATTAACTCAAAATATTTTCACTT > NC_000913/1673528‑1673826 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |