New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 2357690 | 304 (0.650) | 75 (0.180) +AATTAGAAGGTT |
45/276 | 32.4 | 21.2% | coding (787/900 nt) | yfaD | transposase_31 family protein |
? | NC_000913 | 2357691 = | 304 (0.650) | coding (788/900 nt) | yfaD | transposase_31 family protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
Only 100 of 346 total aligned reads displayed.
TAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGG > NC_000913/2357542‑2357833 | tAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTaa > 7:147460/1‑149 (MQ=255) tAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATg > 3:1451816/1‑151 (MQ=255) atttATCTGGTGGATTGCGGGGATACGTCCCGTTTCACACGTTTTATTGATGAGATTGAGGTACGTTCACCTCTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTTCGGCAGGAAGGAC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTaaa < 8:1586988/148‑3 (MQ=18) aTTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTaaatt > 8:1018838/1‑147 (MQ=255) aTTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGc > 5:874661/1‑150 (MQ=255) aTTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCa < 3:1542615/151‑1 (MQ=255) ttATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCAt > 2:1438792/1‑151 (MQ=255) tATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCAt < 6:1369489/150‑1 (MQ=255) tATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATg > 7:305327/1‑151 (MQ=255) tATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGCCACGAAGGGC‑ATCAAAGTGTCTGGCAGGATGGTATGCATg > 5:1592844/1‑151 (MQ=255) aTCTGCTGCAATGCGGCGATAGCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGATGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTGCGGCAGGAAGGAC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTaaattag < 5:1018008/150‑7 (MQ=21) aTCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATg < 1:164649/150‑1 (MQ=255) tCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGATGAGATTGCCCAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTCCGGCAGGAAGGAC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTaa < 5:1456591/144‑2 (MQ=255) tCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTAttttaga > 5:200163/1‑144 (MQ=255) tCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGAC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTaa > 8:1459609/1‑143 (MQ=255) ggtgcAATTCGGCGATACGTTCCGTTTGACACGTTTTATTGATGAGATTGCCGAACGTTCACGACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTTCGGCAGGAAGGTC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTaaattagaa < 2:1219332/146‑9 (MQ=18) gctgcAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGACGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTTCGGCAGGAAGGTC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTaaattaga < 4:959395/147‑8 (MQ=25) ggcAATGCGGCGATACGTCCCGGTGCACCCGTGTTATTGAGGATAGTGCCGAACGTTCACCTCTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTCCGGCAGGAAGGAC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTaaattagaaggttt < 8:580039/150‑14 (MQ=17) 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gcggcgATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTa < 1:26789/150‑1 (MQ=255) gcgATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAAt < 7:1368208/151‑1 (MQ=255) cgATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGTCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAAtt < 8:1294284/151‑1 (MQ=255) gATACCTCGCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTg < 4:866215/151‑1 (MQ=255) gATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTg < 6:1840701/151‑1 (MQ=255) aCCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCtt < 2:296016/151‑1 (MQ=255) tcgcGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTTCGGCAGGAAGGAC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTaaattag < 8:1697901/124‑7 (MQ=18) tCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTgc > 3:473092/1‑151 (MQ=255) cGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCa < 1:1784470/151‑1 (MQ=255) tttCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTTCGGCAGGAAGGAC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTaaatta < 2:782876/121‑6 (MQ=255) tttCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGGCATTAAAATTGCTTTGCGCATg > 5:857332/1‑151 (MQ=255) tttCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGCC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTaaatta > 1:779084/1‑116 (MQ=255) tCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGc < 2:1711897/150‑1 (MQ=255) aCCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGAATGAACAATACATTAAAAAAGCTTTGAGAATGCttt > 4:555661/1‑149 (MQ=25) cccGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGa < 6:834813/151‑1 (MQ=255) ccGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGGATGAACAATACATTAAAAATGCTTTTAAAATGCTGGa > 2:505531/1‑150 (MQ=25) 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aggagATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGa < 3:1599698/151‑1 (MQ=255) aggagATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGAGCATGCTGGAGCAGGGCTTTg > 5:689442/1‑150 (MQ=255) aggagATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGCC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGAGCATTCTGGAGCAGGTCATTg > 6:162101/1‑150 (MQ=255) agaTTGCAGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACAGCTACGGCAGGAAGGGC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACg < 8:287039/151‑1 (MQ=255) gaTTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGt < 2:1104524/151‑1 (MQ=255) 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aCTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAAATGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGACATTGTGCTCGCGCCCACCCACCTAACCGAAGCCGatc > 4:314391/1‑150 (MQ=18) cTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGACATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGATCGTGACATTGTGCTGGCGCCCAACCACCTCACCGAAGCGGatat > 6:74801/1‑151 (MQ=21) tATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGACAATGTGCTGGCGGCCACCCACCTAAGCGAAGCCGATAtt > 1:1402731/1‑151 (MQ=18) aTTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTc < 3:333936/151‑1 (MQ=255) tGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTcc < 1:444179/150‑1 (MQ=255) gaccGGCTACTGCAGGAAGGGC‑TTCAAATTGGCTGGCAGGTAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGGAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAAc < 6:1249156/147‑1 (MQ=255) aaCGGCTACGGCAGGAAGGGC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTg < 5:645967/151‑1 (MQ=255) gCTACGGCAGGAAGGGC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCAt < 6:1095345/151‑1 (MQ=255) ggCAGGAAGGGC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTaaaa < 5:1749893/151‑1 (MQ=255) ggC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTAAAAGGAGAGAtt < 5:167385/151‑1 (MQ=255) ggC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTAAAAGGAGAGAtt < 6:288658/151‑1 (MQ=255) ggC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTAAAAGGAGAGAtt < 3:1788912/151‑1 (MQ=255) gC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTAAAAGGAGAGATTa < 2:683739/151‑1 (MQ=255) c‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTAAAAGGAGAGATTaa < 8:875737/151‑1 (MQ=255) cAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAGAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTAAAAGGAGAGATTAATGa < 5:1224160/151‑1 (MQ=255) cAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTAAAAGGAGAGATTAATg < 5:423308/150‑1 (MQ=255) cAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTAAAAGGAGAGATTAATg < 5:301171/150‑1 (MQ=255) aaTTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTAAAAGGAGAGATTAATGACt < 3:1773184/151‑1 (MQ=255) aTTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTAAAAGGAGAGATTAATGACTa < 7:390183/151‑1 (MQ=255) tggctggcAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAACATTGCTTTGCGGATTCTGGAGCTGGGCTTTGCACGGGAGATTGTGCTGGCGACAAGCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTAAAAGGAGAGATTAATGACTAt < 4:1588829/150‑1 (MQ=255) tggctggcAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGc > 3:976239/1‑59 (MQ=255) | TAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGC‑ATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTATGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGG > NC_000913/2357542‑2357833 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |