| Predicted mutation | ||||||
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| MC JC | NC_000913 | 1,674,769 | Δ12 bp | coding (857‑868/1035 nt) | tqsA → | pheromone AI‑2 transporter |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1674769 | 1674780 | 12 | 414 [0] | [0] 417 | tqsA | pheromone AI‑2 transporter |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 1674768 | 0 (0.000) | 390 (0.870) | 200/288 | 0.2 | 100% | coding (856/1035 nt) | tqsA | pheromone AI‑2 transporter |
| ? | NC_000913 | 1674781 = | 0 (0.000) | coding (869/1035 nt) | tqsA | pheromone AI‑2 transporter | |||||
Only 100 of 417 total aligned reads displayed.
TTCAGTCCTCGCGGCAATCCCCCCTATCGCTCAGGTACTGGTGTTTAATGGCTTCTACGAAGCGTTGCTGGTGCTGGCGGGATATCTGCTGATTAATCTGGTCTTCGGCAATATTCTGGAGCCGCGTATCATGGGGCGTGGGCTGGGGCTTTCCACATTGGTGGTATTTTTGTCGTTGATTTTTTGGGGATGGTTGTTAGGACCGGTGGGTATGCTGCTTTCCGTGCCGTTGACAATTATTGTCAAAATTGCGCTTGAACAAACAGCGGGAGGTCAAAGCATCGCCGTTCTGTTAAGCG > NC_000913/1674632‑1674930 | cccgaatattggttcagtcctcgcggcaatcccccctatcgctcaggtactggtgtttaatggcttctacgaagcgttgctggtgctggcgggatatctgctgattaatctggtcttcggcaatattctggagccgcgtatcatgggggtt > 2:1173522‑M2/150‑151 (MQ=255)cccgaatattggttcagtcctcgcggcaatcccccctatcgctcaggtactggtgtttaatggcttctacgaagcgttgctggtgctggcgggatatctgctgattaatctggtcttcggcaatattctggagccgcgtatcatggggctt > 8:1224150‑M2/150‑151 (MQ=255) ccgaatattggttcagtcctcgcggcaatcccccctatcgctcaggtactggtgtttaatggcttctacgaagcgttgctggtgctggcgggatatctgctgattaatctggtcttcggcaatattctggagccgcgtatcatggggcttt < 2:463587‑M2/3‑1 (MQ=255) gaatattggttcagtcctcgcggcaatcccccctatcgctcaggtactggtgtttaatggcttctacgaagcgttgctggtgctggcgggatatctgctgattaatctggtcttcggcaatattctggagccgcgtatcatggggcTTTcc < 4:76837‑M2/5‑1 (MQ=255) gaatattggttcagtcctcgcggcaatcccccctatcgctcaggtactggtgtttaatggcttctacgaagcgttgctggtgctggcgggatatctgctgattaatctggtcttcggcaatattctggagccgcgtatcatggggcTTTcc > 1:437413‑M2/147‑151 (MQ=255) ggttcagtcctcgcggcaatcccccctatcgctcaggtactggtgtttaatggcttctacgaagcgttgctggtgctggcgggatatctgctgattaatctggtcctcggcaatattctggagccgcgtatcatggggcTTTCCACATtgg < 3:401205‑M2/12‑1 (MQ=255) gttcagtcctcgcggcaatcccccctatcgctcaggtactggtgtttaatggcttctacgaagcgttgctggtgctggcgggatatctgctgattaatctggtcttcggcaatattctggagccgcgtatcatggggcTTTCCACATtggt > 2:584795‑M2/139‑151 (MQ=255) tcagtcctcgcggcaatcccccctatcgctcaggtactggtgtttaatggctgctacgaagcgttgctggtgctggcgggatatctgctgattaatctggtcttcggcaatattctggagccgcgtatcatggggcTTTCCACATtggtg < 2:955967‑M2/14‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |