| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1104115 | 154 (0.400) | 170 (0.450) | 122/298 | 4.3 | 51.7% | coding (165/456 nt) | csgB | curlin nucleator protein, minor subunit in curli complex |
| ? | NC_000913 | 1104420 = | 165 (0.440) | intergenic (+14/‑27) | csgB/csgA | curlin nucleator protein, minor subunit in curli complex/curlin subunit, amyloid curli fibers, cryptic | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 174 total aligned reads displayed.
GTTATTTATGATGTTAACAATACTGGGTGCGCCTGGGATTGCAGCCGCAGCAGGTTATGATTTAGCTAATTCAGAATATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1103965‑1104115‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGGCGGCGGCGGTAACCACGGTGGTGGCGGTAATAATAGCGGCCC > NC_000913/1104420‑1104568 GTTATTTATGATGTTAACAATACTGGGTGCGCCTGGGATTGCAGCCGCAGCAGGTTATGATTTAGCTAATTCAGAATATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAAT > 5:824910/1‑151 TTATTTATGATGTTAACAATACTGGGTGCGCCTGGGATTGCAGCCGCAGCAGGTTATGATTTAGCTAATTCAGAATATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATT > 5:1069842/1‑151 ATTTATGATGTTAACAATACTGGGTGCGCCTGGGATTGCAGCCGCAGCAGGTTATGATTTAGCTAATTCAGAATATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTT < 1:170026/151‑1 ATTTATGATGTTAACAATACTGGGTGCGCCTGGGATTGCAGCCGCAGCAGGTTATGATTTAGCTAATTCAGAATATAACTTCGCGGTAAATGAATCGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTT < 3:1034667/151‑1 TTTATGATGTTAACAATACTGGGTGCGCCTGGGATTGCAGCCGCAGCAGGTTATGATTTAGCTAATTCAGAATATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTT > 6:370447/1‑150 TTATGATGTTAACAATACTGGGTGCGCCTGGGATTGCAGCCGCAGCAGGTTATGATTTAGCTAATTCAGAATATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCGTAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTA > 7:926777/1‑150 TTATGATGTTAACAATACTGGGTGCGCCTGGGATTGCAGCCGCAGCAGGTTATGATTTAGCTAATTCAGAATATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTA > 4:1350367/1‑150 TTAACAATACTGGGTGCGCCTGGGATTGCAGCCGCAGCAGGTTATGATTTAGCTAATTCAGAATATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCC > 7:424687/1‑151 TTAACAATACTGGGTGCGCCTGGGATTGCAGCCGCAGCAGGTTATGATTTAGCTAATTCAGAATATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATC < 1:230875/150‑1 AATACTGGGTGCGCCTGGGATTGCAGCCGCAGCAGGTTATGATTTAGCTAATTCAGAATATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGG < 2:434710/151‑1 ATACTGGGTGCGCCTGGGATTGCAGCCGCAGCAGGTTATGATTTAGCTAATTCAGAATATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGG < 6:197156/151‑1 ACTGGGTGCGCCTGGGATTGCAGCCGCAGCAGGTTATGATTTAGCTAATTCAGAATATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGG < 2:985623/151‑1 ACTGGGTGCGCCTGGGATTGCAGCCGCAGCAGGTTATGATTTAGCTAATTCAGAATATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGG < 7:264789/150‑1 GGGTGCGCCTGGGATTGCAGCCGCAGCAGGTTATGATTTAGCTAATTCAGAATATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTT < 5:1487439/151‑1 GGGTGCGCCTGGGATTGCAGCCGCAGCAGGTTATGATTTAGCTAATTCAGAATATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTT > 4:1207330/1‑151 GGTGCGCCTGGGATTGCAGCCGCAGCAGGTTATGATTTAGCTAATTCAGAATATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTT < 5:210687/151‑1 GTGCGCCTGGGATTGCAGCCGCAGCAGGTTATGATTTAGCTAATTCAGAATATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTA < 7:877567/151‑1 gGCGCCTGGGATTGCAGCCGCAGCAGGTTATGATTTAGCTAATTCAGAATATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTAC < 6:1124983/150‑1 GCGCCTGGGATTGCAGCCGCAGCAGGTTATGATTTAGCTAATTCAGAATATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACA < 7:1437731/151‑1 GCCTGGGATTGCAGCCGCAGCAGGTTATGATTTAGCTAATTCAGAATATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATG < 5:819570/151‑1 GCCTGGGATTGCAGCCGCAGCAGGTTATGATTTAGCTAATTCAGAATATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATG > 7:1235614/1‑151 CTGGGATTGCAGCCGCAGCAGGTTATGATTTAGCTAATTCAGAATATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGA > 3:1483644/1‑150 GGGATTGCAGCCGCAGCAGGTTATGATTTAGCTAATTCAGAATATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAA < 1:1175927/150‑1 GGATTGCAGCCGCAGCAGGTTATGATTTAGCTAATTCAGAATATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACT < 4:286690/151‑1 GATTGCAGCCGCAGCAGGTTATGATTTAGCTAATTCAGAATATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTT < 7:564070/151‑1 TGCAGCCGCAGCAGGTTATGATTTAGCTAATTCAGAATATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTT < 6:125655/150‑1 ggAGCCGCAGCAGGTTATGATTTAGCTAATTCAGAATATATCTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGGTTTACATGAAACTTTTAA < 1:197374/149‑1 GCAGCCGCAGCAGGTTATGATTTAGCTAATTCAGAATATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAA < 7:655419/151‑1 CAGCCTCAGCAGGTTATGATTTAGCTAATTCAGAATATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCCAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAA < 8:1443038/150‑1 AGCCGCAGCAGGTTATGATTTAGCTAATTCAGAATATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAA < 7:945045/151‑1 AGCCGCAGCAGGTTATGATTTAGCTAATTCAGAATATAACATCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAA < 8:503389/151‑1 CCGCAGCAGGTTATGATTTAGCTAATTCAGAATATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGT < 3:266739/151‑1 CGCAGCAGGTTATGATTTAGCTAATTCAGAATATAACTTCGCTGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTA < 7:1142041/151‑1 CGCAGCAGGTTATGATTTAGCTAATTCAGAATATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGT > 2:526209/1‑150 GCAGCAGGTTATGATTTAGCTAATTCAGAATATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGT > 5:504345/1‑149 CAGCAGGTTATGATTTAGCTAATTCAGAATATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGC > 3:379943/1‑151 acCAGGTTATGATTTATCTAATTAAGAATATAACTTCTCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGGCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCA < 2:1278306/149‑1 GCAGGTTATGATTTAGCTAATTCAGAATATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAG < 5:596027/151‑1 CAGGTTATGATTTAGCTAATTCAGAATATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGC > 5:1303148/1‑151 CAGGTTATGATTTAGCTAATTCAGAATATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCATCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCCAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGC > 8:172385/1‑151 GGTTATGATTTAGCTAATTCAGAATATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAA < 3:970538/151‑1 GGTTATGATTTAGCTAATTCAGAATATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACAAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGATTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCA > 8:535219/1‑150 GTTATGATTTAGCTAATTCAGAATATAACTTCGCTGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAAT < 1:1192922/151‑1 ATGATTTAGCTAATTCAGAATATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTG < 1:1246850/150‑1 GATTTAGCTAATTCAGAATATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCA < 1:884588/150‑1 GATTTAGCTAATTCAGAATATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGC > 6:942150/1‑149 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2:1300592/1‑151 AATTCAGAATAAAACTTCGCGGTAAATGATTTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGT < 2:122532/149‑1 TCAGAATATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTCCATGAAACTTTTAAAAGTAGCTGCAATTGCAGCAATCGTATTC > 2:738928/1‑150 CAGAATATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCT < 6:782329/150‑1 CAGAATATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCT < 8:1298353/150‑1 AGAATATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCC > 2:350985/1‑151 AGAATATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCC > 4:114084/1‑151 TATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGAATTTGCAGCAATCGTATTCTCCGGT > 2:772329/1‑150 ATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAG < 4:864894/151‑1 AACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTGTCCGGTAGCG < 5:712924/151‑1 ccccGTAAATGAATTGCCTTAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTG < 4:1309818/147‑1 GCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCTTAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGG > 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GTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCA < 4:176248/151‑1 GTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTC > 4:548772/1‑150 AAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGT < 1:111479/151‑1 AAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAG < 8:423880/150‑1 GTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTAC > 5:1266627/1‑151 TCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTAC < 3:371228/150‑1 TTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGGC > 7:1201374/1‑151 TAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGGCGGCGGC > 1:219089/1‑151 TAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGGCGGCGGC > 7:1301318/1‑151 TAATCAGGCAGCCATAATTGGTAAAGGTGGTACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGAAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGGGGTGGCAGGTGTTGTGCCTCAGTACGGCGGCGGC > 6:366678/1‑151 AATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGGCGGCGGCG > 2:1389720/1‑151 AATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGGCGGCGGCG > 1:60857/1‑151 AATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGGCGGCGGC < 4:383137/150‑1 ATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGGCGGCGGCGG > 7:679670/1‑151 TCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGGCGGCGGCGGT > 3:737820/1‑151 CAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGGCGGCGGCGGT < 1:112414/150‑1 CAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGGCGGCGGCGGT > 5:189526/1‑150 CAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGGCGGCGGCGGT < 4:786561/150‑1 GGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGGCGGCGGCGGTAAC < 7:1458679/151‑1 AGCCATAATTGCTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGGTCCTCAGTACGGCGGCGGCGGTAACCAC < 3:1324391/151‑1 ATAATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGGCGGCGGCGGTAACCACGGTG > 8:1411285/1‑151 AATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGGCGGCGGCGGTAACCACGGTGGT > 1:457191/1‑151 AATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGGCGGCGGCGGTAACCACGGTGG < 8:924855/150‑1 ATTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGGCGGCGGCGGTAACCACGGTGGTG < 2:1347609/151‑1 TTGGTCAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGGCGGCGGCGGTAACCACGGTGGTGG > 7:108453/1‑151 CAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGGCGGCGGCGGTAACCACGGTGGTGGCGGT < 7:74266/150‑1 CAAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGGCGGCGGCGGTAACCACGGTGGTGGCGGT > 5:664978/1‑150 AAGCTGGGACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGGCGGCGGCGGTAACCACGGTGGTGGCGGTAA < 2:1344537/151‑1 gTGGGACTAATTTTAAATGAATGCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGTCTGCGGCGGTAACCACGGTTGTGGCGGTAATAA < 4:731248/150‑1 GACTAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGGCGGCGGCGGTAACCACGGTGGTGGCGGTAATAATAGC > 3:5886/1‑151 TAATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGGCGGCGGCGGTAACCACGGTGGTGGCGGTAATAATAGCGGC > 2:1062787/1‑151 AATTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGGCGGCGGCGGTAACCACGGTGGTGGCGGTAATAATAGCGGC < 2:173601/150‑1 GTTATTTATGATGTTAACAATACTGGGTGCGCCTGGGATTGCAGCCGCAGCAGGTTATGATTTAGCTAATTCAGAATATAACTTCGCGGTAAATGAATTGAGTAAGTCTTCATTTAATCAGGCAGCCATAATTGGTCAAGCTGGGACTAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1103965‑1104115‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGGCGGCGGCGGTAACCACGGTGGTGGCGGTAATAATAGCGGCCC > NC_000913/1104420‑1104568 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |