| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1104115 | 154 (0.400) | 170 (0.450) | 122/298 | 4.3 | 51.7% | coding (165/456 nt) | csgB | curlin nucleator protein, minor subunit in curli complex |
| ? | NC_000913 | 1104420 = | 165 (0.440) | intergenic (+14/‑27) | csgB/csgA | curlin nucleator protein, minor subunit in curli complex/curlin subunit, amyloid curli fibers, cryptic | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 182 total aligned reads displayed.
GTGCTTATGGTAATACTGCGATGATTATCCAGAAAGGTTCTGGTAATAAAGCAAATATTACACAGTATGGTACTCAAAAAACGGCAATTGTAGTGCAGAGACAGTCGCAAATGGCTATTCGCGTGACACAACGTTAATTTCCATTCGACTTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGGCGGCGGCGGTAACCACGGTGGTGGCGGTAATAATAGCGGCCCA > NC_000913/1104270‑1104569 | gTGCTTATGGTAATACTGCGATGATTATCCAGAAAGGTTCTGGTAATAAAGCAAATATTACACAGTATGGTACTCAAAAAACGGCAATTGTAGTGCAGAGACAGTCGCAAATGGCTATTCGCGTGACACAACGTTAATTTCCATTCGACtt > 5:402280/1‑151 (MQ=255) gCTTATGGTAATACTGCGATGATTATCCAGAAAGGTTCTGGTAATAAAGCAAATATTACACAGTATGGTACTCAAAAAACGGCAATTGTAGTGCAGAGACAGTCGCAAATGGCTATTCGCGTGACACAACGTTAATTTCCATTCGACtttt < 3:442350/151‑1 (MQ=255) gCTTATGGTAATACTGCGATGATTATCCAGAAAGGTTCTGGTAATAAAGCAAATATTACACAGTATGGTACTCAAAAAACGGCAATTGTAGTGCAGAGACAGTCGCAAATGGCTATTCGCGTGACACAACGTTAATTTCCATTCGACttt < 1:1215185/150‑1 (MQ=255) gCTTATGGTAATACTGCGATGATTATCCAGAAAGGTTCTGGTAATAAAGCAAATATTACACAGTATGGTACTCAAAAAACGGCAATTGTAGTGCAGAGACAGTCGCAAATGGCTATTCGCGTGACACAACGTTAATTTCCATTCGACttt < 5:259442/150‑1 (MQ=255) tATGGTAATACTGCGATGATTATCCAGAAAGGTTCTGGTAATAAAGCAAATATTACACAGTATGGTACTCAAAAAACGGCAATTGTAGTGCAGAGACAGTCGCAAATGGCTATTCGCGTGACACAACGTTAATTTCCATTCGACTTTTa < 2:1126082/149‑1 (MQ=255) aTGGTAATACTGCGATGATTATCCAGAAAGGTTCTGGTAATAAAGCAAATATTACACAGTATGGTACTCAAAAAACGGCAATTGTAGTGCAGAGACAGTCGCAAATGGCTATTCGCGTGACACAACGTTAATTTCCATTCGACTTTTAaat > 3:1115925/1‑151 (MQ=255) tGGTAATACTGCGATGATTATCCAGAAAGGTTCTGGTAATAAAGCAAATATTACACAGTATGGTACTCAAAAAACGGCAATTGTAGTGCAGAGACAGTCGCAAATGGCTATTCGCGTGACACAACGTTAATTTCCATTCGACTTTTAaatc > 6:884374/1‑151 (MQ=255) ggTAATACTGCGATGATTATCCAGAAAGGTTCTGGTAATAAAGCAAATATTACACAGTATGGTACTCAAAAAACGGCAATTGTAGTGCAGAGACAGTCGCAAATGGCTATTCGCGTGACACTACGTTAATTTCCATTCGACTTTTAaatc > 5:368688/1‑150 (MQ=255) ggTAATACTGCGATGATTATCCAGAAAGGTTCTGGTAATAAAGCAAATATTACACAGTATGGTACTCAAAAAACGGCAATTGTAGTGCAGAGACAGTCGCAAATGGCTATTCGCGTGACACAACGTTAATTTCCATTCGACTTTTAaatca < 2:176071/151‑1 (MQ=255) aTACTGCGATGATTATCCAGAAAGGTTCTGGTAATAAAGCAAATATTACACAGTATGGTACTCAAAAAACGGCAATTGTAGTGCAGAGACAGTCGCAAATGGCTATTCGCGTGACACAACGTTAATTTCCATTCGACTTTTAAATCAATcc < 5:691700/151‑1 (MQ=255) tACTGCGATGATTATCCAGAAAGGTTCTGGTAATAAAGCAAATATTACACAGTATGGTACTCAAAAAACGGCAATTGTAGTGCAGAGACAGTCGCAAATGGCTATTCGCGTGACACAACGTTAATTTCCATTCGACTTTTAAATCAATCCg > 8:858522/1‑151 (MQ=255) tGCGATGATTATCCAGAAAGGTTCTGGTAATAAAGCAAATATTACACAGTATGGTACTCAAAAAACGGCAATTGTAGTGCAGAGACAGTCGCAAATGGCTATTCGCGTGACACAACGTTAATTTCCATTCGACTTTTAAATCAATCCGATg > 8:1332371/1‑151 (MQ=255) gCGATGATTATCCAGAAAGGTTCTGGTAATAAAGCAAATATTACACAGTATGGTACTCAAAAAACGGCAATTGTAGTGCAGAGACAGTCGCAAATGGCTATTCGCGTGACACAACGTTAATTTCCATTCGACTTTTAAATCAATCCGAt < 8:723504/149‑1 (MQ=255) gCGATGATTATCCAGAAAGGTTCTGGTAATAAAGCAAATATTACACAGTATGGTACTCAAAAAACGGCAATTGTAGTGCAGAGACAGTCGCAAATGGCTATTCGCGTGACACAACGTTAATTTCCATTCGACTTTTAAATCAATCCGATg < 7:40840/150‑1 (MQ=255) tgatTATCCAGAAAGGTTCTGGTAATAAAGCAAATATTACACAGTATGGTACTCAAAAAACGGCAATTGTAGTGCAGAGACAGTCGCAAATGGCTATTCGCGTGACACAACGTTAATTTCCATTCGACTTTTAAATCAATCCGATGGGGGt > 3:1366564/1‑151 (MQ=255) tgatTATCCAGAAAGGTTCTGGTAATAAAGCAAATATTACACAGTATGGTACTCAAAAAACGGCAATTGTAGTGCAGAGACAGTCGCAAATGGCTATTCGCGTGACACAACGTTAATTTCCATTCGACTTTTAAATCAATCCGATGGGGGt > 3:1174288/1‑151 (MQ=255) atTATCCAGAAAGGTTCTGGTAATAAAGCAAATATTACACAGTATGGTACTCAAAAAACGGCAATTGTAGTGCAGAGACAGTCGCAAATGGCTATTCGCGTGACACAACGTTAATTTCCATTCGACTTTTAAATCAATCCGATGGGGGttt < 8:934591/151‑1 (MQ=255) ttATCCAGTAAGGTTCTGGTAATAAAGGAAATATTACACAGTATGGTACTCAAAAAACGGCAATTGTAGTGCAGAGAGAGTCGCAAATGGCTATTCGCGTGAGACAACGTTAATTTCCATTCGACTTTTAAATCAATCCGATGGGGGttt < 4:192510/150‑1 (MQ=255) 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ttCTGGTAATAAAGCAAATATTACACAGTATGGTACTCAAAAAACGGCAATTGTAGTGCAGAGACAGTCGCAAATGGCTATTCGCGTGACACAACGTTAATTTCCATTCGACTTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACtttt > 8:1076180/1‑151 (MQ=255) ttCTCGTAATAAAGCAAATATTACACAGTAAGGTACTCAAAAAACGGCAATTGTAGTGCAGAGACAGTCGCAAATGGCTATTCGCGTGACACAACGTAAATATCCATTCGACTTATAAATCAATCCGATGGGGGTATTACATTAAACtttt > 2:591081/1‑151 (MQ=255) tGGTAATAAAGCAAATATTACACAGTATGGTACTCAAAAAACGGCAATTGTAGTGCAGAGACAGTCGCAAATGGCTATTCGCGTGACACAACGTTAATTTCCATTCGACTTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTaa > 8:1092630/1‑150 (MQ=255) ggTAATAAAGCAAATATTACACAGTATGGTACTCAAAAAACGGCAATTGTAGTGCAGAGACAGTCGCAAATGGCTATTCGCGTGACACAACGTTAATTTCCATTCGACTTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTaaaa < 2:1261926/151‑1 (MQ=255) gTAATAAAGCAAATATTACACAGTATGGTACTCAAAAAACGGCAATTGTAGTGCAGAGACAGTCGCAAATGGCTATTCGCGTGACACAACGTTAATTTCCATTCGACTTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAg < 5:1010855/151‑1 (MQ=255) 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aTTCGCGTGACACAACGTTAATTTCCATTCGACTTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGGCGGCGGCGGt > 3:762444/1‑151 (MQ=255) tCGCGTGACACAACGTTAATTTCCATTCGACTTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGGCGGCGGCGGTa < 8:1172634/150‑1 (MQ=255) cgTGACACAACGTTAATTTCCATTCGACTTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGGCGGCGGCGGTAAccc > 2:368016/1‑150 (MQ=255) gACACAACGTTAATTTCCATTCGACTTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGGCGGCGGCGGTAACCACgg < 6:411156/151‑1 (MQ=255) acacAACGATAATTTCCATTCGACTTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGGCGGCGGCGGTAACCACggt < 4:1051558/151‑1 (MQ=255) acaACGTTAATTTCCATTCGACTTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGGCGGCGGCGGTAACCACggtgg > 5:593384/1‑151 (MQ=255) tAATTTCCATTCGACTTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGGCGGCGGCGGTAACCACGGTGGTGGCgg < 8:334782/150‑1 (MQ=255) caagctgggactaattttAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGGCGGCGGCGGTAACCACGGTGGTGGCGGt < 7:74266/136‑1 (MQ=255) aagctgggactaattttAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGGCGGCGGCGGTAACCACGGTGGTGGCGGta > 2:44689/14‑150 (MQ=255) ttCCATTCGACTTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGGCGGCGGCGGTAACCACGGTGGTGGCGGtaat < 5:1172211/150‑1 (MQ=255) gtgggactaattttAAATGAATGCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGTCTGCGGCGGTAACCACGGTTGTGGCGGtaataa < 4:731248/141‑1 (MQ=255) aTTCGACTTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGGCGGCGGCGGTAACCACGGTGGTGGCGGTAATAATAg < 3:247008/151‑1 (MQ=255) actaattttAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGGCGGCGGCGGTAACCACGGTGGTGGCGGTAATAATAGCg > 2:789555/6‑151 (MQ=255) cGACTTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGGCGGCGGCGGTAACCACGGTGGTGGCGGTAATAATAGCgg < 6:965232/151‑1 (MQ=255) taattttAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGGCGGCGGCGGTAACCACGGTGGTGGCGGTAATAATAGCGGc > 2:1062787/4‑151 (MQ=255) taattttAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGGCGGCGGCGGTAACCACGGTGGTGGCGGTAATAATAGCGGc > 7:351776/4‑151 (MQ=255) taattttAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGGCGGCGGCGGTAACCACGGTGGTGGCGGTAATAATAGCGGc > 4:146294/4‑151 (MQ=255) aattttAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGGCGGCGGCGGTAACCACGGTGGTGGCGGTAATAATAGCGGc < 2:173601/148‑1 (MQ=255) attttAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGGCGGCGGCGGTAACCACGGTGGTGGCGGTAATAATAGCGGccc > 1:544622/2‑151 (MQ=255) ttttAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGGCGGCGGCGGTAAGCACGGTGGTGGCGGTAATAATAGCGGccc > 1:19027/1‑150 (MQ=255) atttAAATCAATCCTATGGGGCTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGAAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGCCAGTTTTAGTTCCTCAGTACGGCGGCTGCGGTAACCAAGGTGGAGGCGGTAATAAAAGCgccac > 2:972604/2‑146 (MQ=255) tttAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGGCGGCGGCGGTAACCACGGTGGTGGCGGTAATAATAGCGGCCCa < 3:31926/150‑1 (MQ=255) | GTGCTTATGGTAATACTGCGATGATTATCCAGAAAGGTTCTGGTAATAAAGCAAATATTACACAGTATGGTACTCAAAAAACGGCAATTGTAGTGCAGAGACAGTCGCAAATGGCTATTCGCGTGACACAACGTTAATTTCCATTCGACTTTTAAATCAATCCGATGGGGGTTTTACATGAAACTTTTAAAAGTAGCAGCAATTGCAGCAATCGTATTCTCCGGTAGCGCTCTGGCAGGTGTTGTTCCTCAGTACGGCGGCGGCGGTAACCACGGTGGTGGCGGTAATAATAGCGGCCCA > NC_000913/1104270‑1104569 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |