| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | = 510656 | 72 (0.880) | 7 (0.100) | 4/84 | NT | 10.5% | intergenic (‑53/‑209) | copA/ybaS | copper transporter/predicted glutaminase |
| ? | W3110S.gb | = 510663 | 58 (0.830) | intergenic (‑60/‑202) | copA/ybaS | copper transporter/predicted glutaminase | |||||
GTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > W3110S.gb/510581‑510656‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑accttccCCTTGCTGGAAGGTTTAACCTTTATCACAGCCAGTCAAAACTGTCTTAAAGGAGTGTTTTATGTCACAA < W3110S.gb/510663‑510595 GTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAAC < 1:6628543/71‑1 TCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACC > 1:7524406/1‑71 TCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACC > 1:628821/1‑71 TCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAAC > 1:6276910/1‑70 TCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAAC > 1:688520/1‑70 CAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTTAACCT > 1:1333833/1‑71 GGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTC < 1:1858149/71‑1 TCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAATGGTTAAACCT < 1:4178522/67‑1 TCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCT < 1:772067/67‑1 TAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACC > 1:6228529/1‑62 CACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCC < 1:6748990/49‑1 TCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCCCTTGCTGGAAGGTTTAACCT < 1:3054601/67‑1 TTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCCCTTGCTGGAAGG < 1:2376975/56‑1 AGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCCCTTGCTGGAA > 1:3035693/1‑46 AGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCCCTTGCTGGAA > 1:2774746/1‑46 AGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCCCTTGCTGGAA > 1:2628282/1‑46 GGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCCCTTGCTGGAAG > 1:6019106/1‑37 CTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCCCTTGCTGGAAGG < 1:2930333/36‑1 ACCTTCCCCTTGCTGGAAGGTTTAACCTTTATCACAGCCAGTCAAAACTGTCTTAAAGGAGTGTTTTATGT < 1:7155335/71‑1 CCTTCCCCTTGCTGGAAGGTTTAACCTTTATCACAGCCAGTCAAAACTGTCTTAAAGGAGTGTTTTATGT > 1:594182/1‑70 CTTCCCCTTGCTGGAAGGTTTAACCTTTATCACAGCCAGTCAAAACTGTCTTAAAGGAGTGTTTTATGTCA > 1:4130360/1‑71 TTCCCCTTGCTGGAAGGTTTAACCTTTATCACAGCCAGTCAAAACTGTCTTAAAGGAGTGTTTTATGTCA > 1:2582921/1‑70 CCCCTTGCTGGAAGGTTTAACCTTTATCACAGCCAGTCAAAACTGTCTTAAAGGAGTGTTTTATGTCACA > 1:7009914/1‑70 CCCCTTGCTGGAAGGTTTAACCTTTATCACAGCCAGTCAAAACTGTCTTAAAGGAGTGTTTTATGTCACA > 1:178318/1‑70 CCCCTTGCTGGAAGGTTTAACCTTTATCACAGCCAGT > 1:16594/1‑37 CCCTTGCTGGAAGGTTTAACCTTTATCACAGCCAGTCAAAACTGTCTTAAAGGAGTGTTTTATGTCACAA < 1:7166753/70‑1 GTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > W3110S.gb/510581‑510656‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑accttccCCTTGCTGGAAGGTTTAACCTTTATCACAGCCAGTCAAAACTGTCTTAAAGGAGTGTTTTATGTCACAA < W3110S.gb/510663‑510595 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |