| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | = 510656 | 72 (0.880) | 7 (0.100) | 4/84 | NT | 10.5% | intergenic (‑53/‑209) | copA/ybaS | copper transporter/predicted glutaminase |
| ? | W3110S.gb | = 510663 | 58 (0.830) | intergenic (‑60/‑202) | copA/ybaS | copper transporter/predicted glutaminase | |||||
GTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTCCGTAAAGATTAAAAAATCGGCTCGATTTG > W3110S.gb/510593‑510731 | gTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAgg < 1:1004600/71‑1 (MQ=255) ttGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGg < 1:7166753‑M2/70‑2 (MQ=255) tgtgACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGgg > 1:7009914‑M2/1‑68 (MQ=255) tgtgACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGgg > 1:178318‑M2/1‑68 (MQ=255) tgACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGggaag > 1:4130360‑M2/1‑66 (MQ=255) tgACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGggaa > 1:2582921‑M2/1‑66 (MQ=255) aCATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGggaaggt < 1:7155335‑M2/71‑8 (MQ=255) aCATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGggaagg > 1:594182‑M2/1‑64 (MQ=255) aTAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCa < 1:2076766/71‑1 (MQ=255) tAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTc > 1:1661328/1‑69 (MQ=255) tAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCaa < 1:5578706/71‑1 (MQ=255) tAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCaa < 1:1792514/71‑1 (MQ=255) tAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCaa < 1:3644783/71‑1 (MQ=255) tAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAG‑AAGGGGAAGGTCaa < 1:6109086/70‑1 (MQ=255) aaaaCACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTc > 1:2620355/1‑68 (MQ=255) aaaaCACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTc > 1:1814698/1‑68 (MQ=255) aaaCACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGa < 1:6349810/71‑1 (MQ=255) aaaCACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGa < 1:6042439/71‑1 (MQ=255) aaaCACTCCTTTAAGACAGTTTTCACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAg > 1:3306483/1‑70 (MQ=255) aaCACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGaa < 1:6676441/71‑1 (MQ=255) aaCACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGaa < 1:3318117/71‑1 (MQ=255) cacTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAAt < 1:1882070/71‑1 (MQ=255) cacTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAAt < 1:6134235/71‑1 (MQ=255) cacTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAAt < 1:2455151/71‑1 (MQ=255) acTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAAtt < 1:704556/71‑1 (MQ=255) cTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGa < 1:6522716/63‑1 (MQ=255) cTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAAt < 1:7819361/66‑1 (MQ=255) cTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATtaata < 1:2579854/71‑1 (MQ=255) cTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATtaa < 1:5944989/69‑1 (MQ=255) gACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAg < 1:1737086/71‑1 (MQ=255) gACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAg < 1:6615607/71‑1 (MQ=255) gACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAg < 1:530369/71‑1 (MQ=255) cAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGc > 1:7918743/1‑71 (MQ=255) aGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAggag < 1:5043661/71‑3 (MQ=255) gTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGa < 1:7234478/53‑1 (MQ=255) gTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGa < 1:6112227/53‑1 (MQ=255) gTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCgg < 1:154190/71‑1 (MQ=255) gTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCgg < 1:5777045/71‑1 (MQ=255) ttttGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAgg < 1:1094753/40‑1 (MQ=255) ttttGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAgg < 1:170334/40‑1 (MQ=255) ttttGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAgg < 1:4946159/40‑1 (MQ=255) tttGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGaaa > 1:7846021/1‑53 (MQ=255) tttGACTGGCTGTGATAAAGCTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGaaa > 1:7644332/1‑53 (MQ=255) ttGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATaaa > 1:7678256/1‑60 (MQ=255) ttGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATaaa > 1:204252/1‑60 (MQ=255) gACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTaa < 1:3088698/70‑1 (MQ=255) gACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTaa < 1:5815432/70‑1 (MQ=255) gACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTaa < 1:2777071/70‑1 (MQ=255) gACTGGCTGTGATAAAGGTCAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTaa > 1:1554746/1‑70 (MQ=255) aCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGgg > 1:16594‑M2/1‑35 (MQ=255) cTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAg < 1:7049971/71‑1 (MQ=255) gCTGTGATAAAGGTTATACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGt < 1:5633550/69‑1 (MQ=255) gCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATtaa < 1:612960/49‑1 (MQ=255) gCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATtaa < 1:596489/49‑1 (MQ=255) gCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATtaa < 1:1826675/49‑1 (MQ=255) gATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTCCGTa > 1:3166058/1‑69 (MQ=255) aTAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGaaa > 1:641467/1‑39 (MQ=255) aTAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATtaa > 1:4902857/1‑43 (MQ=255) aTAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATtaa > 1:5948712/1‑43 (MQ=255) aaaGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTcc > 1:5203253/1‑63 (MQ=255) aaGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTCCGTAAAGAtt < 1:2143296/71‑1 (MQ=255) aaGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTCCGTAAAGAt > 1:4255819/1‑70 (MQ=255) aGGTTAAACCTTCCAGCAAGGggaaggtttaacctttatcacagccagtcaaaactgtcttaaagga < 1:3054601‑M2/67‑47 (MQ=255) ggTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATtaat > 1:64692/1‑39 (MQ=255) gTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAg < 1:1811988/45‑1 (MQ=255) gTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAg < 1:417339/45‑1 (MQ=255) tAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTCCGTAAAGATTaaaa > 1:5432740/1‑70 (MQ=255) tAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTCCGTAAAGATTaaaa > 1:1244993/1‑70 (MQ=255) tAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTCCGTAAAGATTaaaa > 1:1252981/1‑70 (MQ=255) tAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTCCGTAAAGATTaaaa > 1:4085843/1‑70 (MQ=255) tAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTCCGTAAAGATTaaaa > 1:1346784/1‑70 (MQ=255) tAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTCCGTAAAGATTaaaa > 1:3441532/1‑70 (MQ=255) aaaCCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTaaaa > 1:3215111/1‑52 (MQ=255) aaaCCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTaaaa > 1:310296/1‑52 (MQ=255) aaaCCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTaa < 1:4552576/50‑1 (MQ=255) aaaCCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAAACAGGCGGGTAAAAGTCCGTAAAGATTaaaaaa > 1:4175247/1‑71 (MQ=255) aaCCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTaa < 1:4334539/49‑1 (MQ=255) aaCCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTCCGTAAAGATTaaaaaa < 1:1019291/70‑1 (MQ=255) aaCCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTCCGTAAAGATTaaaaaa < 1:7384843/70‑1 (MQ=255) aCCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTaaaa > 1:661164/1‑50 (MQ=255) aCCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTCCGTAAAGATTAAAAAATc < 1:4865605/71‑1 (MQ=255) ccTTCCAGCAAGGggaaggtttaacctttatcacagccagtcaaaactgtcttaaa < 1:2376975‑M2/56‑44 (MQ=255) ccTTCCAGCAAGGggaaggtttaacctttatcacag < 1:2930333‑M2/36‑24 (MQ=255) cTTCCAGCAAGGggaaggtttaacctttatcacagcc > 1:6019106‑M2/1‑12 (MQ=255) ttCCAGCAAGGggaaggtttaacctttatcacagccagtcaaaact > 1:3035693‑M2/1‑11 (MQ=255) ttCCAGCAAGGggaaggtttaacctttatcacagccagtcaaaact > 1:2628282‑M2/1‑11 (MQ=255) ttCCAGCAAGGggaaggtttaacctttatcacagccagtcaaaact > 1:2774746‑M2/1‑11 (MQ=255) tCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTCCGTAAAGATTAAAAAATCGGCt > 1:2393043/1‑71 (MQ=255) ccAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTCCGTAAAGATTAAAAAATCGGCt > 1:5670046/1‑70 (MQ=255) aGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTCCGTAAAGATTAAAAAATCGGCTCGa < 1:3796709/71‑1 (MQ=255) gCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGGCCGTAAAGATTAAAAAATCGGCTCGAt < 1:3152928/71‑1 (MQ=255) cAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTCCGTAAAGATTAAAAAATCGGCTCGAt < 1:2988988/70‑1 (MQ=255) aGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTCCGTAAAGATTAAAAAATCGGCTCGATTTg < 1:3482980/71‑1 (MQ=255) | GTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTCCGTAAAGATTAAAAAATCGGCTCGATTTG > W3110S.gb/510593‑510731 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |