| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | = 2732870 | 73 (0.900) | 5 (0.070) | 4/92 | NT | 6.1% | intergenic (‑41/+89) | clpB/yfiH | protein disaggregation chaperone/conserved hypothetical protein |
| ? | W3110S.gb | = 2732887 | 85 (1.110) | intergenic (‑58/+72) | clpB/yfiH | protein disaggregation chaperone/conserved hypothetical protein | |||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
ATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATCACGCGTACCGGA > W3110S.gb/2732802‑2732940 | aTTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAAt < 1:3826418/71‑1 (MQ=255)aTTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAAt > 1:397265/1‑71 (MQ=255) tattaGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAg > 1:6178128/1‑71 (MQ=255) gTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCa < 1:645169/70‑1 (MQ=255) aGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATccc > 1:2122497/1‑71 (MQ=255) aGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATcc < 1:3210685/70‑1 (MQ=255) gACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCt > 1:4392485/1‑71 (MQ=255) cGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCt > 1:3981011/1‑69 (MQ=255) cGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCt > 1:1214375/1‑69 (MQ=255) aTCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCt < 1:1067488/67‑1 (MQ=255) aTCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCt < 1:1920836/67‑1 (MQ=255) aCGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCa < 1:156988/71‑1 (MQ=255) aCGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCa < 1:2771685/71‑1 (MQ=255) gCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATcc > 1:7615802/1‑57 (MQ=255) aTAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCa < 1:5392712/52‑1 (MQ=255) aTAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGt < 1:460947/71‑1 (MQ=255) aTAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGt < 1:7586624/71‑1 (MQ=255) aTAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGt > 1:6135110/1‑71 (MQ=255) tAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCaa < 1:4081001/59‑1 (MQ=255) tAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCaa < 1:2306073/59‑1 (MQ=255) tAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGtt < 1:2293087/71‑1 (MQ=255) tAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGtt < 1:3950112/71‑1 (MQ=255) tAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGtt < 1:2162383/71‑1 (MQ=255) tAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTAGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCaa < 1:7593604/59‑1 (MQ=255) aaCTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATc > 1:5166196/1‑52 (MQ=255) aCTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCACTCAATTATTCAAGGTTAt > 1:6510226/1‑71 (MQ=255) ctcctcCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCa < 1:1376437/55‑1 (MQ=255) ctcctcCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCa < 1:4864923/55‑1 (MQ=255) ctcctcCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCa < 1:4874220/55‑1 (MQ=255) ctcctcCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTAtt < 1:1574142/71‑1 (MQ=255) cctccCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGa > 1:2753666/1‑71 (MQ=255) cctccCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGa > 1:7019139/1‑71 (MQ=255) cctccCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGa > 1:686086/1‑71 (MQ=255) cctccCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGa > 1:7873647/1‑71 (MQ=255) ctccCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTg < 1:2593389/69‑1 (MQ=255) ctccCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGAc < 1:1097736/71‑1 (MQ=255) ctccCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGAc > 1:158141/1‑71 (MQ=255) ccATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAg < 1:4303492/71‑1 (MQ=255) cATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAttgagggatgacctcatt < 1:6098688‑M1/50‑19 (MQ=255) cATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAg < 1:6847093/70‑1 (MQ=255) tAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAttgagggatgacctcattta > 1:2938632‑M1/1‑30 (MQ=255) tAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTc < 1:2864737/38‑1 (MQ=255) aaCGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGAt > 1:1341033/1‑69 (MQ=255) aCGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATc > 1:7479840/1‑39 (MQ=255) aCGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATc > 1:915453/1‑39 (MQ=255) aCGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATc > 1:5456094/1‑39 (MQ=255) aCGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAAtta < 1:7918613‑M2/48‑4 (MQ=255) aCGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTa < 1:6061721/70‑1 (MQ=255) tgATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAattatt < 1:7209920/47‑1 (MQ=255) aTCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAttgagggatgacctca < 1:7110790‑M1/40‑17 (MQ=255) aTCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCTCTCAAt > 1:14008‑M2/1‑41 (MQ=255) aTCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAAt > 1:3788880‑M2/1‑41 (MQ=255) aTCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAAt > 1:7042052‑M2/1‑41 (MQ=255) aTCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAAt > 1:3547606‑M2/1‑41 (MQ=255) aTCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAAt > 1:3577087‑M2/1‑41 (MQ=255) aTCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTg < 1:1448124/57‑1 (MQ=255) tCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAttgagggatgacctca < 1:4420193‑M1/39‑17 (MQ=255) tCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAAtgtg > 1:1549208/1‑70 (MQ=255) tCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAAt < 1:1696862/67‑1 (MQ=255) tCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTga < 1:5013477/71‑1 (MQ=255) cAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGAc > 1:2433432/1‑57 (MQ=255) cAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTga > 1:5092531/1‑70 (MQ=255) aaaGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTtttt < 1:1051148/53‑1 (MQ=255) aaaGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAAtgt > 1:6844607/1‑67 (MQ=255) aGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTgaa > 1:7193253/1‑68 (MQ=255) aGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTgaa > 1:7906550/1‑68 (MQ=255) ttGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTgaaaagaa < 1:3737828/71‑1 (MQ=255) ttGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTgaaaagaa < 1:4125379/71‑1 (MQ=255) ttGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTgaaaagaa < 1:7367236/71‑1 (MQ=255) ttGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTgaaaagaa < 1:1109753/71‑1 (MQ=255) gCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCa > 1:1719187/1‑52 (MQ=255) gCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTgaaaagaaaa > 1:2096441/1‑71 (MQ=255) gCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTgaaaagaaaa > 1:2634797/1‑71 (MQ=255) cTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTgaaaagaaaa < 1:2464875/70‑1 (MQ=255) gagaTTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAgg < 1:6279377/35‑1 (MQ=255) gagaTTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAAt < 1:4706428/52‑1 (MQ=255) gagaTTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTga > 1:1356813/1‑56 (MQ=255) gagaTTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATCAcgcg > 1:1178736/1‑71 (MQ=255) gagaTTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATCAcgcg > 1:6418692/1‑71 (MQ=255) gagaTTAAATGAGGTCATCCCTCAAATATTCAAGGTTATTGACCAGATTAAt < 1:7008577/52‑1 (MQ=255) agaTTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATCAcgcg > 1:451252/1‑70 (MQ=255) aTTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGa < 1:1564350/39‑1 (MQ=255) aTTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGa < 1:2887294/39‑1 (MQ=255) aTTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGAcc < 1:3203396/41‑1 (MQ=255) ttAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATCACGCGTAcc > 1:1381090/1‑71 (MQ=255) ttAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATCACGCGTAc < 1:4968210/70‑1 (MQ=255) tAAttgagggatgacctcatttaatctccagtagcaactttgatccgt < 1:7918613‑M1/48‑46 (MQ=255) tAAATGAGGTCATCCCTCAAttaatctccagtagcaactttgatccgtta > 1:2938632‑M2/1‑20 (MQ=255) tAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGAtt < 1:637982/44‑1 (MQ=255) tAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAAt < 1:400436/47‑1 (MQ=255) tAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAAt < 1:1699802/47‑1 (MQ=255) tAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAAt < 1:1957548/47‑1 (MQ=255) tAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAAt < 1:2749414/47‑1 (MQ=255) aaaTGAGGTCATCCCTCAAttaatctccagtagcaactttgatccgttatgggaggagt > 1:3959435‑M2/1‑19 (MQ=255) attgagggatgacctcatttaatctccagtagcaactttgat > 1:3547606‑M1/1‑1 (MQ=255) attgagggatgacctcatttaatctccagtagcaactttgat > 1:7042052‑M1/1‑1 (MQ=255) attgagggatgacctcatttaatctccagtagcaactttgat > 1:3577087‑M1/1‑1 (MQ=255) attgagggatgacctcatttaatctccagtagcaactttgat > 1:3788880‑M1/1‑1 (MQ=255) aaTGAGGTCATCCCTCAAttaatctccagtagcaactttgatccgttatg < 1:6098688‑M2/50‑33 (MQ=255) aaTGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATCACGCGTACCGGa > 1:342873/1‑71 (MQ=255) | ATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATCACGCGTACCGGA > W3110S.gb/2732802‑2732940 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |