| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | = 2732870 | 73 (0.900) | 5 (0.070) | 4/92 | NT | 6.1% | intergenic (‑41/+89) | clpB/yfiH | protein disaggregation chaperone/conserved hypothetical protein |
| ? | W3110S.gb | = 2732887 | 85 (1.110) | intergenic (‑58/+72) | clpB/yfiH | protein disaggregation chaperone/conserved hypothetical protein | |||||
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
ACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATCACGCGTACCGGATCGTCTTGATTCTTTAG > W3110S.gb/2732824‑2732957 | aCGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCa < 1:2771685/71‑1 (MQ=255)aCGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCa < 1:156988/71‑1 (MQ=255) aTAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGt < 1:7586624/71‑1 (MQ=255) aTAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGt < 1:460947/71‑1 (MQ=255) tAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCaa < 1:4081001/59‑1 (MQ=255) tAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCaa < 1:2306073/59‑1 (MQ=255) tAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGtt < 1:3950112/71‑1 (MQ=255) tAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGtt < 1:2293087/71‑1 (MQ=255) tAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTAGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCaa < 1:7593604/59‑1 (MQ=255) cctccCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGa > 1:2753666/1‑71 (MQ=255) cctccCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGa > 1:7873647/1‑71 (MQ=255) cctccCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGa > 1:686086/1‑71 (MQ=255) cctccCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGa > 1:7019139/1‑71 (MQ=255) ctccCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTg < 1:2593389/69‑1 (MQ=255) ctccCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGAc > 1:158141/1‑71 (MQ=255) ctccCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGAc < 1:1097736/71‑1 (MQ=255) ccATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAg < 1:4303492/71‑1 (MQ=255) cATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAg < 1:4605440/70‑1 (MQ=255) cATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAg < 1:6847093/70‑1 (MQ=255) aaCGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGAt > 1:1341033/1‑69 (MQ=255) aCGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAAtta < 1:7918613‑M2/48‑4 (MQ=255) aCGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTa < 1:6061721/70‑1 (MQ=255) aTCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAAt > 1:7042052‑M2/1‑41 (MQ=255) aTCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAAt > 1:3577087‑M2/1‑41 (MQ=255) aTCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAAt > 1:3788880‑M2/1‑41 (MQ=255) aTCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTg < 1:1448124/57‑1 (MQ=255) tCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAAtgtg > 1:1549208/1‑70 (MQ=255) tCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAAt < 1:1696862/67‑1 (MQ=255) tCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTga < 1:5013477/71‑1 (MQ=255) cAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGAc > 1:2433432/1‑57 (MQ=255) cAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTga > 1:1896520/1‑70 (MQ=255) cAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTga > 1:5092531/1‑70 (MQ=255) aaaGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTtttt < 1:1051148/53‑1 (MQ=255) aaaGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAAtgt > 1:6844607/1‑67 (MQ=255) aGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTgaa > 1:7193253/1‑68 (MQ=255) ttGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTgaaaagaa < 1:1109753/71‑1 (MQ=255) ttGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTgaaaagaa < 1:4125379/71‑1 (MQ=255) ttGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTgaaaagaa < 1:7367236/71‑1 (MQ=255) gCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTgaaaagaaaa > 1:2634797/1‑71 (MQ=255) gCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTgaaaagaaaa > 1:2096441/1‑71 (MQ=255) cTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTgaaaagaaaa < 1:2464875/70‑1 (MQ=255) gagaTTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAgg < 1:6279377/35‑1 (MQ=255) gagaTTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAAt < 1:4706428/52‑1 (MQ=255) gagaTTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTga > 1:1356813/1‑56 (MQ=255) gagaTTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATCAcgcg > 1:6418692/1‑71 (MQ=255) agaTTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATCAcgcg > 1:451252/1‑70 (MQ=255) aTTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGa < 1:2887294/39‑1 (MQ=255) aTTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGa < 1:1564350/39‑1 (MQ=255) aTTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGAcc < 1:3203396/41‑1 (MQ=255) ttAAATGAGGTCATTCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATCACGCGTAcc > 1:3377346/1‑71 (MQ=255) ttAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATCACGCGTAcc > 1:1381090/1‑71 (MQ=255) ttAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATCACGCGTAc < 1:4968210/70‑1 (MQ=255) tAAATGAGGTCATCCCTCAAttaatctccagtagcaactttgatccgtta > 1:2938632‑M2/1‑20 (MQ=255) tAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGAtt < 1:637982/44‑1 (MQ=255) tAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAAt < 1:400436/47‑1 (MQ=255) tAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAAt < 1:1699802/47‑1 (MQ=255) aaaTGAGGTCATCCCTCAAttaatctccagtagcaactttgatccgttatgggaggagt > 1:3959435‑M2/1‑19 (MQ=255) aaTGAGGTCATCCCTCAAttaatctccagtagcaactttgatccgttatg < 1:6098688‑M2/50‑33 (MQ=255) aaTGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATCACGCGTACCGGa > 1:342873/1‑71 (MQ=255) aTGAGGACATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATCACGCGTACCGGAt > 1:1030100/1‑71 (MQ=255) tGAGGTCATCCCTCAAttaatctccagtagcaactttgat < 1:7110790‑M2/40‑25 (MQ=255) tGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGa > 1:4254020/1‑38 (MQ=255) tGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGa > 1:986102/1‑38 (MQ=255) tGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGa > 1:3639135/1‑38 (MQ=255) tGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGa > 1:2058295/1‑38 (MQ=255) tGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGa > 1:6737834/1‑38 (MQ=255) tGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGa > 1:2456234/1‑38 (MQ=255) tGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATCACGCGTACCGGATc > 1:5309972/1‑71 (MQ=255) tGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATCACGCGTACCGGATc > 1:2038218/1‑71 (MQ=255) aGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATCACGCGTACCGGATCGt < 1:6604949/71‑1 (MQ=255) ggTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATCACGCGTACCGGATCGTc < 1:1805833/71‑1 (MQ=255) cATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATCACGCGTACCGGa > 1:7278775/1‑63 (MQ=255) aTCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTgaaaagaa < 1:6832353/46‑1 (MQ=255) aTCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTgaaaagaa < 1:7905577/46‑1 (MQ=255) aTCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTgaaaagaa < 1:1854523/46‑1 (MQ=255) aTCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTgaaaagaa < 1:5788892/46‑1 (MQ=255) aTCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTga < 1:813517/40‑1 (MQ=255) tCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTgaaaagaa < 1:102724/45‑1 (MQ=255) cccTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATCa > 1:171123/1‑49 (MQ=255) ccTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATCACGCGTACCGGATCGTCtt < 1:6482297/66‑1 (MQ=255) ccTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATCACGCGTACCGGATCGTCtt < 1:3678288/66‑1 (MQ=255) ccTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATCACGCGTACCGGATCGTCTTGATTc < 1:3101737/71‑1 (MQ=255) ccTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATCACGCGTACCGGATCGTCTTGATTc < 1:183369/71‑1 (MQ=255) cTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATCa > 1:3084202/1‑47 (MQ=255) tCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATCAc < 1:6696616/47‑1 (MQ=255) tCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATCAc < 1:2050483/47‑1 (MQ=255) tCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATCACGCGTACCgg < 1:2192550/56‑1 (MQ=255) cAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTgaaaagaaa > 1:5485152/1‑41 (MQ=255) cAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATCACGCGTACCGGATCGTCTTGATTCtt > 1:6653363/1‑70 (MQ=255) aaTTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTgaaaagaa < 1:2244891/39‑1 (MQ=255) aaTTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTgaaaagaa < 1:994373/39‑1 (MQ=255) aaTTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAAt > 1:7331308/1‑42 (MQ=255) aaTTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAAt > 1:123628/1‑42 (MQ=255) aaTTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATCACGCGTACCGGATCGTCtt > 1:285099/1‑62 (MQ=255) aaTTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATCACGCGTACCGGATCGTCTTGATTCttt < 1:4334063/70‑1 (MQ=255) aaTTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATCACGCGTACCGGATCGTCTTGATTCttt < 1:3443824/70‑1 (MQ=255) aaTTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATCACGCGTACCGGATCGTCTTGATTCttt < 1:3542635/70‑1 (MQ=255) aaTTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATCACGCGTACCGGATCGTCTTGATTCttt < 1:367491/70‑1 (MQ=255) aaTTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATCACGCGTACCGGATCGTCTTGATTCttt < 1:6523214/70‑1 (MQ=255) aaTTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATCAACCGTACCGGATCGTCTTGATTCtt > 1:7394892/1‑69 (MQ=255) | ACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAGAAAATCACGCGTACCGGATCGTCTTGATTCTTTAG > W3110S.gb/2732824‑2732957 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |