| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | 3384262 = | 163 (2.000) | 7 (0.100) | 4/88 | NT | 5.4% | intergenic (‑139/‑296) | mdh/argR | malate dehydrogenase, NAD(P)‑binding/DNA‑binding transcriptional dual regulator, L‑arginine‑binding |
| ? | W3110S.gb | 3384285 = | 101 (1.380) | intergenic (‑162/‑273) | mdh/argR | malate dehydrogenase, NAD(P)‑binding/DNA‑binding transcriptional dual regulator, L‑arginine‑binding | |||||
Only 100 of 202 total aligned reads displayed.
TTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTATGCATTAGCGCAACATTCCAACAGGTGGTGA > W3110S.gb/3384192‑3384332 | ttGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGcc < 1:1284034/71‑1 (MQ=255) tgaacggtagggtatattgtcaccacctgttggaatgttgcgctaatgcataagcgactgttaattaCg > 1:3205971‑M1/68‑69 (MQ=255) cGTTTACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTaa < 1:2921409/71‑1 (MQ=255) tttACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAAt > 1:4339165/1‑70 (MQ=255) tttACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAAt > 1:720712/1‑70 (MQ=255) tACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAg > 1:7788207/1‑71 (MQ=255) tACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAg > 1:1603577/1‑71 (MQ=255) tACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAg > 1:6857810/1‑71 (MQ=255) cAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGa < 1:3523884/71‑1 (MQ=255) aaTGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGaa < 1:7011929/71‑1 (MQ=255) aTGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAAc > 1:4184849/1‑71 (MQ=255) tGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGaa > 1:7753227/1‑69 (MQ=255) tGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAAcc > 1:7165433/1‑71 (MQ=255) aCCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAAc > 1:2322990/1‑68 (MQ=255) aCCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCt < 1:4380653/70‑1 (MQ=255) aCCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCt < 1:5464667/70‑1 (MQ=255) atattgtcaccacctgttggaatgttgcgctaatgcataagcgactgttaattaCGTAATCAGGAACCTaa < 1:3503388‑M1/17‑1 (MQ=255) atattgtcaccacctgttggaatgttgcgctaatgcataagcgactgttaattaCGTAATCAGGAACCTaa < 1:1415935‑M1/17‑1 (MQ=255) acaTCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAgg > 1:5890118/1‑62 (MQ=255) caTCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACtt < 1:7144667/71‑1 (MQ=255) aTCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTa < 1:2209124/71‑1 (MQ=255) aTCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTa > 1:4497721/1‑71 (MQ=255) aTCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTa < 1:1860131/71‑1 (MQ=255) ctcAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACg > 1:4833223/1‑71 (MQ=255) ctcAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACg > 1:2495792/1‑71 (MQ=255) ctcAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACg > 1:3919178/1‑71 (MQ=255) ctcAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACg > 1:1126502/1‑71 (MQ=255) cAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGt > 1:2883372/1‑70 (MQ=255) aaGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGt < 1:3864705/48‑1 (MQ=255) aaGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAg < 1:638785/54‑1 (MQ=255) aaGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGt < 1:66595/69‑1 (MQ=255) aGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAAt < 1:5952400/71‑1 (MQ=255) gAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAAt > 1:882212/1‑49 (MQ=255) gAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAAtt < 1:5364633/71‑1 (MQ=255) gAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAAt < 1:1056300/70‑1 (MQ=255) acctgttggaatgttgcgctaatgcataagcgactgttaattaCGt > 1:5194259‑M1/44‑46 (MQ=255) acctgttggaatgttgcgctaatgcataagcgactgttaattaCGt > 1:1350005‑M1/44‑46 (MQ=255) gaTGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAAtt > 1:3482587/2‑70 (MQ=255) cctgttggaatgttgcgctaatgcataagcgactgttaattaCGTa < 1:7484137‑M1/4‑1 (MQ=255) aaTGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAAtt > 1:4732447/1‑70 (MQ=255) aTGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTaa > 1:7872638/1‑71 (MQ=255) tgtgTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATTAgg < 1:1173574/50‑1 (MQ=255) tgtgTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAgg < 1:4780306/50‑1 (MQ=255) gttggaatgttgcgctaatgcataagcgactgttaattac < 1:687797‑M1/1‑1 (MQ=255) gttggaatgttgcgctaatgcataagcgactgttaattac < 1:5226536‑M1/1‑1 (MQ=255) tgtAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAg < 1:1384468/71‑1 (MQ=255) gtAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTaa < 1:622505/67‑1 (MQ=255) gtAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACa < 1:6442460/69‑1 (MQ=255) gtAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACa < 1:7802189/69‑1 (MQ=255) tAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTc < 1:7067558/71‑1 (MQ=255) ggaatgttgcgctaatgcataagcgactgttaattac > 1:5514019‑M1/37‑37 (MQ=255) gTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGaa > 1:2619989/1‑46 (MQ=255) tCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATc < 1:3998601/40‑1 (MQ=255) cACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATc < 1:6533524/39‑1 (MQ=255) aCGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGt < 1:443941/65‑1 (MQ=255) aCGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCt < 1:7635932/69‑1 (MQ=255) aCGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCt < 1:5161312/69‑1 (MQ=255) cGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTAt < 1:5313862/71‑1 (MQ=255) gCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTaa < 1:2668795/46‑1 (MQ=255) gCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTAt > 1:6732041/1‑70 (MQ=255) gCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTATg > 1:1438314/1‑71 (MQ=255) cAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAAc > 1:3371046/1‑59 (MQ=255) aaGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTATGCa > 1:1217876/1‑71 (MQ=255) aaGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTATGCa > 1:5595058/1‑71 (MQ=255) gctaatgcataagcgactgttaattaCGTAATCAGGAACCTAACTTAc > 1:556826‑M1/27‑48 (MQ=255) gctaatgcataagcgactgttaattaCGTAATCAGGAACCTAACTTAc > 1:5234505‑M1/27‑48 (MQ=255) aGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTATGCAt < 1:6603272/71‑1 (MQ=255) tttAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTa > 1:1551350/1‑64 (MQ=255) tttAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTATGCAt < 1:3084363/69‑1 (MQ=255) taatgcataagcgactgttaattaCGTAATCAGGAACCTAACTTACGt < 1:7925409‑M1/24‑1 (MQ=255) tAGCGTTTTTGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTa > 1:6313407/1‑47 (MQ=255) tAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTa > 1:6285321/1‑47 (MQ=255) gCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTATGCATTAgcgc < 1:3278763/71‑1 (MQ=255) cGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTATGCATTAGCGCa < 1:422174/71‑1 (MQ=255) cGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTATGCATTAGCGCa < 1:1926112/71‑1 (MQ=255) cGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTATGCATTAGCGCa < 1:1797966/71‑1 (MQ=255) tttATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTATGCATTAGCGCagc < 1:5609038/71‑3 (MQ=255) ttATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTATGCATTAGCGCAACa > 1:2470421/1‑71 (MQ=255) tATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTATGCATTAGCGCAACAt > 1:5484926/1‑71 (MQ=255) tATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTATGCATTAGCGCAACAt > 1:2299520/1‑71 (MQ=255) tGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTATGCATTAGCGCAACATTc > 1:5380964/1‑71 (MQ=255) tGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTATGCATTAGCGCAACATTc > 1:2730071/1‑71 (MQ=255) cATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTATGCATTAGCGCAACATTCCa < 1:2888789/71‑1 (MQ=255) aTTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTATg < 1:2509163/52‑1 (MQ=255) ttAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTa > 1:5725934/1‑48 (MQ=255) ttAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTATGCATTAGCGCAACATTCCaa > 1:234509/1‑69 (MQ=255) tAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTa > 1:3628435/1‑47 (MQ=255) tAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTATGCATTAGCGCAACATTCCAACa < 1:5047612/70‑1 (MQ=255) tAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTATGCATTAGCGCAACATTCCAACAg > 1:5117574/1‑71 (MQ=255) tAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTATGCATTAGCGCAACATTCCAACAg > 1:4654189/1‑71 (MQ=255) tAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTATGCATTAGCGCAACATTCCAACAg > 1:4058163/1‑71 (MQ=255) tAATTGCAGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACACACGCt > 1:2136170/1‑45 (MQ=255) aTTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTATGCATTAGCGCAACATTCCAACAg < 1:1331321/69‑1 (MQ=255) aTTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTATGCATTAGCGCAACATTCCAACAg < 1:6815810/69‑1 (MQ=255) ttGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTc > 1:4591573/1‑39 (MQ=255) ttGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTATGCa > 1:3754011/1‑48 (MQ=255) ttGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTATGCa > 1:1001057/1‑48 (MQ=255) ttGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTATGCATTAGCGCAACATTCCAACAggtg > 1:4277785/1‑71 (MQ=255) gCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTATGCATTAGCGCAACATTCCAACAggtgg < 1:3667216/70‑1 (MQ=255) CGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTATGCATTAGCGCAACATTCCAACAg > 1:7267590‑M1/1‑64 (MQ=255) | TTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTATGCATTAGCGCAACATTCCAACAGGTGGTGA > W3110S.gb/3384192‑3384332 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |