| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | 3764493 = | 102 (1.250) | 6 (0.090) | 3/82 | NT | 7.5% | coding (487/657 nt) | yidX | predicted lipoproteinC |
| ? | W3110S.gb | 3764522 = | 63 (0.920) | coding (458/657 nt) | yidX | predicted lipoproteinC | |||||
Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
TGCCTCTGGGTGAATAGTATTCATAAAATCGCACTTTAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTACAGTGTTGAA > W3110S.gb/3764424‑3764561 | tGCCTCTGGGTGAATAGTATTCATAAAATCGCACTTTAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTaa > 1:3033385/1‑71 (MQ=255) ctctGGGTGAATAGTATTCATAAAATCGCACTTTAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATc > 1:7552472/1‑70 (MQ=255) aacgcattatggttttgcctgtggtgttcaacactgtaccaggtcactggaaaacctaaaaggcacAATcc > 1:1903239‑M1/67‑71 (MQ=255) tctGGGTGAATAGTATTCATAAAATCGCACTTTAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCa > 1:472854/1‑71 (MQ=255) cgcattatggttttgcctgtggtgttcaacactgtaccaggtcactggaaaacctaaaaggcacAATCCAt > 1:4000462‑M1/65‑71 (MQ=255) tGGGTGAATAGTATTCATAAAATCGCACTTTAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCa < 1:4467828/69‑1 (MQ=255) tGGGTGAATAGTATTCATAAAATCGCACTTTAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATg > 1:4342584/1‑71 (MQ=255) gcattatggttttgcctgtggtgttcaacactgtaccaggtcactggaaaacctaaaaggcacAATCCAt < 1:5675233‑M1/7‑1 (MQ=255) gggTGAATAGTATTCATAAAATCGCACTTTAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGt > 1:4262047/1‑71 (MQ=255) gggTGAATAGTATTCATAAAATCGCACTTTAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGt > 1:348765/1‑71 (MQ=255) cattatggttttgcctgtggtgttcaacactgtaccaggtcactggaaaacctaaaaggcacAATCCAt < 1:1361917‑M1/7‑1 (MQ=255) ggTGAATAGTATTCATAAAATCGCACTTTAAATGGATGGTAGCACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGtt > 1:5957629/1‑71 (MQ=255) ggTGAATAGTATTCATAAAATCGCACTTTAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGt < 1:1400665/70‑1 (MQ=255) attatggttttgcctgtggtgttcaacactgtaccaggtcactggaaaacctaaaaggcacAATCCAt < 1:1694462‑M1/7‑1 (MQ=255) attatggttttgcctgtggtcttcaacactgtaccaggtcactggaaaacctaaaaggcacAATCCa < 1:6713243‑M1/6‑1 (MQ=255) gAATAGTATTCATAAAATCGCACTTTAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGtttt > 1:5472960/1‑70 (MQ=255) aaTAGTATTCATAAAATCGCACTTTAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGttttt < 1:4944294/70‑1 (MQ=255) aTAGTATTCATAAAATCGCACTTTAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTAt < 1:5364287/71‑1 (MQ=255) tAGTATTCATAAAATCGCACTTTAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTAtt > 1:2659658/1‑71 (MQ=255) aGTATTCATAAAATCGCACTTTAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTAttt > 1:3372990/1‑71 (MQ=255) gTATTCATAAAATCGCACTTTAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTAtttt > 1:7906945/1‑71 (MQ=255) gTATTCATAAAATCGCACTTTAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTAttt < 1:7317084/70‑1 (MQ=255) tATTCATAAAATCGCACTTTAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGtt < 1:3723240/62‑1 (MQ=255) tATTCATAAAATCGCACTTTAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTAtttt > 1:2690033/1‑70 (MQ=255) aTTCATAAAATCGCACTTTAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTa > 1:5648236/1‑52 (MQ=255) aTTCATAAAATCGCACTTTAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTa > 1:6757829/1‑52 (MQ=255) gcctgtggtgttcaacactgtaccaggtcactggaaaacctaaaaggcaca > 1:897827‑M1/51‑51 (MQ=255) gcctgtggtgttcaacactgtaccaggtcactggaaaacctaaaaggcaca > 1:4246175‑M1/51‑51 (MQ=255) aTAAAATCGCACTTTAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCAt > 1:1540086/1‑71 (MQ=255) aTAAAATCGCACTTTAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCAt > 1:4617068/1‑71 (MQ=255) aTAAAATCGCACTTTAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCAt > 1:5468023/1‑71 (MQ=255) tAAAATCGCACTTTAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATcc < 1:6130709/51‑1 (MQ=255) tAAAATCGCACTTTAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATcc < 1:6102680/51‑1 (MQ=255) aaaaTCGCACTTTAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCaag > 1:1714258/1‑68 (MQ=255) aaaaTCGCACTTTAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATg > 1:574676/1‑70 (MQ=255) aaaTCGCACTTTAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATgg < 1:7635396/70‑1 (MQ=255) aaTCGCACTTTAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGAt > 1:3213232/1‑71 (MQ=255) aTCGCACTTTAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGAtt < 1:1833982/71‑1 (MQ=255) gCACTTTAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATtgtg > 1:3308658/1‑71 (MQ=255) gCACTTTAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATtgt < 1:231320/70‑1 (MQ=255) aacactgtaccaggtcactggaaaacctaaaaggcacAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGAtt > 1:4600807‑M1/38‑66 (MQ=255) aacactgtaccaggtcactggaaaacctaaaaggcacAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGAtt > 1:969466‑M1/38‑66 (MQ=255) aacactgtaccaggtcactggaaaacctaaaaggcacAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGAtt > 1:3096700‑M1/38‑66 (MQ=255) cTTTAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCt > 1:1388396/1‑71 (MQ=255) acactgtaccaggtcactggaaaacctaaaaggcacAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATtg < 1:4264682‑M1/30‑1 (MQ=255) tttAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTa < 1:1231545/49‑1 (MQ=255) tttAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTa < 1:499768/49‑1 (MQ=255) tttAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGAt < 1:6398327/63‑1 (MQ=255) tttAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCtt > 1:1011034/1‑71 (MQ=255) ttAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCAt > 1:5711821/1‑58 (MQ=255) ttAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCttt > 1:7176899/1‑71 (MQ=255) actgtaccaggtcactggaaaacctaaaaggcacAATCCa < 1:7666212‑M1/6‑1 (MQ=255) actgtaccaggtcactggaaaacctaaaaggcacAATCCa < 1:165519‑M1/6‑1 (MQ=255) tAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGAtt > 1:2827786/1‑62 (MQ=255) tAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATtg > 1:6645826/1‑63 (MQ=255) tAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCttt < 1:2416793/70‑1 (MQ=255) tAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCttt > 1:3305388/1‑70 (MQ=255) tAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCttt < 1:4889614/70‑1 (MQ=255) tAAATGGATGGTAGAACGCCAT‑ACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCtttt < 1:5738262/70‑1 (MQ=255) aaaTGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCtttt < 1:4568296/70‑1 (MQ=255) aaaTGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCtttt < 1:6573473/70‑1 (MQ=255) aaaTGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCtttt < 1:5508470/70‑1 (MQ=255) atggatggTAGAACGCCATAACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAgg > 1:1677256/1‑71 (MQ=255) ccaggtcactggaaaacctaaaaggcacAATCCATGTTTTTATTTTTCTCAt > 1:1156296‑M1/29‑52 (MQ=255) tggTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTc < 1:3843631/71‑1 (MQ=255) ggTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTAtt < 1:2052424/40‑1 (MQ=255) gTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTc > 1:3889655/1‑69 (MQ=255) gAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTtctc < 1:6483757/42‑1 (MQ=255) gAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTtctc < 1:7530255/42‑1 (MQ=255) gAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATtgtg > 1:1278683/1‑52 (MQ=255) gAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATtgtg > 1:1072373/1‑52 (MQ=255) gAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGtt > 1:2725634/1‑63 (MQ=255) gAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTg < 1:7005716/71‑1 (MQ=255) gAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTg < 1:361840/71‑1 (MQ=255) aaCGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGAt < 1:4905479/47‑1 (MQ=255) aaCGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGAt < 1:3941949/47‑1 (MQ=255) aaCGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTg < 1:5433646/70‑1 (MQ=255) aCGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTAttttt < 1:3167412/37‑1 (MQ=255) cGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATtg > 1:5071261/1‑47 (MQ=255) cGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATtg > 1:6776926/1‑47 (MQ=255) cGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAgg > 1:7925387/1‑58 (MQ=255) cGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAgg > 1:523727/1‑58 (MQ=255) gCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCt > 1:7375969/1‑71 (MQ=255) gCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCt < 1:3593531/71‑1 (MQ=255) aTCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATg < 1:3180130/38‑1 (MQ=255) aTCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGtttt > 1:103853/1‑58 (MQ=255) tCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTc < 1:7091448/58‑1 (MQ=255) tCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTc < 1:6377879/58‑1 (MQ=255) tCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTc < 1:592869/58‑1 (MQ=255) tCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTc < 1:583613/58‑1 (MQ=255) tCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTa > 1:2330109/1‑71 (MQ=255) cACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAg > 1:4753534/1‑60 (MQ=255) aCCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTa > 1:3473609/1‑69 (MQ=255) ttGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGtttt > 1:4108909/1‑51 (MQ=255) tGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTCACCTGGTACAgtg < 1:2642152/69‑1 (MQ=255) gAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAg < 1:2046240/53‑1 (MQ=255) gAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAg < 1:2312848/53‑1 (MQ=255) gTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTg > 1:6188527/1‑53 (MQ=255) tAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTa < 1:4766698/60‑1 (MQ=255) tAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTACAg < 1:1697340/63‑1 (MQ=255) | TGCCTCTGGGTGAATAGTATTCATAAAATCGCACTTTAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTACAGTGTTGAA > W3110S.gb/3764424‑3764561 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |