| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | 3764493 = | 102 (1.250) | 6 (0.090) | 3/82 | NT | 7.5% | coding (487/657 nt) | yidX | predicted lipoproteinC |
| ? | W3110S.gb | 3764522 = | 63 (0.920) | coding (458/657 nt) | yidX | predicted lipoproteinC | |||||
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
GCACTTTAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTACAGTGTTGAACACCACAGGCAAAACCATAATGCGTT > W3110S.gb/3764454‑3764587 | gCACTTTAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATtgtg > 1:3308658/1‑71 (MQ=255)gCACTTTAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATtgt < 1:231320/70‑1 (MQ=255) cTTTAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCt > 1:5773162/1‑71 (MQ=255) cTTTAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCt > 1:1388396/1‑71 (MQ=255) acactgtaccaggtcactggaaaacctaaaaggcacAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATtg < 1:4264682‑M1/30‑1 (MQ=255) tttAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCtt > 1:1011034/1‑71 (MQ=255) ttAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCttt > 1:7176899/1‑71 (MQ=255) ttAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCttt > 1:1676951/1‑71 (MQ=255) tAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATtg > 1:6645826/1‑63 (MQ=255) tAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCttt < 1:2416793/70‑1 (MQ=255) tAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCttt < 1:4889614/70‑1 (MQ=255) tAAATGGATGGTAGAACGCCAT‑ACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCtttt < 1:5738262/70‑1 (MQ=255) aaaTGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCtttt < 1:4568296/70‑1 (MQ=255) aaaTGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCtttt < 1:6573473/70‑1 (MQ=255) aaaTGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCtttt < 1:1133818/70‑1 (MQ=255) aaaTGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCtttt < 1:3960383/70‑1 (MQ=255) aaTGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTa < 1:3411978/70‑1 (MQ=255) atggatggTAGAACGCCATAACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAgg > 1:1677256/1‑71 (MQ=255) gatggTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGttt < 1:5450172/71‑1 (MQ=255) tggTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTc < 1:3843631/71‑1 (MQ=255) tggTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTc < 1:3741775/71‑1 (MQ=255) gTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTcc < 1:309868/70‑1 (MQ=255) gTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTc > 1:3889655/1‑69 (MQ=255) gAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATtgtg > 1:1072373/1‑52 (MQ=255) gAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATtgtg > 1:1278683/1‑52 (MQ=255) gAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTg < 1:361840/71‑1 (MQ=255) gAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTg < 1:7005716/71‑1 (MQ=255) aaCGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTg < 1:5433646/70‑1 (MQ=255) aaCGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGa > 1:5603133/1‑71 (MQ=255) cGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATtg > 1:6786262/1‑47 (MQ=255) cGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATtg > 1:5071261/1‑47 (MQ=255) cGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATtg > 1:6776926/1‑47 (MQ=255) cGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAgg > 1:523727/1‑58 (MQ=255) cGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAgg > 1:7925387/1‑58 (MQ=255) cGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGAcc < 1:2665225/71‑1 (MQ=255) gCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCt > 1:7375969/1‑71 (MQ=255) gCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCt < 1:3593531/71‑1 (MQ=255) ccATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCttt < 1:1949809/52‑1 (MQ=255) aTCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGtttt > 1:103853/1‑58 (MQ=255) tCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTc < 1:6377879/58‑1 (MQ=255) tCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTc < 1:7091448/58‑1 (MQ=255) tCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTc < 1:583613/58‑1 (MQ=255) tCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTa > 1:4272922/1‑71 (MQ=255) tCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTa > 1:2330109/1‑71 (MQ=255) cACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAg > 1:4753534/1‑60 (MQ=255) aCCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTa > 1:3473609/1‑69 (MQ=255) ttGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGtttt > 1:4108909/1‑51 (MQ=255) ttGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTACAgtgt > 1:3239830/1‑71 (MQ=255) tGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTCACCTGGTACAgtg < 1:2642152/69‑1 (MQ=255) gAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAg < 1:745353/53‑1 (MQ=255) gAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAg < 1:2046240/53‑1 (MQ=255) aGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTACAGTGTTg < 1:211232/70‑1 (MQ=255) gTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTg > 1:6188527/1‑53 (MQ=255) tAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTa < 1:4766698/60‑1 (MQ=255) tAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTACAg < 1:1697340/63‑1 (MQ=255) tAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTACAGTGTTGaa > 1:4579085/1‑70 (MQ=255) caatccatgagaaaaataaaaacatggattGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTACAgtgt < 1:4264682‑M2/36‑1 (MQ=255) aatccatgagaaaaataaaaacatggattGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTACAGTGtt > 1:969466‑M2/30‑66 (MQ=255) aatccatgagaaaaataaaaacatggattGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTACAGTGtt > 1:3096700‑M2/30‑66 (MQ=255) aatccatgagaaaaataaaaacatggattGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTACAGTGTTg > 1:6552291‑M2/30‑67 (MQ=255) ATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTACAGTGTTGAacac < 1:3708916‑M1/71‑1 (MQ=255) TCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGt > 1:1244554‑M1/1‑56 (MQ=255) CCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCa < 1:2787198‑M1/45‑1 (MQ=255) CCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGAc < 1:54052‑M1/50‑1 (MQ=255) CCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTACAGTGTTGAAcacca < 1:6483674‑M1/71‑1 (MQ=255) atgagaaaaataaaaacatggattGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTgg > 1:1156296‑M2/25‑52 (MQ=255) ATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTACAGTGTTGAAcacca < 1:1655555‑M1/69‑1 (MQ=255) ATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTACAGTGTTGAACACcaca > 1:6398286‑M1/1‑71 (MQ=255) TGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTACAGTGTTGAACACCACAg > 1:530886‑M1/1‑71 (MQ=255) TGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTACAGTGTTGAACACCACAg > 1:7099228‑M1/1‑71 (MQ=255) GTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGt < 1:5860154‑M1/43‑1 (MQ=255) GTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGAc > 1:2393214‑M1/1‑46 (MQ=255) GTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTa > 1:5981018‑M1/1‑52 (MQ=255) GTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTACAGTGTTGAACACCACAgg < 1:7253345‑M1/71‑1 (MQ=255) tttttATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTACAGTGTTGAACACCACAGGc < 1:3074449/71‑1 (MQ=255) tttttATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTACAGTGTTGAACACCACAGGc < 1:6730375/71‑1 (MQ=255) ttATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTACAGTGTTGAACACCACAGGCaa > 1:2880831/1‑70 (MQ=255) tATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCa > 1:5833143/1‑36 (MQ=255) tATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCa > 1:3418285/1‑36 (MQ=255) tATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCa > 1:4840193/1‑36 (MQ=255) tttCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGCCCTGGTACAgtgt > 1:4504814/1‑49 (MQ=255) tttCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTgg > 1:4770641/1‑41 (MQ=255) tttCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTACAgtgt > 1:2555852/1‑49 (MQ=255) tttCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTACAgtgt > 1:5006150/1‑49 (MQ=255) tttCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTACAGTGTTGAACACcaca > 1:891686/1‑60 (MQ=255) tttCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTACAGTGTTGAACACcaca > 1:7852857/1‑60 (MQ=255) ttCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTACAGTGTTGAACACCACAGGCAAAACCAt < 1:2952092/70‑1 (MQ=255) atggattGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTACAGTGTTGAACACCACAGGCAAAACCATAATg < 1:1361917‑M2/62‑1 (MQ=255) atggattGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTACAGTGTTGAACACCACAGGCAAAACCATAATGc < 1:5675233‑M2/63‑1 (MQ=255) atggattGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTACAGTGTTGAACACCACAGGCAAAACCATAATGCg > 1:4000462‑M2/8‑71 (MQ=255) tggattGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTACAgt < 1:165519‑M2/34‑1 (MQ=255) tggattGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTACAgt < 1:7666212‑M2/34‑1 (MQ=255) tggattGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTACAGTGTTGAAGACCACAGGCAAAACCATAAt < 1:6713243‑M2/61‑1 (MQ=255) ggattGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTACAGTGTTGAACACCACAGGCAAAACCATAATGCGtt > 1:1311075‑M2/6‑71 (MQ=255) ggattGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTACAGTGTTGAACACCACAGGCAAAACCATAATGCGtt > 1:1903239‑M2/6‑71 (MQ=255) tGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTACAGTGTTGAACACCACAGGc > 1:4749586‑M2/2‑51 (MQ=255) tGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTACAGTGTTGAACACCACAGGc > 1:4246175‑M2/2‑51 (MQ=255) tGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTACAGTGTTGAACACCACAGGc > 1:897827‑M2/2‑51 (MQ=255) gtgCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTACAGTGTTGAACACCACAGGCAAAACCAt > 1:6021157/1‑58 (MQ=255) gtgCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTACAGTGTTGAACACCACAGGCAAAACCAt > 1:1745815/1‑58 (MQ=255) | GCACTTTAAATGGATGGTAGAACGCCATCACCTTTGAGTAATCCATGTTTTTATTTTTCTCATGGATTGTGCCTTTTAGGTTTTCCAGTGACCTGGTACAGTGTTGAACACCACAGGCAAAACCATAATGCGTT > W3110S.gb/3764454‑3764587 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |