| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | 4057522 = | 108 (1.330) | 7 (0.100) | 5/86 | NT | 8.1% | coding (1033/1179 nt) | yhhZ | conserved hypothetical protein |
| ? | W3110S.gb | 4057548 = | 65 (0.910) | coding (1007/1179 nt) | yhhZ | conserved hypothetical protein | |||||
Only 100 of 160 total aligned reads displayed.
CTTTCACCTACTAATATTCCCTTAGCTATTCGTGATTGCATGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAATCATTAGTACCACCATCATCTAGAGATAGTTTATGGTGAACAT > W3110S.gb/4057452‑4057590 | gaaagggcaatgttcctctaaattataatgttcaccataaactatctctagatgatggtggtactaatgat > 1:4595160‑M1/71‑71 (MQ=255)gaaagggcaatgttcctctaaattataatgttcaccataaactatctctagatgatggtggtactaatgat > 1:7223968‑M1/71‑71 (MQ=255)gaaagggcaatgttcctctaaattataatgttcaccataaactatctctagatgatggtggtactaatgat > 1:6768864‑M1/71‑71 (MQ=255)gaaagggcaatgttcctctaaattataatgttcaccataaactatctctagatgatggtggtactaatgat > 1:6363688‑M1/71‑71 (MQ=255)cTTTCACCTACTAATATTCCCTTAGCTATTCGTGATTGCATGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGtt < 1:2772795/71‑1 (MQ=255) aaagggcaatgttcctctaaattataatgttcaccataaactatctctagatgatggtggtactaatgatt < 1:3390373‑M1/2‑1 (MQ=255) aaagggcaatgttcctctaaattataatgttcaccataaactatctctagatgatggtggtactaatgatt > 1:4509870‑M1/70‑71 (MQ=255) tCACCTACTAATATTCCCTTAGCTATTCGTGATTGCATGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGttt < 1:5488379/69‑1 (MQ=255) tCACCTACTAATATTCCCTTAGCTATTCGTGATTGCATGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTc > 1:3787848/1‑71 (MQ=255) tCACCTACTAATATTCCATTAGCTATTCGTGATTGCATGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGtttt < 1:6681283/70‑1 (MQ=255) gtgcaatgttcctctaaattataatgttcaccataaactatctctagatgatggtggtactaatgat > 1:7351842‑M1/67‑67 (MQ=255) cacaTACTAATATTCCCTTAGCTATTCGTGATTGCATGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTc < 1:6747994/70‑1 (MQ=255) aCCTACTAATATTCCCTTAGCTATTCGTGATTGCATGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCg < 1:4168815/70‑1 (MQ=255) ctactaATATTCCCTTAGCTATTCGTGATTGCATGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCGAtt < 1:3855930/71‑1 (MQ=255) ttcctctaaattataatgttcaccataaactatctctagatgatggtggtactaatgaTTTCg < 1:1432702‑M1/5‑1 (MQ=255) aaTATTCCCTTAGCTATTCGTGATTGCATGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTaa > 1:606422/1‑68 (MQ=255) aaTATTCCCTTAGCTATTCGTGATTGCATGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTaa > 1:5128434/1‑68 (MQ=255) aaTATTCCCTTAGCTATTCGTGATTGCATGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTaa > 1:1135252/1‑68 (MQ=255) tatTCCCTTAGCTATTCGTGATTGCATGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTa < 1:1483621/65‑1 (MQ=255) tatTCCCTTAGCTATTCGTGATTGCATGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTa < 1:5831741/65‑1 (MQ=255) tatTCCCTTAGCTATTCGTGATTGCATGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTa < 1:2547812/65‑1 (MQ=255) atTCCCTTAGCTATTCGTGATTGCATGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTa > 1:6432498/1‑70 (MQ=255) tCCCTTAGCTATTCGTGATTGCATGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAAt > 1:7439877/1‑71 (MQ=255) ccTTAGCTATTCGTGATTGCATGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAAttt < 1:2418657/71‑1 (MQ=255) ccTTAGCTATTCGTGATTGCATGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAAttt < 1:1471327/71‑1 (MQ=255) ccTTAGCTATTCGTGATTGCATGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAAttt > 1:2412883/1‑71 (MQ=255) ttAGCTATTCGTGATTGCATGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGtt > 1:294215/1‑50 (MQ=255) ttAGCTATTCGTGATTGCATGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTc > 1:177982/1‑71 (MQ=255) tAGCTATTCGTGATTGCATGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTc > 1:5436826/1‑52 (MQ=255) cTATTCGTGATTGCATGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCg < 1:6528507/50‑1 (MQ=255) cTATTCGTGATTGCATGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCg < 1:1541536/68‑1 (MQ=255) cTATTCGTGATTGCATGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTATCGaaa < 1:12348/71‑1 (MQ=255) tATTCGTGATTGCATGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAAt > 1:4959290/1‑71 (MQ=255) aatgttcaccataaactatctctagatgatggtggtactaatgaTTTCGATTAATACTAAATTTTCGaaa > 1:6502564‑M1/45‑70 (MQ=255) aTTCGTGATTGCATGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCGAt > 1:4423459/1‑50 (MQ=255) aTTCGTGATTGCATGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCGAt > 1:1968603/1‑50 (MQ=255) ttCGTGATTGCATGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAAt < 1:1956547/69‑1 (MQ=255) ttCGTGATTGCATGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAAt < 1:2506264/69‑1 (MQ=255) ttCGTGATTGCATGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAAt < 1:3360321/69‑1 (MQ=255) ttCGTGATTGCATGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAATc < 1:7885006/70‑1 (MQ=255) ttCGTGATTGCATGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAATc < 1:3997355/70‑1 (MQ=255) ttCGTGATTGCATGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAATCa > 1:2580429/1‑71 (MQ=255) cGTGATTGCATGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAATCAt < 1:1554002/70‑1 (MQ=255) gTGATTGCATGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAATCAtt < 1:2210378/70‑1 (MQ=255) gTGATTGCATGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAATCAtt < 1:3738548/70‑1 (MQ=255) gTGATTGCATGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAATCAt > 1:3067765/1‑69 (MQ=255) tGATTGCATGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCg < 1:3476/43‑1 (MQ=255) tGATTGCATGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCg < 1:1578394/43‑1 (MQ=255) tGATTGCATGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAATCATTAg > 1:5784475/1‑71 (MQ=255) ccataaactatctctagatgatggtggtactaatgaTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAATCAtt > 1:3296098‑M1/37‑67 (MQ=255) aTTGCATGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAATc < 1:5759108/64‑1 (MQ=255) aTTGCATGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAATc < 1:4466554/64‑1 (MQ=255) ttGCATGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAATCATTAGTac > 1:3341099/1‑71 (MQ=255) tGCATGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGaa < 1:5731122/59‑1 (MQ=255) ataaactatctctagatgatggtggtactaatgtTTTCGATTAATACTAAATTTTCGaaa < 1:7335011‑M1/26‑1 (MQ=255) taaactatctctagatgatggtggtactaatgaTTTCGATTAATACTAAATTTTCGaa < 1:4327385‑M1/25‑1 (MQ=255) gCATGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGaa < 1:3911691/58‑1 (MQ=255) aTGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAATCATTa > 1:1907790/1‑63 (MQ=255) tGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCGa < 1:3435051/36‑1 (MQ=255) gTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCGAtt > 1:3224386/1‑37 (MQ=255) gTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAATCATTAGTACCACcat > 1:7125917/1‑71 (MQ=255) ttAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAATCAtt < 1:4264035/59‑1 (MQ=255) ttAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAATCATTAGTACCACcatc < 1:4449948/71‑1 (MQ=255) ttAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAATCATTAGTACCACcatc < 1:620294/71‑1 (MQ=255) ttAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAATCATTAGTACCACcatc < 1:3705829/71‑1 (MQ=255) aGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAATCATTAGTACCACcatca < 1:3478240/70‑1 (MQ=255) gTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAAttt < 1:6356275/45‑1 (MQ=255) gTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAATCATTAGTACCACCatcatc < 1:6154087/71‑1 (MQ=255) gTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAATCATTAGTACCACCatcatc > 1:7320457/1‑71 (MQ=255) aaaaCTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGaaa > 1:3451673/1‑48 (MQ=255) aaaaCTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAATCAt > 1:3846130/1‑52 (MQ=255) aaaaCTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAATCATTAGTACCACCatcatc > 1:1214192/1‑68 (MQ=255) aaaaCTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAATCATTAGTACCACCatcatc > 1:5195633/1‑68 (MQ=255) aaaCTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAATCATTAGTACCACCATCATCTa > 1:6038021/1‑69 (MQ=255) aaaCTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAATCATTAGTACCACCATCATCTa > 1:6046750/1‑69 (MQ=255) aaaCTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAATCATTAGTACCACCATCATCTa > 1:2277719/1‑69 (MQ=255) aaCTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAAtta > 1:6895493/1‑39 (MQ=255) cTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGaa < 1:7871096/43‑1 (MQ=255) cTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGaa < 1:7220163/43‑1 (MQ=255) cTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAATCATTAGTac < 1:2447344/54‑1 (MQ=255) ttATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAAt < 1:101944/43‑1 (MQ=255) tATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAATCATTAGTACCACCATCATCTAgaga > 1:4192598/1‑67 (MQ=255) tggtactaatgaTTTCGATTAATACTAAATTTTCGaaa > 1:7099335‑M1/13‑38 (MQ=255) gATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAATCATTAGTACCACCATCATCTAGAGATAGTTTa > 1:792791/1‑71 (MQ=255) atatGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAATCATTAGTACCACCATCATCTAGAGATAGTTTa < 1:7587439/70‑1 (MQ=255) atatGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAATCATTAGTACCACCATCATCTAGAGATAGTTTa < 1:881331/70‑1 (MQ=255) tatGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAATCATTAGTACCACcatca < 1:6867718/54‑1 (MQ=255) atGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAATCATTAGTaccac > 1:2411160/1‑48 (MQ=255) atGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAATCATTAGTaccac > 1:4029158/1‑48 (MQ=255) atGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAATCATTAGTACCACCATCATCTAgaga < 1:5676215/61‑1 (MQ=255) ggTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAATCATTAGTACCACCATCATCTAGAGATAGt < 1:6490205/63‑1 (MQ=255) gTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAATCATTAGTACCACCATCATCTAGAGATAGTTTATGGTg < 1:7441714/70‑1 (MQ=255) gTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAATCATTAGTACCACCATCATCTAGAGATAGTTTATGGTg < 1:7911973/70‑1 (MQ=255) ttCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAATCATTAGTacca < 1:718290/43‑1 (MQ=255) ttCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAATCATTAGTACCACCATCATCTAGAGATAGTTTATGGTGaa < 1:3407343/71‑1 (MQ=255) tCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAATCATTAGTACCACCATCATCTAGAGATAGTTTATg > 1:3037025/1‑65 (MQ=255) cGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAATCATTAGTACCACCatcatc < 1:4582437/49‑1 (MQ=255) gTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAATCATTAGTACCACCATCATCTAGAGATAGTTTATGGTGAACAt < 1:6497646/71‑1 (MQ=255) ttttCGATTAATACTAAATTTTCGAAATCATTAGTACCACCATCATCTAGAGATAGTTTATGGt < 1:2141788/64‑1 (MQ=255) ttttCGATTAATACTAAATTTTCGAAATCATTAGTACCACCATCATCTAGAGATAGTTTATGGTGAACAt > 1:2873262/1‑70 (MQ=255) | CTTTCACCTACTAATATTCCCTTAGCTATTCGTGATTGCATGTTAGTAAAAACTTTATGATATGGTTCGTTTTCGATTAATACTAAATTTTCGAAATCATTAGTACCACCATCATCTAGAGATAGTTTATGGTGAACAT > W3110S.gb/4057452‑4057590 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |