New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | W3110S.gb | = 846152 | 69 (0.850) | 7 (0.110) +TTTATGCGTTT |
3/76 | NT | 10.2% | intergenic (‑250/+11) | ybiO/glnQ | predicted mechanosensitive channel/glutamine transporter subunit |
? | W3110S.gb | 2944517 = | 90 (1.110) | intergenic (‑19/+220) | ygdL/mltA | conserved hypothetical protein/membrane‑bound lytic murein transglycosylase A |
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
GCTGTGCCACCAAAACGCTGACGCCATGCATCACTAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTAAACGCATAAATGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACATAACTC > W3110S.gb/2944449‑2944587 | cTGTGCCACCAAAACGCTGACGCCATGCATCACTAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAggg > 1:7599064/1‑71 (MQ=255) gtgCCACCAAAACGCTGACGCCATGCATCACTAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGc > 1:6590683/1‑70 (MQ=255) tgCCACCAAAACGCTGACGCCATGCATCACTAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGc < 1:2512143/69‑1 (MQ=255) tgCCACCAAAACGCTGACGCCATGCATCACTAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGa < 1:1110391/71‑1 (MQ=255) ccaccaAAACGCTGACGCCATGCATCACTAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAgg > 1:7430951/1‑71 (MQ=255) accaAAACGCTGACGCCATGCATCACTAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAg > 1:2144983/1‑62 (MQ=255) accaAAACGCTGACGCCATGCATCACTAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGt > 1:1177184/1‑70 (MQ=255) caAAACGCTGACGCCATGCATCACTAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGc < 1:2803476/63‑1 (MQ=255) caAAACGCTGACGCCATGCATCACTAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTa > 1:7829349/1‑70 (MQ=255) caAAACGCTGACGCCATGCATCACTAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTAt > 1:7092598/1‑71 (MQ=255) caAAACGCTGACGCCATGCATCACTAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTAt < 1:22666/71‑1 (MQ=255) caAAACGCTGACGCCATGCATCACTAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTAt > 1:1031054/1‑71 (MQ=255) caAAACGCTGACGCCATGCATCACTAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTAt > 1:542234/1‑71 (MQ=255) caAAACGCTGACGCCATGCATCACTAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTAt > 1:4953475/1‑71 (MQ=255) aaaCGCTGACGCCATGCATCACTAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATcc < 1:7021232/71‑1 (MQ=255) aaaCGCTGACGCCATGCATCACTAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATcc > 1:1697734/1‑71 (MQ=255) aCGCTGACGCCATGCATCACTAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCt > 1:1453826/1‑71 (MQ=255) cGCTGACGCCATGCATCACTAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCt > 1:6303573/1‑70 (MQ=255) gCTGACGCCATGCATCACTAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCa < 1:1285302/71‑1 (MQ=255) gCTGACGCCATGCATCACTAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCa < 1:5846563/71‑1 (MQ=255) cTGACGCCATGCATCACTAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCg < 1:1671911/57‑1 (MQ=255) tGACGCCATGCATCACTAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTAt > 1:671442/1‑63 (MQ=255) tGACGCCATGCATCACTAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTAt > 1:2651647/1‑63 (MQ=255) gACGCCATGCATCACTAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCAcc > 1:6789007/1‑70 (MQ=255) aCGCCATGCATCACTAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGtt < 1:4477584/59‑1 (MQ=255) aCGCCATGCATCACTAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGtt < 1:4029945/59‑1 (MQ=255) aCGCCATGCATCACTAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCAccc > 1:396073/1‑70 (MQ=255) aCGCCATGCATCACTAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCAccc > 1:4449316/1‑70 (MQ=255) aCGCCATGCATCACTAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCAccc > 1:2471558/1‑70 (MQ=255) aCGCCATGCATCACTAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCAccc > 1:1854227/1‑70 (MQ=255) aCGCCATGCATCACTAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCt < 1:5193785/71‑1 (MQ=255) gCCATGCATCACTAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCt < 1:3755356/63‑1 (MQ=255) ccATGCATCACTAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTaaaaa < 1:1921318/46‑1 (MQ=255) cATGCATCACTAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTAAAc > 1:1556785/1‑71 (MQ=255) cATGCATCACTAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTAAAc > 1:5605152/1‑71 (MQ=255) aTGCATCACTAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTaaaaa > 1:4545668/1‑44 (MQ=255) tGCATCACTAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTAAACGc < 1:3712770/71‑1 (MQ=255) tGCATCACTAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTAAACGc < 1:338882/71‑1 (MQ=255) gCATCACTAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCg < 1:2761157/47‑1 (MQ=255) tCACTAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGa < 1:2989877/45‑1 (MQ=255) tCACTAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTAAACGCATaa < 1:7082381/71‑1 (MQ=255) aCTAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAgg > 1:7796458/1‑39 (MQ=255) aCTAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGt < 1:2225164/46‑1 (MQ=255) aCTAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTAAACGCATaaa < 1:6457361/70‑1 (MQ=255) aCTAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTAAACGCATAAAt > 1:5101661/1‑71 (MQ=255) aCTAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTAAACGCATAAAt < 1:509278/71‑1 (MQ=255) ctgataagcgtagcgcatcaggcatttatgcgtttAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTaa > 1:4886341‑M2/36‑60 (MQ=255) ctgataagcgtagcgcatcaggcatttatgcgtttAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTaa > 1:1362753‑M2/36‑60 (MQ=255) ctgataagcgtagcgcatcaggcatttatgcgtttAGGGCGAGGTTACCCCTCACCCTaa > 1:7126223‑M2/36‑60 (MQ=255) tAATTACCACAGACATCGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTa < 1:5286085/58‑1 (MQ=255) tAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTa < 1:2790540/58‑1 (MQ=255) tAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTAAACGCATaa > 1:4874415/1‑67 (MQ=255) gataagcgtagcgcatcaggcatttatgcgtttAGGGCGAGGTTATCCCTCa < 1:5112741‑M2/19‑1 (MQ=255) gataagcgtagcgcatcaggcatttatgcgtttAGGGCGAGGTTATCCCTCa < 1:2491129‑M2/19‑1 (MQ=255) aaTTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTAAACGCATAAATGcc > 1:5777698/1‑71 (MQ=255) aTTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTc > 1:3282758/1‑50 (MQ=255) aTTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCa > 1:1690787/1‑51 (MQ=255) aTTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTAAACGCATAGAtcgg < 1:5223680/70‑4 (MQ=255) aCCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTaaa > 1:6023401/1‑55 (MQ=255) aCCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTAAACGCATAAATGCCTGAt > 1:7120911/1‑71 (MQ=255) aCCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATACCTCACCCTAAACGCATAAATGCCTGAt > 1:2725947/1‑71 (MQ=255) gcgtagcgcatcaggcatttatgcgtttAGGGCGAGGTTATCCCTCa > 1:3066314‑M2/29‑47 (MQ=255) ccACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTa < 1:1800179/52‑1 (MQ=255) ccACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTa < 1:6430649/52‑1 (MQ=255) ccACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTa < 1:7350795/52‑1 (MQ=255) caGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTAAACGCATAAATGCCTGATgcgc < 1:2662319/71‑1 (MQ=255) caGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTAAACGCATAAATGCCTGATgcgc > 1:7406378/1‑71 (MQ=255) caGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTAAACGCATAAATGCCTGATgcg > 1:1441150/1‑70 (MQ=255) aTAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTAAACGCATa < 1:2050811/52‑1 (MQ=255) aTAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTAAACGCATAAATGCCTGATGCGCTACGc > 1:7260651/1‑71 (MQ=255) aTAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTAAACGCATAAATGCCTGATGCGCTACGc > 1:4098544/1‑71 (MQ=255) aTAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTAAACGCATAAATGCCTGATGCGCTACGc > 1:3997364/1‑71 (MQ=255) aTAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTAAACGCATAAATGCCTGATGCGCTACGc < 1:1976859/71‑1 (MQ=255) tAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTAAACGCATAAATGCCTGATg < 1:7552645/62‑1 (MQ=255) cACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTAAACGCATAAATGCCTGATGCGCTACGCTTAt < 1:5000997/71‑1 (MQ=255) cACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTAAACGCATAAATGCCTGATGCGCTACGCTTAt < 1:6900382/71‑1 (MQ=255) aCCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTAAACGCATAAATGCCTGATGCGCTACGCTTATc < 1:2257424/71‑1 (MQ=255) cTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTAAACGCATAAATGCCTGATg < 1:3141602/56‑1 (MQ=255) cTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTAAACGCATAAATGCCTGATGCGCTa < 1:4364458/61‑1 (MQ=255) cAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTaaa > 1:7075041/1‑37 (MQ=255) cAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTa > 1:6180868/1‑35 (MQ=255) cAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTAAACGCATAAATGcc > 1:5478471/1‑49 (MQ=255) cAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTAAACGCATAAATGCCTGAt > 1:7855429/1‑53 (MQ=255) cAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTAAACGCATAAATGCCTGATGCGCTACGCTTAt > 1:1887272/1‑66 (MQ=255) aGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTAAACGCATAAATGCCTGATGCGCTACg > 1:1246224/1‑60 (MQ=255) aGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTAAACGCATAAATGCCTGATGCGCTACg > 1:2640156/1‑60 (MQ=255) aGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTAAACGCATAAATGCCTGATGCGCTACg > 1:6871118/1‑60 (MQ=255) aGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTAAACGCATAAATGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGcc > 1:7301787/1‑71 (MQ=255) gAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTAAACGCATAAATGCCTGATGCGCTACGCt > 1:678443/1‑61 (MQ=255) aTTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTAAACGCATAAATg < 1:2083368/43‑1 (MQ=255) aTTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTAAACGCATAAATGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTAc < 1:1345250/71‑1 (MQ=255) ttAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTAAACGCATAAATGCCTGATGCGCTACGCt > 1:4059997/1‑58 (MQ=255) aaaaaGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTAAACGCATAAATGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAt > 1:7913664/1‑70 (MQ=255) aaaaGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTAAACGCATAAATGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACATaa > 1:1982183/1‑71 (MQ=255) aaaGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTAAACGCATAAATGCCt > 1:5715604/1‑41 (MQ=255) aaGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTAAACGCATAAATGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACATAACt > 1:6738226/1‑71 (MQ=255) aGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTAAACGCATAAATGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACATAACTc > 1:5389425/1‑71 (MQ=255) aGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTAAACGCATAAATGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACATAACTc > 1:2224735/1‑71 (MQ=255) aGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTAAACGCATAAATGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACATAACTc < 1:3655880/71‑1 (MQ=255) aGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTAAACGCATAAATGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACATAACTc < 1:872585/71‑1 (MQ=255) | GCTGTGCCACCAAAACGCTGACGCCATGCATCACTAATTACCACAGACATAGCACCTCAGAATTAAAAAGGGCGAGGTTATCCCTCACCCTAAACGCATAAATGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACATAACTC > W3110S.gb/2944449‑2944587 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |