| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | 1591954 = | 98 (1.200) | 8 (0.110) | 4/90 | NT | 8.3% | intergenic (‑239/+117) | ydeT/yneL | hypothetical protein/predicted transcriptional regulator |
| ? | W3110S.gb | 1591980 = | 87 (1.160) | intergenic (‑265/+91) | ydeT/yneL | hypothetical protein/predicted transcriptional regulator | |||||
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
ATTGCGAACAAGGGAAGTGTCAGGAAAGGTCAAGAGCTACCAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTAACACCGAATTGCTCTAAACAGATAAGTGCAGGGTTTATT > W3110S.gb/1591913‑1592049 | attGCGAACAAGGGAAGTGTCAGGAAAGGTCAAGAGCTACCAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGc < 1:1864107/70‑1 (MQ=255) cGAACAAGGGAAGTGTCAGGAAAGGTCAAGAGCTACCAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATg < 1:1877375/70‑1 (MQ=255) aCAAGGGAAGTGTCAGGAAAGGTCAAGAGCTACCAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGtt > 1:918615/1‑70 (MQ=255) aCAAGGGAAGTGTCAGGAAAGGTCAAGAGCTACCAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGt > 1:7688122/1‑69 (MQ=255) ttagtttcagcaagcaaacattaaccatagctAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTa < 1:2673304‑M1/27‑1 (MQ=255) ttagtttcagcaagcaaacattaaccatagctAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTa < 1:444898‑M1/27‑1 (MQ=255) aGGGAAGTGTCAGGAAAGGTCAAGAGCTACCAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATg > 1:1312989/1‑64 (MQ=255) aGGGAAGTGTCAGGAAAGGTCAAGAGCTACCAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATg > 1:7104396/1‑71 (MQ=255) gggAAGTGTCAGGAAAGGTCAAGAGCTACCAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGt < 1:2635003/71‑1 (MQ=255) gggAAGTGTCAGGAAAGGTCAAGAGCTACCAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGt < 1:524763/71‑1 (MQ=255) gAAGTGTCAGGAAAGGTCAAGAGCTACCAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGtt < 1:1297118/70‑1 (MQ=255) aaGTGTCAGGAAAGGTCAAGAGCTACCAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTttg < 1:2019194/71‑1 (MQ=255) gtgtCAGGAAAGGTCAAGAGCTACCAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTttgct < 1:597263/71‑1 (MQ=255) gtCAGGAAAGGTCAAGAGCTACCAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAAt > 1:5264734/1‑62 (MQ=255) gtCAGGAAAGGTCAAGAGCTACCAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAAt > 1:6336369/1‑62 (MQ=255) aGGAAAGGTCAAGAGCTACCAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTtgcttgct > 1:5709670/1‑70 (MQ=255) aGGAAAGGTCAAGAGCTACCAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTtgcttgct > 1:6088796/1‑70 (MQ=255) aGGAAAGGTCAAGAGCTACCAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTtgcttgct > 1:6925187/1‑70 (MQ=255) ggAAAGGTCAAGAGCTACCAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGa < 1:4959480/71‑1 (MQ=255) ggAAAGGTCAAGAGCTACCAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGa < 1:2703666/71‑1 (MQ=255) aaaGGTCAAGAGCTACCAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTttg < 1:480813/61‑1 (MQ=255) aaaGGTCAAGAGCTACCAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGaaa > 1:3821937/1‑71 (MQ=255) aaGGTCAAGAGCTACCAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATg > 1:170191/1‑49 (MQ=255) aaGGTCAAGAGCTACCAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAAc > 1:5968064/1‑71 (MQ=255) aGGTCAAGAGCTACCAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACt < 1:7141750/71‑1 (MQ=255) ggTCAAGAGCTACCAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACt > 1:2020869/1‑70 (MQ=255) gTCAAGAGCTACCAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTaa > 1:2268883/1‑71 (MQ=255) gTCAAGAGCTACCAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTaa < 1:1061243/71‑1 (MQ=255) cAAGAGCTACCAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTAaca > 1:119350/1‑71 (MQ=255) cAAGAGCTACCAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTAaca > 1:2620176/1‑71 (MQ=255) aaGAGCTACCAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGtt > 1:1912192/1‑52 (MQ=255) aaGAGCTACCAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTttgcttg > 1:750134/1‑58 (MQ=255) aaGAGCTACCAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGa < 1:3847410/62‑1 (MQ=255) aaGAGCTACCAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGa < 1:5705619/62‑1 (MQ=255) aaGAGCTACCAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGa < 1:2381496/62‑1 (MQ=255) aaGAGCTACCAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTAaca < 1:5931501/70‑1 (MQ=255) gagCTACCAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTAACACCg < 1:7603744/71‑1 (MQ=255) gagCTACCAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTAACACCg < 1:5083481/71‑1 (MQ=255) agCTACCAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTAACACCg > 1:4406581/1‑70 (MQ=255) gCTACCAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTAACACCg < 1:3715624/69‑1 (MQ=255) cTACCAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGaa < 1:2822038/58‑1 (MQ=255) cTACCAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGaa < 1:3898152/58‑1 (MQ=255) tACCAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGaa < 1:4706234/57‑1 (MQ=255) tACCAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGa < 1:3589516/56‑1 (MQ=255) ccAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTAACACCGAATTg < 1:5688504/70‑1 (MQ=255) ccAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTAACACCGAATTg < 1:1184002/70‑1 (MQ=255) ccAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTAACACCGAATTg < 1:5544227/70‑1 (MQ=255) taatgatttatagccatattaaccattAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTaa < 1:2673304‑M2/32‑1 (MQ=255) taatgatttatagccatattaaccattAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTaa < 1:444898‑M2/32‑1 (MQ=255) cAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTAACACCGAATTGct > 1:7160400/1‑71 (MQ=255) cAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTAACACCGAATTGct > 1:3627672/1‑71 (MQ=255) AATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGttt > 1:2941484‑M1/1‑43 (MQ=255) ATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATg > 1:4210154‑M1/1‑39 (MQ=255) ATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATg > 1:321669‑M1/1‑39 (MQ=255) ATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTTAAACTAACACCGAATTGctc < 1:7037914‑M1/70‑1 (MQ=255) ATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTAACACCGAATTGctc < 1:5681047‑M1/70‑1 (MQ=255) ATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTAACACCGAATTGctc < 1:6452233‑M1/70‑1 (MQ=255) ATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTAACACCGAATTGctc < 1:1318251‑M1/70‑1 (MQ=255) TGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTAACACCGAATTGCTCTa > 1:1408186‑M1/1‑71 (MQ=255) gatttatagccatattaaccattAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGaaa > 1:7672733‑M2/24‑51 (MQ=255) gatttatagccatattaaccattAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGaaa > 1:1686556‑M2/24‑51 (MQ=255) gatttatagccatattaaccattAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGaaa > 1:3520998‑M2/24‑51 (MQ=255) gTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTttgc < 1:7796664/41‑1 (MQ=255) gTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTAACACCGAATTGCTCTaa < 1:1867095/70‑1 (MQ=255) ttAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTa < 1:4817002/52‑1 (MQ=255) tAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTAACACCGAATTGCTCTa < 1:4287149/67‑1 (MQ=255) tAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTAACACCGAATTGCTCTa < 1:4326961/67‑1 (MQ=255) tAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTAACACCGAATTGCTCTa < 1:4277897/67‑1 (MQ=255) aaTATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTAacac > 1:3327926/1‑54 (MQ=255) aaTATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTAacac > 1:2238239/1‑54 (MQ=255) aaTATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTAACACCGAATTGCTCTaaa > 1:7259708/1‑68 (MQ=255) aaTATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTAACACCGAATTGCTCTaaa > 1:2989955/1‑68 (MQ=255) atatGGGTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTAACACCGAATTGCTCTaaa > 1:1022029/1‑67 (MQ=255) atatGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTAACACCGAATTGCTCTaaa > 1:6379849/1‑67 (MQ=255) atatGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTAACACCGAATTGCTCTaaa > 1:25247/1‑67 (MQ=255) atatGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTAACACCGAATTGCTCTAAACAGa < 1:6464714/71‑1 (MQ=255) tGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTAACACCGAATTGCTCTAAACAGATaa < 1:877895/71‑1 (MQ=255) ggCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTAACACCGAAtt > 1:2612202/1‑55 (MQ=255) cTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTaa < 1:1118381/44‑1 (MQ=255) cTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTaa < 1:2194796/44‑1 (MQ=255) cTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTaa < 1:1959777/44‑1 (MQ=255) cTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTaa < 1:1213747/44‑1 (MQ=255) cTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTaa < 1:4196263/44‑1 (MQ=255) cTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTaa < 1:4093507/44‑1 (MQ=255) cTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTaa < 1:1005703/44‑1 (MQ=255) cTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTAACACCGAATTGCTCTa < 1:1016508/59‑1 (MQ=255) ataAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTAACACCGaa > 1:6475783/1‑49 (MQ=255) taAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGaaa > 1:2114437/1‑37 (MQ=255) taAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTAACAcc < 1:3469891/45‑1 (MQ=255) taAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTAACACCGAATTGCTCTa < 1:1750181/56‑1 (MQ=255) taAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTAACACCGAATTGCTCTAAACAGAt < 1:2685715/63‑1 (MQ=255) taAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTAACACCGAATTGCTCTAAACAGATAAGTGCAg > 1:2869037/1‑71 (MQ=255) aaaTCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTAACACCGAATTGCTCTAAACAGATAAGTGCa < 1:251722/69‑1 (MQ=255) aaTCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTAACACCGAATTGCTCTAAACAGATAAGTGCAggg > 1:3603837/1‑71 (MQ=255) attAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTAACACCGAATTGCTCTAAACAGATAAGTGCAGGGttt < 1:3439950‑M2/67‑1 (MQ=255) attAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTAACACCGAATTGCTCTAAACAGATAAGTGCAGGGttt < 1:7273688‑M2/67‑1 (MQ=255) ttAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTAACACCGAATTGCTCTAAACAGATAAGTGCAGGGttt < 1:5379000‑M2/67‑1 (MQ=255) tAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTAACACCGAATTg < 1:3024613‑M2/42‑1 (MQ=255) tAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTAACACCGAATTg < 1:4671239‑M2/42‑1 (MQ=255) aGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTAACACCGAATTGCTCTAAACAGATAAGTGCAGGGTttatt < 1:4486453/70‑1 (MQ=255) | ATTGCGAACAAGGGAAGTGTCAGGAAAGGTCAAGAGCTACCAATGGTTAATATGGCTATAAATCATTAGCTATGGTTAATGTTTGCTTGCTGAAACTAACACCGAATTGCTCTAAACAGATAAGTGCAGGGTTTATT > W3110S.gb/1591913‑1592049 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |