| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | = 2070745 | 66 (0.810) | 4 (0.050) | 3/88 | NT | 6.3% | intergenic (‑1287/‑27) | insH/yoeA | IS5 transposase and trans‑activator/CP4‑44 prophage region; ECK1989:JW5326:b1995; predicted disrupted hemin or colicin receptor |
| ? | W3110S.gb | = 2070758 | 60 (0.820) | intergenic (‑1300/‑14) | insH/yoeA | IS5 transposase and trans‑activator/CP4‑44 prophage region; ECK1989:JW5326:b1995; predicted disrupted hemin or colicin receptor | |||||
AATAATTATAGATATATGAGAACATAAATGAAAATAATTATCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTTATATAATATACCTTGTCGAATTTATATCCTTTCCACTCTGTCATTATGCAT > W3110S.gb/2070689‑2070827 | aataatTATAGATATATGAGAACATAAATGAAAATAATTATCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTAtt > 1:6344898/1‑70 (MQ=255) taatTATAGATATATGAGAACATAAATGAAAATAATTATCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTaat > 1:4645990‑M2/1‑68 (MQ=255) taatTATAGATATATGAGAACATAAATGAAAATAATTATCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTaat > 1:5277639‑M2/1‑68 (MQ=255) taatTATAGATATATGAGAACATAAATGAAAATAATTATCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTaat > 1:2070357‑M2/1‑68 (MQ=255) taatTATAGATATATGAGAACATAAATGAAAATAATTATCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTaat > 1:6481500‑M2/1‑68 (MQ=255) ataGATATATGAGAACATAAATGAAAATAATTATCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAg < 1:1402773/69‑1 (MQ=255) atGAGAACATAAATGAAAATAATTATCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATg > 1:4948615/1‑71 (MQ=255) tGAGAACATAAATGAAAATAATTATCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATg < 1:3058283/70‑1 (MQ=255) tGAGAACATAAATGAAAATAATTATCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGt < 1:7305120/71‑1 (MQ=255) tGAGAACATAAATGAAAATAATTATCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGt < 1:2543703/71‑1 (MQ=255) gagaACATAAATGAAAATAATTATCATTGCAGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGt > 1:4562550/1‑70 (MQ=255) gagaACATAAATGAAAATAATTATCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTAtt < 1:6543570/53‑1 (MQ=255) agaACATAAATGAAAATAATTATCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTaat > 1:4988748‑M2/1‑52 (MQ=255) agaACATAAATGAAAATAATTATCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTta < 1:7590295/71‑1 (MQ=255) aTAAATGAAAATAATTATCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAg > 1:3950500/1‑53 (MQ=255) aaTGAAAATAATTATCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTTatataatat < 1:6428456/71‑1 (MQ=255) aTGAAAATAATTATCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTTatataatata > 1:1728868/1‑71 (MQ=255) aTGAAAATAATTATCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTTatataatata > 1:5555391/1‑71 (MQ=255) aTGAAAATAATTATCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTTatataatata > 1:9328/1‑71 (MQ=255) tGAAAATAATTATCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTTatataata > 1:425186/1‑68 (MQ=255) aaaaTAATTATCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTTATATAATATACCt < 1:5423998/71‑1 (MQ=255) aaaTAATTATCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTTATATAATATACCtt < 1:4478044/71‑1 (MQ=255) aaaTAATTATCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTTATATAATATACCtt < 1:2169923/71‑1 (MQ=255) aataatTATCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTatt > 1:3861011‑M2/1‑38 (MQ=255) aataatTATCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTaat > 1:4975186‑M2/1‑38 (MQ=255) aataatTATCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTaat > 1:756372‑M2/1‑38 (MQ=255) aataatTATCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATg > 1:2945919/1‑54 (MQ=255) aataatTATCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTTATATAATATACCTTg > 1:2906648/1‑71 (MQ=255) aataatTATCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTTATATAATATACCTTg < 1:4989752/71‑1 (MQ=255) aataatTATCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTTATATAATATACCTTg > 1:7108206/1‑71 (MQ=255) ataatTATCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTTATATAATATAcc < 1:7211307/67‑1 (MQ=255) ataatTATCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTTATATAATATAcc < 1:3290289/67‑1 (MQ=255) aatTATCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGaa < 1:4869480/48‑1 (MQ=255) aatTATCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTTATATAATATACCTTGt > 1:7041739/1‑69 (MQ=255) aatTATCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTTATATAATATACCTTGTc > 1:1683102/1‑70 (MQ=255) atTATCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTTATATAATATACCTTGTCg > 1:3353001/1‑70 (MQ=255) ttATCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGt < 1:1940458/50‑1 (MQ=255) ttATCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGt < 1:7545288/50‑1 (MQ=255) ttATCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGt < 1:4649633/50‑1 (MQ=255) ttATCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTTATATAATATACCTTGTCGaa < 1:5029326/71‑1 (MQ=255) tATCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTta < 1:5229939/51‑1 (MQ=255) aTCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTTATATAATATACCTTGTCGAAtt > 1:4344584/1‑71 (MQ=255) tCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTTATATAATATACCTTGTCGAAttt < 1:5905685/71‑1 (MQ=255) tCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTTATATAATATACCTTGTCGAAtt < 1:2203618/70‑1 (MQ=255) ttACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAAt > 1:1279659/1‑42 (MQ=255) ttACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAAt > 1:6392561/1‑42 (MQ=255) ttACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAAt > 1:3686859/1‑42 (MQ=255) aCAGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTTATATAATATACCTTGTCGAATTTATATc > 1:6690414/1‑71 (MQ=255) cAGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTTATATAATATACCTTGt > 1:2472868/1‑58 (MQ=255) aGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTTATATAATATACCTTGTCGAATTTATATCCt > 1:4169310/1‑71 (MQ=255) aGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTTATATAATATACCTTGTCGAATTTATATCCt > 1:6765232/1‑71 (MQ=255) aGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTTATATAATATACCTTGTCGAATTTATATCCt > 1:6018072/1‑71 (MQ=255) gTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTTATATAATATACCt > 1:3524250/1‑53 (MQ=255) gTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTTATATAATATACCt > 1:5046360/1‑53 (MQ=255) aTCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTTATATAATATACCTTGTGGAATTTATATCCTTTc < 1:3442019/70‑1 (MQ=255) aTCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTTATATAATATACCTTGTCGAATTTATATCCTTTc < 1:3359461/70‑1 (MQ=255) aTCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTTATATAATATACCTTGTCGAATTTATATCCTTTc < 1:1300458/70‑1 (MQ=255) aTCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTTATATAATATACCTTGTCGAATTTATATCCTTTc < 1:1907876/70‑1 (MQ=255) aTCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTTATATAATATACCTTGTCGAATTTATATCCTTTc < 1:1001882/70‑1 (MQ=255) tCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTTatataatat < 1:7224173/45‑1 (MQ=255) tCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTTATATAATATACCTTGTCGAATTTATATCCTTTc < 1:4398307/69‑1 (MQ=255) cATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTta > 1:1992783/1‑36 (MQ=255) tttGTACTTTGTATTaatgattactgtaatgataatt > 1:7807181‑M2/1‑15 (MQ=255) tttGTACTTTGTATTaatgattactgtaatgataatt > 1:287433‑M2/1‑15 (MQ=255) ttGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTTATATAATATACCTTGTCGAATTtata > 1:4062661/1‑58 (MQ=255) tGTACTTTGTATTaatgattactgtaatgataattat < 1:248517‑M2/37‑25 (MQ=255) tGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTTATATAATATACCTTGTCGAATTTATATCCTTTCCACTCTg > 1:2823702/1‑71 (MQ=255) gTACTTTGTATTaatgattactgtaatgataattattttcatttatgttct > 1:842629‑M2/1‑12 (MQ=255) tACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTTATATAATATACCTTGTCGaa > 1:5831112/1‑49 (MQ=255) aCTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTTATATAATATACCTTGTc > 1:3957999/1‑45 (MQ=255) aCTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTTATATAATATACCTTGTc > 1:1695467/1‑45 (MQ=255) aCTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTTATATAATATACCTTGTCGAATTTATATCCTTTCCACTCTGTCa > 1:7037086/1‑71 (MQ=255) ttGTATTAATGAGGGATGAAATGTTATATAATATACCTTGTCGAATTTATATCCTTTCCACTCTGTCATTa > 1:7462526/1‑71 (MQ=255) ttGTATTAATGAGGGATGAAATGTTATATAATATACCTTGTCGAATTTATATCCTTTCCACTCTGTCATTa > 1:2256477/1‑71 (MQ=255) tGTATTAATGAGGGATGAAATGTTATATAATATACCTTGTCGAATTTATATCCTTTCCACTCTGTCAtt < 1:7743164/69‑1 (MQ=255) tGTATTAATGAGGGATGAAATGTTATATAATATACCTTGTCGAATTTATATCCTTTCCACTCTGTCAtt < 1:2492344/69‑1 (MQ=255) tATTAATGAGGGATGAAATGTTATATAATATACCTTGTCGAATTTATATCCTTTCCACTCTGTCATTAt > 1:3537975/1‑69 (MQ=255) ttAATGAGGGATGAAATGTTATATAATATACCTTGTCGAATTTATATCCTTTCCACTCTGTCATTATGCAt < 1:7753416/71‑1 (MQ=255) ttAATGAGGGATGAAATGTTATATAATATACCTTGTCGAATTTATATCCTTTCCACTCTGTCATTATGCAt > 1:2016376/1‑71 (MQ=255) | AATAATTATAGATATATGAGAACATAAATGAAAATAATTATCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTTATATAATATACCTTGTCGAATTTATATCCTTTCCACTCTGTCATTATGCAT > W3110S.gb/2070689‑2070827 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |