| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | 2763935 = | 79 (0.970) | 5 (0.070) | 3/88 | NT | 6.5% | intergenic (‑126/+234) | yfjL/yfjM | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | W3110S.gb | 2763964 = | 73 (1.000) | intergenic (‑155/+205) | yfjL/yfjM | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
AAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGG > W3110S.gb/2763894‑2764034 | aaaTACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGAc > 1:3724127/1‑71 (MQ=255) cTTCACAGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTa < 1:940166/71‑1 (MQ=255) cacaGCCATTCTAGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAAtt > 1:6405759/1‑71 (MQ=255) acaGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAAttt > 1:1282520/1‑71 (MQ=255) acaGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAAttt < 1:1632042/71‑1 (MQ=255) acaGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAAtt < 1:2927773/70‑1 (MQ=255) acaGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAAtt < 1:1895122/70‑1 (MQ=255) acaGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAAtt < 1:2918461/70‑1 (MQ=255) aGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTgg < 1:6668827/71‑1 (MQ=255) aTTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTtat < 1:730961/71‑1 (MQ=255) ttCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGt < 1:2909779/57‑1 (MQ=255) ttCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGt < 1:4709837/57‑1 (MQ=255) ttCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTaa < 1:2072865/61‑1 (MQ=255) ttCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTaa < 1:48097/61‑1 (MQ=255) ttCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTtata < 1:2082297/71‑1 (MQ=255) ttCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTtata < 1:1476945/71‑1 (MQ=255) cGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATaa > 1:3706217/1‑70 (MQ=255) ggTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATaa < 1:3341236/69‑1 (MQ=255) tCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAAttt < 1:2904507/57‑1 (MQ=255) tCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTtatata < 1:3917958/66‑1 (MQ=255) tCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATa < 1:1258239/71‑1 (MQ=255) cGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATAc > 1:7254439/1‑71 (MQ=255) cGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATAc > 1:2952184/1‑71 (MQ=255) gCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATAc < 1:7332833/70‑1 (MQ=255) gCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACt > 1:1739431/1‑71 (MQ=255) cAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTg < 1:5548194/71‑1 (MQ=255) cAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTg < 1:7344649/71‑1 (MQ=255) aGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTtatat < 1:4055903/61‑1 (MQ=255) aGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGc > 1:3810142/1‑71 (MQ=255) gTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAAttt < 1:541172/51‑1 (MQ=255) gTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTgg < 1:6018604/53‑1 (MQ=255) gTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTgg < 1:2472886/53‑1 (MQ=255) tATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAAttt < 1:6169349/50‑1 (MQ=255) aaGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTgg > 1:7362285/1‑48 (MQ=255) aaGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTgg > 1:6652960/1‑48 (MQ=255) aaGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAAc > 1:6629450/1‑70 (MQ=255) aGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTa < 1:1828237/71‑1 (MQ=255) aGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTa < 1:2615310/71‑1 (MQ=255) gCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACa < 1:3594072/56‑1 (MQ=255) gCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACa < 1:6163319/56‑1 (MQ=255) gCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACa < 1:6630668/56‑1 (MQ=255) gCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTaa > 1:6037784/1‑71 (MQ=255) gCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTaa > 1:5829184/1‑71 (MQ=255) gCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTaa > 1:6288951/1‑71 (MQ=255) cTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGt < 1:6999473/46‑1 (MQ=255) cTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGt < 1:5935317/46‑1 (MQ=255) ttttCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTtata < 1:1059967/49‑1 (MQ=255) tttCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACg > 1:353517/1‑70 (MQ=255) tttCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACg > 1:2822499/1‑70 (MQ=255) ttCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACt > 1:3670110/1‑65 (MQ=255) ttCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACg < 1:2297122/69‑1 (MQ=255) ttCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGt > 1:4057851/1‑70 (MQ=255) ttCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGt > 1:4564164/1‑70 (MQ=255) CAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTtata < 1:5207796‑M1/45‑1 (MQ=255) CAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTtata < 1:6631905‑M1/45‑1 (MQ=255) CAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTaa > 1:3657678‑M1/1‑70 (MQ=255) agggttacaatatttgtggaatcctgaCGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAAc > 1:3113781‑M2/28‑65 (MQ=255) gggttacaatatttgtggaatcctgaCGTCTAATTTGGTTATATAAc > 1:4453876‑M2/27‑47 (MQ=255) GGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGtt < 1:5674501‑M1/40‑1 (MQ=255) GGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGt > 1:552150‑M1/1‑71 (MQ=255) GGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGt > 1:5785104‑M1/1‑71 (MQ=255) GATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTtatat > 1:3492166‑M1/1‑43 (MQ=255) GATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTtatat > 1:3199805‑M1/1‑43 (MQ=255) GATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAgg < 1:644661‑M1/69‑1 (MQ=255) GATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAgg < 1:1931174‑M1/69‑1 (MQ=255) GATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTa > 1:3121513‑M1/1‑71 (MQ=255) gttacaatatttgtggaatcctgaCGTCTAATTTGGt > 1:3745051‑M2/25‑37 (MQ=255) gttacaatatttgtggaatcctgaCGTCTAATTTGGt > 1:7528608‑M2/25‑37 (MQ=255) aTTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATa > 1:893138/1‑48 (MQ=255) aTTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATa > 1:4118928/1‑48 (MQ=255) aTTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATa > 1:6297067/1‑48 (MQ=255) ttCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAgg > 1:4185178/1‑71 (MQ=255) tCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACt < 1:2643913/48‑1 (MQ=255) tCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACt < 1:5757761/48‑1 (MQ=255) ccACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATAc > 1:2693865/1‑46 (MQ=255) ccACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGca > 1:6072609/1‑71 (MQ=255) cacaAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGcac < 1:7547728/71‑1 (MQ=255) acaAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAAc < 1:2551972/40‑1 (MQ=255) acaAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGcaca < 1:2220188/71‑1 (MQ=255) caAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGcaca < 1:7238114/70‑1 (MQ=255) aaaTATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACAt > 1:4175554/1‑40 (MQ=255) aaaTATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTa > 1:7895748/1‑53 (MQ=255) aaaTATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGt > 1:7392616/1‑62 (MQ=255) aaaTATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGc < 1:4131594/71‑1 (MQ=255) aaTATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGcccc > 1:5959787/1‑47 (MQ=255) aaTATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGcccc > 1:5968983/1‑47 (MQ=255) tatTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCtt < 1:1932441/71‑1 (MQ=255) tGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTa > 1:5191998/1‑52 (MQ=255) gTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAAt > 1:7369325/1‑70 (MQ=255) tAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATc < 1:2144861/70‑1 (MQ=255) aCCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAgg > 1:951831/1‑55 (MQ=255) aCCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAg > 1:3492221/1‑71 (MQ=255) aCCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCACAACTAACGTAAGGt > 1:6436660/1‑52 (MQ=255) ctgaCGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCaa > 1:2583202‑M2/5‑37 (MQ=255) ctgaCGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTa < 1:3825352‑M2/46‑1 (MQ=255) ctgaCGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGtt < 1:4340248‑M2/67‑1 (MQ=255) tgaCGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGttt > 1:4243819‑M2/4‑71 (MQ=255) aCGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGttt < 1:6954717‑M2/68‑1 (MQ=255) aCGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGttt < 1:6913787‑M2/68‑1 (MQ=255) cGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAggttttgg > 1:7018935/1‑71 (MQ=255) | AAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGG > W3110S.gb/2763894‑2764034 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |