| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | 2891111 = | 49 (0.600) | 5 (0.070) | 3/86 | NT | 11.4% | coding (242/366 nt) | ygcM | 6‑pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase |
| ? | W3110S.gb | 2891133 = | 35 (0.490) | coding (264/366 nt) | ygcM | 6‑pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase | |||||
CCTACGAGCGCCTCGATCACCATTATCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAAC > W3110S.gb/2891063‑2891201 | ccTACGAGCGCCTCGATCACCATTATCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTa > 1:6200837/1‑71 (MQ=255) cTACGAGCGCCTCGATCACCATTATCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAg > 1:884665/1‑71 (MQ=255) aCGAGCGCCTCGATCACCATTATCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGc > 1:2372728/1‑70 (MQ=255) cGAGCGCCTCGATCACCATTATCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCa > 1:3015936/1‑70 (MQ=255) cGAGCGCCTCGATCACCATTAACTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCa > 1:6751648/1‑70 (MQ=255) cTCGATCACCATTATCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCaaa < 1:1377253/65‑1 (MQ=255) cTCGATCACCATTATCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGAt > 1:1781509/1‑71 (MQ=255) cTCGATCACCATTATCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGAt > 1:1790860/1‑71 (MQ=255) cGATCACCATTATCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGAttt > 1:7734006/1‑71 (MQ=255) cGATCACCATTATCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGAttt > 1:5661138/1‑71 (MQ=255) gATCACCATTATCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAAt > 1:7110430/1‑64 (MQ=255) gATCACCATTAACTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTg > 1:2710574/1‑71 (MQ=255) cATTATCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGAt > 1:5941857/1‑69 (MQ=255) aTTATCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAg < 1:480904/71‑1 (MQ=255) ttATCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAgg > 1:1605251/1‑71 (MQ=255) ttATCTCAATGATATTCCAGGTCTAGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGAACAgg < 1:7442887/71‑1 (MQ=255) aTCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGt < 1:3947283/70‑1 (MQ=255) tctcAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGtt > 1:1675644/1‑70 (MQ=255) tcAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATc < 1:6316064/63‑1 (MQ=255) tcAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATc < 1:3223139/63‑1 (MQ=255) aaTGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTaa < 1:597333/68‑1 (MQ=255) aaTGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTaa < 1:606633/68‑1 (MQ=255) atatTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCaaaa > 1:1597603/1‑44 (MQ=255) tatTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTtg > 1:45966/1‑71 (MQ=255) ccAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGAt > 1:7408484/1‑51 (MQ=255) ccAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGAt > 1:604759/1‑51 (MQ=255) ccAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGc < 1:6301044/70‑1 (MQ=255) gTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATgg < 1:368765/38‑1 (MQ=255) gTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATgg < 1:598273/38‑1 (MQ=255) gTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATgg < 1:3398843/38‑1 (MQ=255) cTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGt > 1:5894136/1‑70 (MQ=255) gAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTtg > 1:7288607/1‑58 (MQ=255) AAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGAt > 1:3116483‑M1/1‑41 (MQ=255) AAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGAt > 1:617406‑M1/1‑41 (MQ=255) AAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCa < 1:6935193‑M1/43‑1 (MQ=255) AAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAgg > 1:1463299‑M1/1‑45 (MQ=255) aaacctcgctggttgggttttAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAg < 1:6574986‑M2/48‑1 (MQ=255) aaacctcgctggttgggttttAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAg < 1:2664765‑M2/48‑1 (MQ=255) aaacctcgctggttgggttttAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTg > 1:1544416‑M2/22‑71 (MQ=255) AAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAg < 1:3261081‑M1/69‑1 (MQ=255) AAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTg > 1:3963564‑M1/1‑71 (MQ=255) AAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTg > 1:1714153‑M1/1‑71 (MQ=255) ACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTa > 1:5141773‑M1/1‑45 (MQ=255) CCAACCAGCCAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGt < 1:1539900‑M1/71‑1 (MQ=255) cAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGcc > 1:6812598/1‑55 (MQ=255) cAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGc > 1:2461632/1‑57 (MQ=255) cAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGt > 1:4900868/1‑70 (MQ=255) cAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTg < 1:6137634/71‑1 (MQ=255) cgctggttgggttttAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGt > 1:415684‑M2/16‑39 (MQ=255) cgctggttgggttttAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGt > 1:6113385‑M2/16‑39 (MQ=255) aCCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTtg > 1:1407280/1‑49 (MQ=255) aCCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTg > 1:6721956/1‑57 (MQ=255) ccAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTaa > 1:2066806/1‑60 (MQ=255) ccAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTaa > 1:2787931/1‑60 (MQ=255) aGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGt < 1:1614985/65‑1 (MQ=255) aGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGt < 1:1881691/71‑1 (MQ=255) cGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTaa < 1:7465961/71‑1 (MQ=255) cGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTaa < 1:2468401/71‑1 (MQ=255) cGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTa > 1:5201574/1‑70 (MQ=255) gAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCTTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTaaa < 1:1009865/71‑1 (MQ=255) aGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTa < 1:4198375/53‑1 (MQ=255) ggttttAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTaa > 1:6804421‑M2/7‑68 (MQ=255) gttttAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCg < 1:824815‑M2/40‑1 (MQ=255) gttttAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGa < 1:20981‑M2/66‑1 (MQ=255) ttttAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTgcct < 1:6993013‑M2/40‑2 (MQ=255) ttttAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGtt < 1:5444797‑M2/45‑1 (MQ=255) ttttAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGaa < 1:463974‑M2/67‑1 (MQ=255) ttttAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGaa < 1:1156287‑M2/67‑1 (MQ=255) ttAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGcc > 1:6087594‑M2/3‑41 (MQ=255) ttAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGc > 1:6543468‑M2/3‑43 (MQ=255) ttAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAAc > 1:336233‑M2/3‑71 (MQ=255) aGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAAc < 1:7088380/69‑1 (MQ=255) | CCTACGAGCGCCTCGATCACCATTATCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTTTTAGCAAAATGGATTTGGGATCAGGTTAAACCCGTTGTGCCGCTGTTAAGTGCGGTGATGGTAAAAGAAAC > W3110S.gb/2891063‑2891201 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |