| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | = 3229565 | 82 (1.010) | 16 (0.220) | 5/86 | NT | 18.9% | coding (2022/2352 nt) | ygjK | predicted glycosyl hydrolase |
| ? | W3110S.gb | = 3229588 | 65 (0.910) | coding (2045/2352 nt) | ygjK | predicted glycosyl hydrolase | |||||
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
TTTAACGGTGCGGCAACGCAGGCCAATGCCGACGCGGTGGTGAAGGTGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGTTAACCAATCCGGCTTTTGGCGCTGATATCTACTGGCGTGGG > W3110S.gb/3229518‑3229658 | tttAACGGTGCGGCAACGCAGGCCAATGCCGACGCGGTGGTGAAGGTGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCaa < 1:6559127/71‑1 (MQ=255) tAACGGTGCGGCAACGCAGGCCAATGCCGACGCGGTGGTGAAGGTGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAAca < 1:6144059‑M2/71‑3 (MQ=255) tAACGGTGCGGCAACGCAGGCCAATGCCGACGCGGTGGTGAAGGTGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAAc > 1:7371126‑M2/1‑69 (MQ=255) aaCGGTGCGGCAACGCAGGCCAATGCCGACGCGGTGGTGAAGGTGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAAca > 1:129710‑M2/1‑68 (MQ=255) cGGTGCGGCAACGCAGGCCAATGCCGACGCGGTGGTGAAGGTGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAAcacct > 1:3468655‑M2/1‑66 (MQ=255) ggTGCGGCAACGCAGGCCAATGCCGACGCGGTGGTGAAGGTGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAAcacctt > 1:3453165‑M2/1‑65 (MQ=255) ggTGCGGCAACGCAGGCCAATGCCGACGCGGTGGTGAAGGTGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAAcacctt > 1:3077070‑M2/1‑65 (MQ=255) ggTGCGGCAACGCAGGCCAATGCCGACGCGGTGGTGAAGGTGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAAcacctt > 1:7084301‑M2/1‑65 (MQ=255) cGGCAACGCAGGCCAATGCCGACGCGGTGGTGAAGGTGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTc < 1:6402122/71‑1 (MQ=255) gCAACGCAGGCCAATGCCGACGCGGTGGTGAAGGTGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTccc < 1:4648302/71‑1 (MQ=255) cAACGCAGGCCAATGCCGACGCGGTGGTGAAGGTGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCg > 1:1584015/1‑71 (MQ=255) aaCGCAGGCCAATGCCGACGCGGTGGTGAAGGTGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCGc > 1:7820207/1‑71 (MQ=255) aCGCAGGCCAATGCCGACGCGGTGGTGAAGGTGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCt > 1:2263804/1‑71 (MQ=255) aGGCCAATGCCGACGCGGTGGTGAAGGTGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCTggg > 1:7143562/1‑70 (MQ=255) aGGCCAATGCCGACGCGGTGGTGAAGGTGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCTggg > 1:6112057/1‑70 (MQ=255) ggCCAATGCCGACGCGGTGGTGAAGGTGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTc > 1:5358078/1‑61 (MQ=255) ccAATGCCGACGCGGTGGTGAAGGTGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCg < 1:1801654/62‑1 (MQ=255) ccAATGCCGACGCGGTGGTGAAGGTGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAACACCTCTGTCCCg < 1:7145527/62‑1 (MQ=255) cAATGACGACGCGGTGGTGAAGGTGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAAcgg < 1:81510/71‑1 (MQ=255) aTGCCGACGCGGTGGTGAAGGTGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAAcggc < 1:893199/70‑1 (MQ=255) ccGACGCGGTGGTGAAGGTGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAAcacctt > 1:5602632‑M2/1‑43 (MQ=255) ccGACGCGGTGGTGAAGGTGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAAc > 1:7700379/1‑64 (MQ=255) cGACGCGGTGGTGAAGGTGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAAc > 1:2442975/1‑63 (MQ=255) cGACGCGGTGGTGAAGGTGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAAc > 1:7173828/1‑63 (MQ=255) cGACGCGGTGGTGAAGGTGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAAc > 1:4180054/1‑63 (MQ=255) cGACGCGGTGGTGAAGGTGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGt > 1:2040240/1‑71 (MQ=255) gACGCGGTGGTGAAGGTGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAAcac > 1:3027454‑M2/1‑41 (MQ=255) gACGCGGTGGTGAAGGTGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGtt < 1:3895360/71‑1 (MQ=255) gACGCGGTGGTGAAGGTGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGtt < 1:1230197/71‑1 (MQ=255) gACGCGGTGGTGAAGGTGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGt > 1:5639259/1‑70 (MQ=255) aCGCGGTGGTGAAGGTGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCaa > 1:2417884/1‑40 (MQ=255) aCGCGGTGGTGAAGGTGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGtt > 1:3316800/1‑70 (MQ=255) gtgAAGGTGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGTTAACCAATc < 1:2726546/70‑1 (MQ=255) gtgAAGGTGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGTTAACCAATc < 1:5263407/70‑1 (MQ=255) tgAAGGTGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAAcacct > 1:4376888‑M2/1‑31 (MQ=255) tgAAGGTGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGTTAACCAATCCg > 1:1146390/1‑71 (MQ=255) gAAGGTGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGaa > 1:3853140/1‑50 (MQ=255) gAAGGTGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGTTAACCAATCCgg > 1:4746344/1‑71 (MQ=255) gAAGGTGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGTTAACCAATCCgg > 1:2033345/1‑71 (MQ=255) aGGTGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGTTAACCAATCCGGCt < 1:1535416/71‑1 (MQ=255) aGGTGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGTTAACCAATCCGGCt < 1:7753362/71‑1 (MQ=255) gTGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAAcaccttcaccaccgcgtcggcattggcctgcgttgccgcaccgt < 1:7576288‑M2/70‑45 (MQ=255) gTGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAAcaccttcaccaccgcgtcggcattggcctgcgttgccgcaccgt < 1:4490457‑M2/70‑45 (MQ=255) gTGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAAcaccttcaccaccgcgtcggcattggcctgcgttgccgcaccgt < 1:6404017‑M2/70‑45 (MQ=255) tGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAAcaccttcaccaccgcgtcggcattggcctgcgttgccgcaccgtt < 1:5463374‑M2/70‑46 (MQ=255) tGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAAcaccttcaccaccgcgtcggcattggcctgcgttgccgcaccgtt < 1:1882511‑M2/70‑46 (MQ=255) tGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAAcaccttcaccaccgcgtcggcattggcctgcgttgccgcaccgtt < 1:3572833‑M2/70‑46 (MQ=255) gATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGTTAAcc < 1:4177371/58‑1 (MQ=255) gATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGTTAAcc < 1:2683261/58‑1 (MQ=255) gATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGTTAAcc < 1:4202052/58‑1 (MQ=255) gATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGTTAAcc < 1:7041527/58‑1 (MQ=255) gATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGTTAACCAATCCggat > 1:2461691/1‑65 (MQ=255) tGCTCGATCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGaa > 1:5171053/1‑42 (MQ=255) tGCTCGATCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGgcggcg > 1:4696543/1‑50 (MQ=255) tGCTCGATCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGTTAACCAATCCGGCTTTTGgc < 1:124235/71‑1 (MQ=255) gCTCGATCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGgcggcg < 1:733006/49‑1 (MQ=255) gCTCGATCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGtt < 1:6514561/51‑1 (MQ=255) gCTCGATCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGTTAACCAAt < 1:7570129/58‑1 (MQ=255) cTCGATCCTAAAGAGTTCAAcaccttcaccaccgcgtcggtattggcctgcg > 1:4804677‑M2/1‑20 (MQ=255) cTCGATCCTAAAGAGTTCAAcaccttcaccaccgcgtcggcattggcctgcg > 1:3683096‑M2/1‑20 (MQ=255) cTCGATCCTAAAGAGTTCAAcaccttcaccaccgcgtcggcattggcctgcg > 1:2850530‑M2/1‑20 (MQ=255) cTCGATCCTAAAGAGTTCAAcaccttcaccaccgcgtcggcattggcctgcg > 1:3276671‑M2/1‑20 (MQ=255) cTCGATCCTAAAGAGTTCAAcaccttcaccaccgcgtcggcattggcctgcg > 1:5425818‑M2/1‑20 (MQ=255) cTCGATCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGgcggcg < 1:5910091/48‑1 (MQ=255) cTCGATCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGTTAACCAATCCGGCTTTTGgcgc < 1:6067226/71‑1 (MQ=255) tCGATCCTAAAGAGTTCAAcaccttcaccaccgcgtcggcattg < 1:2161685‑M2/44‑26 (MQ=255) tCGATCCTAAAGAGTTCAAcaccttcaccaccgcgtcggcattg < 1:1579451‑M2/44‑26 (MQ=255) cGATCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACggcggc > 1:1011663/1‑45 (MQ=255) cGATCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGgcggcg > 1:7395037/1‑46 (MQ=255) gATCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGTTAACCAATCCGGCTTTTGGCGCTg < 1:5054478/70‑1 (MQ=255) gATCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGTTAACCAATCCGGCTTTTGGCGCTg < 1:6497279/70‑1 (MQ=255) gATCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGTTAACCAATCCGGCTTTTGGCGCTGa < 1:5353883/71‑1 (MQ=255) aTCCTAAAGAGTTCAAcaccttcaccaccgcgtcggcattggcctgcgttgccgcaccgttaaacagc < 1:5682959‑M2/68‑53 (MQ=255) aTCCTAAAGAGTTCAAcaccttcaccaccgcgtcggcattggcctgcgttgccgcaccgttaaacagc < 1:4446693‑M2/68‑53 (MQ=255) tCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGTTaa > 1:2878799/1‑47 (MQ=255) tCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGTTaa > 1:307105/1‑47 (MQ=255) tCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGTTAACCAATCCGGCttt < 1:198127/60‑1 (MQ=255) ccTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGTTAACCAATCCGGCttt < 1:3870934/59‑1 (MQ=255) cTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGTTAACCAATCCGGCTTTTGGCGCTGATATc < 1:2110814/71‑1 (MQ=255) aaGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGTTAACCAATCCGGCTTTTGGCGCTGATATCTAc < 1:4525/71‑1 (MQ=255) aaGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGTTAACCAATCCGGCTTTTGGCGCTGATATCTAc < 1:4022107/71‑1 (MQ=255) agagTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGTTAACCAATCCGGCTTTTGGCGCTGATATCTACt > 1:7083061/1‑71 (MQ=255) agagTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGTTAACCAATCCGGCTTTTGGCGCTGATATCTACt > 1:1731841/1‑71 (MQ=255) agTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGTTAACCAATc < 1:4998278/45‑1 (MQ=255) agTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGTTAACCAATCCGGCTTTTGGCGCTGa > 1:4705738/1‑61 (MQ=255) gTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGTTAACCAATCCGGCTTTTGGCGCTGATATCTACTGGc < 1:7363206/71‑1 (MQ=255) ttCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGTTAACCAAt < 1:1849400/42‑1 (MQ=255) ttCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGTTAACCAATCCGGCttt < 1:4362496/50‑1 (MQ=255) ttCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGTTAACCAATCCGGCttt < 1:2784300/50‑1 (MQ=255) ttCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGTTAACCAATCCGGCtt < 1:2487230/49‑1 (MQ=255) ttCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGTTAACCAATCCGGCtt < 1:6906335/49‑1 (MQ=255) cAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGTTAACCAATCCGGCt > 1:4294384/1‑46 (MQ=255) cAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGTTAACCAATCCGGCt > 1:1361728/1‑46 (MQ=255) cAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGTTAACCAATCCGGCTTTTGGCGCTGATATCTACTGGCGt < 1:6121663/70‑1 (MQ=255) cAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGTTAACCAATCCGGCTTTTGGCGCTGATATCTACTGGCGt < 1:2727368/70‑1 (MQ=255) aaCACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGTTAACCAATCCGGCTTTTGGCGCTGATATCTACTGGCGTg < 1:7433306/70‑1 (MQ=255) aaCACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGTTAACCAATCCGGCTTTTGGCGCTGATATCTACTGGCGTg < 1:3922090/70‑1 (MQ=255) aaCACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGTTAACCAATCCGGCTTTTGGCGCTGATATCTACTGGCGTg < 1:3244217/70‑1 (MQ=255) acacCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGTTAACCAATCCGGCTTTTg > 1:1625005/1‑48 (MQ=255) acacCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGTTAACCAATCCGGCTTTTGGCGCTGATATCTACTGGCGTgtg > 1:4018683/1‑69 (MQ=255) | TTTAACGGTGCGGCAACGCAGGCCAATGCCGACGCGGTGGTGAAGGTGATGCTCGATCCTAAAGAGTTCAACACCTTTGTCCCGCTGGGAACGGCGGCGTTAACCAATCCGGCTTTTGGCGCTGATATCTACTGGCGTGGG > W3110S.gb/3229518‑3229658 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |