| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | 3152775 = | 69 (1.490) | 3 (0.070) | 3/90 | NT | 5.1% | coding (557/660 nt) | yghB | conserved inner membrane protein |
| ? | W3110S.gb | 3152797 = | 52 (1.280) | coding (579/660 nt) | yghB | conserved inner membrane protein | |||||
TGTGGGTCAGCGTGGTAACCAGTTTTGGCTATGCCTTAAGTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTT > W3110S.gb/3152706‑3152844 | tatttttttttaatcaccacaaacagcgtgcctaacaagccagcggttaacaaggcaattggcaggatcat > 1:1559167‑M1/70‑71 (MQ=255) atttttttttaatcaccacaaacagcgtgcctaacaagccagcggttaacaaggcaattggcaggatcat < 1:3757755‑M1/2‑1 (MQ=255) tttttttttaatcaccacaaacagcgtgcctaagaagccagcggttaacaaggcaattggcaggatcat < 1:3767481‑M1/2‑1 (MQ=255) tttttttttaatcaccacaaacagcgtgcctaacaagccagcggttaacaaggcaattggcaggatcat < 1:1429360‑M1/2‑1 (MQ=255) tttttttttaatcaccacaaacagcgtgcctaacaagccagcggttaacaaggcaattggaaggatcat < 1:229831‑M1/2‑1 (MQ=255) tgGGTCAGCGTGGTAACCAGTTTTGGCTATGCCTTAAGTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGAt < 1:4175195/69‑1 (MQ=255) tttttttaatcaccacaaacagcgtgcctaacaagccagcggttaacaaggcaattggcaggatcATCAg < 1:2201736‑M1/5‑1 (MQ=255) tttttttaatcaccacaaacagcgtgcctaacaagccagcggttaacaaggcaattggcaggatcATCAg < 1:147674‑M1/5‑1 (MQ=255) tttttttaatcaccacaaacagcgtgcctaacaagccagcggttaacaaggcaattggcaggatcATCAg < 1:1441092‑M1/5‑1 (MQ=255) ggTCAGCGTGGTAACCAGTTTTGGCTATGCCTTAAGTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAgg > 1:61601/1‑71 (MQ=255) tttttaatcaccacaaacagcgtgcctaacaagccagcggttaacaaggcaattggcaggatcATCAgg > 1:1158338‑M1/64‑69 (MQ=255) tCAGCGTGGTAACCAGTTTTGGCTATGCCTTAAGTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTa < 1:1024031/71‑1 (MQ=255) aGCGTGGTAACCAGTTTTGGCTATGCCTTAAGTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAAt < 1:2352761/71‑1 (MQ=255) cGTGGTAACCAGTTTTGGCTATGCCTTAAGTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGa > 1:2102254/1‑71 (MQ=255) gTGGTAACCAGTTTTGGCTATGCCTTAAGTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGAc < 1:1259143/71‑1 (MQ=255) gTGGTAACCAGTTTTGGCTATGCCTTAAGTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGAc > 1:1202496/1‑71 (MQ=255) tGGTAACCAGTTTTGGCTATGCCTTAAGTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACg < 1:3954039/71‑1 (MQ=255) caaacagcgtgcctaacaagccagcggttaacaaggcaattggcaggatcATCAGGTAATGACGTTCCtga < 1:3453819‑M1/21‑1 (MQ=255) cAGTTTTGGCTATGCCTTAAGTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCtga < 1:9468/71‑1 (MQ=255) cAGTTTTGGCTATGCCTTAAGTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCtga > 1:3897970/1‑71 (MQ=255) gTTTTGGCTATGCCTTAAGTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAATATCAGGTAATGACGTTCCtgatg < 1:3322367/71‑1 (MQ=255) gTTTTGGCTATGCCTTAAGTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCtg < 1:2755237/68‑1 (MQ=255) aacagcgtgcctaacaagccagcggttaacaaggcaattggcaggatcATCAGGTAATGACGTTCCtgatg > 1:175264‑M1/49‑71 (MQ=255) ttttGGCTATGCCTTAAGTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGtt < 1:2835048/63‑1 (MQ=255) ttttGGCTATGCCTTAAGTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCtgatga < 1:850551/71‑1 (MQ=255) ttttGGCTATGCCTTAAGTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCtgatga < 1:1769378/71‑1 (MQ=255) ttttGGCTATGCCTTAAGTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCtgatga < 1:2449507/71‑1 (MQ=255) acagcgtgcctaacaagccagcggttaacaaggcaattggcaggatcATCAGGTAATGACGTTCCtgatga > 1:3289416‑M1/48‑71 (MQ=255) ttGGCTATGCCTTAAGTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATc > 1:2824286/1‑71 (MQ=255) gtgcctaacaagccagcggttaacaaggcaattggcaggttcat > 1:3193931‑M1/43‑44 (MQ=255) gCTATGCCTTAAGTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCt < 1:2855892/70‑1 (MQ=255) gcctaacaagccagcggttaacaaggcaattggcaggatcat > 1:2888427‑M1/41‑42 (MQ=255) tGCCTTAAGTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGt < 1:4243873/45‑1 (MQ=255) tGCCTTAAGTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTATTGACGTTCCTGATGATCCTGcc < 1:4131611/69‑1 (MQ=255) tGCCTTAAGTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGcc < 1:1078629/69‑1 (MQ=255) tGCCTTAAGTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCaa > 1:3817430/1‑71 (MQ=255) tGCCTTAAGTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCa < 1:866978/70‑1 (MQ=255) gCCTTAAGTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTTCCAAt > 1:3281680/1‑71 (MQ=255) gCCTTAAGTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAAt > 1:2188474/1‑71 (MQ=255) ccTTAAGTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAAtt > 1:1417122/1‑71 (MQ=255) ttAAGTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAATTGc > 1:1642301/1‑71 (MQ=255) aaGTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAATTGCCt > 1:3399142/1‑71 (MQ=255) aaGTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAATTGCCt > 1:2073110/1‑71 (MQ=255) aGTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAATTGCCtt > 1:419308/1‑71 (MQ=255) gTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCa < 1:2729782/62‑1 (MQ=255) gTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAATTGCCt < 1:1288817/69‑1 (MQ=255) gTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAATTGCCt < 1:4218455/69‑1 (MQ=255) gTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAATTGCCTTg < 1:1228284/71‑1 (MQ=255) gTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAATTGCCTTg < 1:1169528/71‑1 (MQ=255) tATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAATTGCCTTg < 1:452293/70‑1 (MQ=255) tGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCtgat > 1:4222373/1‑49 (MQ=255) tGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAATTGCCTTGtt < 1:3141345/70‑1 (MQ=255) tGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAATTGCCTTGtt > 1:329053/1‑70 (MQ=255) gATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTa < 1:4010829/70‑1 (MQ=255) aTTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGa < 1:2405558/37‑1 (MQ=255) aTTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCt > 1:906599/1‑53 (MQ=255) ttCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCTGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAAcc < 1:3527859/71‑1 (MQ=255) cgttcgttAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGc < 1:2672502/70‑1 (MQ=255) cgttcgttAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCt < 1:1191326/71‑1 (MQ=255) cgttcgttAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCt < 1:3984643/71‑1 (MQ=255) cgttcgttAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCt < 1:1255198/71‑1 (MQ=255) gttcgttAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAGCCGCTg < 1:3266002/71‑1 (MQ=255) gttcgttAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCg < 1:2824671/68‑1 (MQ=255) gttcgttAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTg < 1:1140630/71‑1 (MQ=255) ttcgttAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAAcc < 1:2369644/66‑1 (MQ=255) ttcgttAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAAcc < 1:2261581/66‑1 (MQ=255) tcgttAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCtgatga > 1:3392609/1‑42 (MQ=255) tcgttAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCtgatga > 1:1281018/1‑42 (MQ=255) tcgttAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCtgatga > 1:3373197/1‑42 (MQ=255) cgttAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCt > 1:3462157/1‑71 (MQ=255) cgttAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCt > 1:2153063/1‑71 (MQ=255) ttAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCtgatga < 1:3114225/39‑1 (MQ=255) ttAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCtga < 1:2459440/36‑1 (MQ=255) aaaCGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCtgat > 1:529650/1‑35 (MQ=255) aaaCGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCaa > 1:2397102/1‑46 (MQ=255) aaaCGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGt < 1:324553/70‑1 (MQ=255) aaaCGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGt > 1:2015320/1‑70 (MQ=255) aaCGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGtt < 1:2172524/70‑1 (MQ=255) aCGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAg < 1:54992/71‑1 (MQ=255) cGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCa < 1:3020289/42‑1 (MQ=255) gCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGc < 1:3021216/71‑1 (MQ=255) gCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGc < 1:3857023/71‑1 (MQ=255) cATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCAc < 1:1636330/71‑1 (MQ=255) aTGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACg < 1:3764387/71‑1 (MQ=255) tGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAAt > 1:3124578/1‑39 (MQ=255) tGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAAt > 1:2125440/1‑39 (MQ=255) aaGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCa > 1:2027028/1‑66 (MQ=255) aaGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCa > 1:2513444/1‑66 (MQ=255) aGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGt < 1:2288680/71‑1 (MQ=255) ATCAGGTAATGACGATCCTGATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGtt > 1:4250304‑M1/1‑70 (MQ=255) | TGTGGGTCAGCGTGGTAACCAGTTTTGGCTATGCCTTAAGTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTT > W3110S.gb/3152706‑3152844 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |