| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | = 1773418 | 54 (1.170) | 4 (0.100) | 3/90 | NT | 7.4% | coding (634/1215 nt) | ydiM | predicted transporter |
| ? | W3110S.gb | = 1773431 | 52 (1.280) | coding (647/1215 nt) | ydiM | predicted transporter | |||||
TCATAAAGAAAACCACCAGCTCTACGGAACATCGCTGTTCAATTATCGATTTAGCCAGTTATACCTTATATGGCTATATCTCAATGGCAACGTTTTATCTGGTTAGCCAGTGGCTGGCACAGTACGGACAATTTGTTGC > W3110S.gb/1773362‑1773500 | tCATAAAGAAAACCACCAGCTCTACGGAACATCGCTGTTCAATTATCGATTTAGCCAGTTATACCTTATAt > 1:3199380‑M2/1‑70 (MQ=255) cATAAAGAAAACCACCAGCTCTACGGAACATCGCTGTTCAATTATCGATTTAGCCAGTTATACCTTATAtg < 1:68867‑M2/71‑3 (MQ=255) cATAAAGAAAACCACCAGCTCTACGGAACATCGCTGTTCAATTATCGATTTAGCCAGTTATACCTTATAtg < 1:3752852‑M2/71‑3 (MQ=255) aTAAAGAAAACCACCAGCTCTACGGAACATCGCTGTTCAATTATCGATTTAGCCAGTTATACCTTATAtgg < 1:3774040‑M2/71‑4 (MQ=255) aTAAAGAAAACCACCAGCTCTACGGAACATCGCTGTTCAATTATCGATTTAGCCAGTTATACCTTATAtg > 1:3193269‑M2/1‑68 (MQ=255) aTAAAGAAAACCACCAGCTCTACGGAACATCGCTGTTCAATTATCGATTTAGCCAGTTATACCTTATAtg > 1:686208‑M2/1‑68 (MQ=255) aTAAAGAAAACCACCAGCTCTACGGAACATCGCTGTTCAATTATCGATTTAGCCAGTTATACCTTATAtg > 1:128833‑M2/1‑68 (MQ=255) aaaGAAAACCACCAGCTCTACGGAACATCGCTGTTCAATTATCGATTTAGCCAGTTATACCTTATAtggc < 1:1740909‑M2/70‑5 (MQ=255) aaGAAAACCACCAGCTCTACGGAACATCGCTGTTCAATTATCGATTTAGCCAGTTATACCTTATAtggcta < 1:2869118‑M2/71‑7 (MQ=255) aaGAAAACCACCAGCTCTACGGAACATCGCTGTTCAATTATCGATTTAGCCAGTTATACCTTATAtggcta < 1:513619‑M2/71‑7 (MQ=255) aaGAAAACCACCAGCTCTACGGAACATCGCTGTTCAATTATCGATTTAGCCAGTTATACCTTATAtggct > 1:2243933‑M2/1‑65 (MQ=255) gAAAACCACCAGCTCTACGGAACATCGCTGTTCAATTATCGATTTAGCCAGTTATACCTTATAtggct > 1:551199‑M2/1‑63 (MQ=255) aaaaCCACCAGCTCTACGGAACATCGCTGTTCAATTATCGATTTAGCCAGTTATACCTTATATGGCtata > 1:534516/1‑70 (MQ=255) aaaCCACCAGCTCTACGGAACATCGCTGTTCAATTATCGATTTAGCCAGTTATACCTTATATGGCTATAtc > 1:1427974/1‑71 (MQ=255) accaccAGCTCTACGGAACATCGCTGTTCAATTATCGATTTAGCCAGTTATACCTTATATGGCTATAtctc < 1:167317/71‑1 (MQ=255) accaccAGCTCTACGGAACATCGCTGTTCAATTATCGATTTAGCCAGTTATACCTTATATGGCTATAtctc < 1:2321050/71‑1 (MQ=255) accaccAGCTCTACGGAACATCGCTGTTCAATTATCGATTTAGCCAGTTATACCTTATATGGCTATAtctc < 1:1264428/71‑1 (MQ=255) caccaGCTCTACGGAACATCGCTGTTCAATTATCGATTTAGCCAGTTATACCTTATATGGCTATATCTCaa < 1:1011984/71‑1 (MQ=255) accaGCTCTACGGAACATCGCTGTTCAATTATCGATTTAGCCAGTTATACCTTATATGGCTATATCTCAAt > 1:4236283/1‑71 (MQ=255) accaGCTCTACGGAACATCGCTGTTCAATTATCGATTTAGCCAGTTATACCTTATATGGCTATATCTCAAt < 1:3503448/71‑1 (MQ=255) accaGCTCTACGGAACATCGCTGTTCAATTATCGATTTAGCCAGTTATACCTTATATGGCTATATCTCAAt < 1:2059453/71‑1 (MQ=255) ccaGCTCTACGGAACATCGCTGTTCAATTATCGATTTAGCCAGTTATACCTTATATGGCTATATCTCAATg > 1:855843/1‑71 (MQ=255) cGGAACATCGCTGTTCAATTATCGATTTAGCCAGTTATACCTTATATGGCTATATCTCAATGGCAACg < 1:1107802/68‑1 (MQ=255) cGGAACATCGCTGTTCAATTATCGATTTAGCCAGTTATACCTTATATGGCTATATCTCAATGGCAACg < 1:2980494/68‑1 (MQ=255) ggAACATCGCTGTTCAATTATCGATTTAGCCAGTTATACCTTATAtggcta < 1:1796161‑M2/51‑7 (MQ=255) gAACATCGCTGTTCAATTATCGATTTAGCCAGTTATACCTtata > 1:2935672/1‑44 (MQ=255) aaCATCGCTGTTCAATTATGGATTTAGCCAGTTATACCTTATATGGCTATATCTCAATGGCAACGtttt < 1:2414329/69‑1 (MQ=255) aCATCGCTGTTCAATTATCGATTTAGCCAGTTATACCTTATATGGCTATATCTCAATGGCAACGTTTTATc < 1:2620381/71‑1 (MQ=255) aTCGCTGTTCAATTATCGATTTAGCCAGTTATACCTTATATGGCTATATCTCAATGGCAACGTTTTATCTg > 1:2720565/1‑71 (MQ=255) tCGCTGTTCAATTATCGATTTAGCCAGTTATACCTTATAtggcta < 1:2286268‑M2/45‑7 (MQ=255) tCGCTGTTCAATTATCGATTTAGCCAGTTATACCTTATATGGCTATATCTCAAt < 1:1685033/54‑1 (MQ=255) cGCTGTTCAATTATCGATTTAGCCAGTTATACCTTATATGGCTATATCTCAATGG‑GACGTTTTATCTGGt > 1:2512753/1‑70 (MQ=255) gCTGTTCAATTATCGATTTAGCCAGTTATACCTTATATGGCtata > 1:704050/1‑45 (MQ=255) cTGTTCAATTATCGATTTAGCCAGTTATACCTTATATGGCTATATCTCAATGGCAACGTTTTATCTGGTTa < 1:714850/71‑1 (MQ=255) gTTCAATTATCGATTTAGCCAGTTATACCTTATATGGCTATATCTCAATGGCAACGTTTTATCTGGTTAGc > 1:102730/1‑71 (MQ=255) ttCAATTATCGATTTAGCCAGTTATACCTTATATGGCTATATCTCAATGGCAACGTTTTATCTGGTTAg < 1:2666271/69‑1 (MQ=255) ttCAATTATCGATTTAGCCAGTTATACCTTATATGGCTATATCTCAATGGCAACGTTTTATCTGGTTAGcc < 1:2626979/71‑1 (MQ=255) ttCAATTATCGATTTAGCCAGTTATACCTTATATGGCTATATCTCAATGGCAACGTTTTATCTGGTTAGc > 1:2159220/1‑70 (MQ=255) ttCAATTATCGATTTAGCCAGTTATACCTTATATGGCTATATCTCAATGGCAACGTTTTATCTGGTTAGc < 1:2358816/70‑1 (MQ=255) ttCAATTATCGATTTAGCCAGTTATACCTTATATGGCTATATCTCAATGGCAACGTTTTATCTGGTTAGc > 1:3619968/1‑70 (MQ=255) cAATTATCGATTTAGCCAGTTATACCTTATATGGCTATATCTCaa > 1:1367884/1‑45 (MQ=255) cAATTATCGATTTAGCCAGTTATACCTTATATGGCTATATCTCAATGGCAACGTTTTAt > 1:2841476/1‑59 (MQ=255) cAATTATCGATTTAGCCAGTTATACCTTATATGGCTATATCTCAATGGCAACGTTTTATCTgg > 1:31142/1‑63 (MQ=255) aaTTATCGATTTAGCCAGTTATACCTTATATGGCTATATCTCAATGGCAACGTTTTATCTGGTTAGCCAGt < 1:4146694/71‑1 (MQ=255) ttATCGATTTAGCCAGTTATACCTTATATGGCTATATCTCaa > 1:2514399/1‑42 (MQ=255) ttATCGATTTAGCCAGTTATACCTTATATGGCTATATCTCAATGGCAACGTTTTATCTGGTTAGCCAGtgg < 1:1798038/71‑1 (MQ=255) tATCGATTTAGCCAGTTATACCTTATATGGCTATATCTCAATGGCAACGTTTTATCTGGTTAGCCAGtgg < 1:1111230/70‑1 (MQ=255) tCGATTTAGCCAGTTATACCTTATATGGCTATATCTCAATGGCAACGTTTTATCTGGTTAGCCAGtggctg > 1:3719017/1‑71 (MQ=255) tCGATTTAGCCAGTTATACCTTATATGGCTATATCTCAATGGCAACGTTTTATCTGGTTAGCCAGtggc < 1:1303441/69‑1 (MQ=255) gATTTAGCCAGTTATACCTTATATGGCTATATCTCAATGGCAACGTTTTATCTGGTTAGCCAGtggctg < 1:763564/69‑1 (MQ=255) aTTTAGCCAGTTATACCTTATAtggctaaatcgataattgaacagcgatgttccgt > 1:1664917‑M2/1‑22 (MQ=255) aTTTAGCCAGTTATACCTTATATGGCTATATCTCAATGGCAACGTTTTATCTGGTTAGCCAGTGGCTGGca < 1:1983306/71‑1 (MQ=255) tttAGCCAGTTATACCTTATATGGCTATATCTCAATGGCAACGTTTTATCTGGTTAGcc > 1:2707369/1‑59 (MQ=255) tttAGCCAGTTATACCTTATATGGCTATATCTCAATGGCAACGTTTTATCTGGTTAGCCAGTGGCTGGca > 1:3857266/1‑70 (MQ=255) tttAGCCAGTTATACCTTATATGGCTATATCTCAATGGCAACGTTTTATCTGGTTAGCCAGTGGCTGGca < 1:987740/70‑1 (MQ=255) ttAGCCAGTTATACCTTATAtggctaaatcgataattgaacagcgatgttccgtagagctggtggttttct < 1:1198325‑M2/71‑52 (MQ=255) ttAGCCAGTTATACCTTATAtggctaaatcgataattgaacagcgatgttccgtagagctggtggttttct < 1:892256‑M2/71‑52 (MQ=255) ttAGCCAGTTATACCTTATATGGCTATATCTCAATg > 1:3964570/1‑36 (MQ=255) tAGCCAGTTATACCTTATATGGCTATATCTCAATGGCAACGTTTTAt > 1:2297233/1‑47 (MQ=255) aGCCAGTTATACCTTATATGGCTATATCTCAATGGCAACGTTTTATCTGGTTAGCCAGTGGCTGGCACAg < 1:3215172/70‑1 (MQ=255) gCCAGTTATACCTTATATGGCTATATCTCAATGGCAACGTTTTATCTGGTTAGCCAGTGGCTGGCACAGt < 1:3933187/70‑1 (MQ=255) ccAGTTATACCTTATATGGCTATATCTCAATGGCAACGttt < 1:2017164/41‑1 (MQ=255) cAGTTATACCTTATATGGCTATATCTCAATGGCAACGTTTTATCTGGTTAGCCAGTGGCTGGCACAGTACg > 1:3193396/1‑71 (MQ=255) aGTTATACCTTATATGGCTATATCTCAATGGCAACGTTTTATCTGGTTAGCCAGTGGCTGGCACAGTACg > 1:524453/1‑70 (MQ=255) ttATACCTTATATGGCTATATCTCAATGGCAACGTTTTATCTGGTTAGcc < 1:3253955/50‑1 (MQ=255) ttATACCTTATATGGCTATATCTCAATGGCAACGTTTTATCTGGTTAGcc < 1:1307921/50‑1 (MQ=255) ttATACCTTATATGGCTATATCTCAATGGCAACGTTTTATCTGGTTAGcc < 1:751765/50‑1 (MQ=255) ttATACCTTATATGGCTATATCTCAATGGCAACGTTTTATCTGGTTAGCCAGTGGCTGGCACAGTACGGa > 1:1592052/1‑70 (MQ=255) ttATACCTTATATGGCTATATCTCAATGGCAACGTTTTATCTGGTTAGCCAGTGGCTGGCACAGTACGGAc < 1:3063635/71‑1 (MQ=255) ataCCTTATATGGCTATATCTCAATGGCAACGTTTTAt > 1:1359795/1‑38 (MQ=255) taCCTTATAtggctaaatcgataattgaacagcgatgttccgtagagctggtggttttctttatgacaggt > 1:235038‑M2/1‑9 (MQ=255) taCCTTATATGGCTATATCTCAATGGCAACGTTTTATCTGGTTAGCCAGTGGCTGGCACAGTACGGACAAt > 1:2140609/1‑71 (MQ=255) ccTTATATGGCTATATCTCAATGGCAACGTTTTATCTGGTTAGCCAGTGGCTGGCACAGTACGGACAAtt > 1:2116051/1‑70 (MQ=255) cTTATATGGCTATATCTCAATGGCAACGTTTTATCTGGTTAGCCAGTGGCTGGCACAGTACGGACAAttt < 1:1013189/70‑1 (MQ=255) tataTGGCTATATCTCAATGGCAACGTTTTATCTGGTTAGCCAGTGGCTGGCACAGTACGGACAATttgtt > 1:198981/1‑71 (MQ=255) atatGGCTATATCTCAATGGCAACGTTTTATCTGGTTAGCCAGTGGCTGGCACAGTACGGACAAtt > 1:2085148/1‑66 (MQ=255) tatGGCTATATCTCAATGGCAACGTTTTATCTGGTTAGCCAGTGGCTGGCACAGTACGGACAATttgttg < 1:2045957/70‑1 (MQ=255) tatGGCTATATCTCAATGGCAACGTTTTATCTGGTTAGCCAGTGGCTGGCACAGTACGGACAATttgttg > 1:519490/1‑70 (MQ=255) tatGGCTATATCTCAATGGCAACGTTTTATCTGGTTAGCCAGTGGCTGGCACAGTACGGACAATttgttg < 1:2135291/70‑1 (MQ=255) tatGGCTATATCTCAATGGCAACGTTTTATCTGGTTAGCCAGTGGCTGGCACAGTACGGACAATttgttg < 1:3767701/70‑1 (MQ=255) atGGCTATATCTCAATGGCAACGTTTTATCTGGTTAGCCAGTGGCTGGCACAGTACGGACAATTTGTTGc < 1:2035792/70‑1 (MQ=255) | TCATAAAGAAAACCACCAGCTCTACGGAACATCGCTGTTCAATTATCGATTTAGCCAGTTATACCTTATATGGCTATATCTCAATGGCAACGTTTTATCTGGTTAGCCAGTGGCTGGCACAGTACGGACAATTTGTTGC > W3110S.gb/1773362‑1773500 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |