| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | 2340750 = | 64 (1.280) | 4 (0.090) | 3/90 | NT | 6.8% | coding (565/1689 nt) | yfaA | hypothetical protein |
| ? | W3110S.gb | 2340779 = | 54 (1.220) | coding (536/1689 nt) | yfaA | hypothetical protein | |||||
AGTCGCGAACATCAGGGCGTTATTGCCGTTATAGCGCAACTGATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAACTGGCTGTCGCTGGTAGCGGCAAACAACAATGGCTC > W3110S.gb/2340709‑2340843 | aGTCGCGAACATCAGGGCGTTATTGCCGTTATAGCGCAACTGATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCt < 1:130689/71‑1 (MQ=255) gTCGCGAACATCAGGGCGTTATTGCCGTTATAGCGCAACTGATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCtt > 1:3583997/1‑71 (MQ=255) gTCGCGAACATCAGGGCGTTATTGCCGTTATAGCGCAACTGATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCtt < 1:842113/71‑1 (MQ=255) gTCGCGAACATCAGGGCGTTATTGCCGTTATAGCGCAACTGATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCtt > 1:842312/1‑71 (MQ=255) gcgAACATCAGGGCGTTATTGCCGTTATAGCGCAACTGATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGAt < 1:1927805/71‑1 (MQ=255) cgAACATCAGGGCGTTATTGCCGTTATAGCGCAACTGATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATg < 1:2093801/71‑1 (MQ=255) gAACATCAGGGCGTTATTGCCGTTATAGCGCAACTGATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGc < 1:2721665/71‑1 (MQ=255) gAACATCAGGGCGTTATTGCCGTTATAGCGCAACTGATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGc < 1:1798898/71‑1 (MQ=255) gAACATCAGGGCGTTATTGCCGTTATAGCGCAACTGATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGc < 1:864512/71‑1 (MQ=255) aCATCAGGGCGTTATTGCCGTTATAGCGCAACTGATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTa > 1:610914/1‑71 (MQ=255) aCATCAGGGCGTTATTGCCGTTATAGCGCAACTGATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTa > 1:1765310/1‑71 (MQ=255) ggCGTTATTGCCGTTATAGCGCAACTGATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGAttt < 1:58306/71‑1 (MQ=255) gCGTTATTGCCGTTATAGCGCAACTGATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTg > 1:1766654/1‑66 (MQ=255) cGTTATTGCCGTTATAGCGCAACTGATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTcc < 1:751263/71‑1 (MQ=255) gTTATTGCCGTTATAGCGCAACTGATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCg < 1:2148389/71‑1 (MQ=255) ttATTGCCGTTATAGCGCAACTGATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGa < 1:3283796/55‑1 (MQ=255) aTTGCCGTTATAGCGCAACTGATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTTATTTc < 1:1254238/66‑1 (MQ=255) aTTGCCGTTATAGCGCAACTGATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGttt > 1:2350266/1‑71 (MQ=255) ttGCCGTTATAGCGCAACTGATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGtttt > 1:3125679/1‑71 (MQ=255) ttGCCGTTATAGCGCAACTGATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGtttt > 1:2424969/1‑71 (MQ=255) gCCGTTATAGCGCAACTGATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGAt > 1:3894895/1‑51 (MQ=255) gCCGTTATAGCGCAACTGATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTg < 1:1757952/70‑1 (MQ=255) ccGTTATAGCGCAACTGATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCg < 1:3889699/64‑1 (MQ=255) cGTTATAGCGCAACTGATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCtt < 1:1012644/71‑1 (MQ=255) cGTTATAGCGCAACTGATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCtt < 1:2252353/71‑1 (MQ=255) gTTATAGCGCAACTGATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTAc > 1:1435989/1‑53 (MQ=255) gTTATAGCGCAACTGATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGt > 1:2775116/1‑63 (MQ=255) ttATAGCGCAACTGATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTaa < 1:271820/71‑1 (MQ=255) ttATAGCGCAACTGATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTaa > 1:403604/1‑71 (MQ=255) ataGCGCAACTGATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCtt > 1:3956753/1‑42 (MQ=255) ataGCGCAACTGATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGa > 1:3383228/1‑44 (MQ=255) ataGCGCAACTGATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAAc < 1:1503097/70‑1 (MQ=255) ataGCGCAACTGATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAACt > 1:696840/1‑71 (MQ=255) gcgcAACTGATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCtt < 1:2689190/64‑1 (MQ=255) gcgcAACTGATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAACTgg < 1:2660019/70‑1 (MQ=255) cgcAACTGATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCt > 1:3147970/1‑62 (MQ=255) gcAACTGATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAAc > 1:688940/1‑65 (MQ=255) aaCTGATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAACTGGCTGTc > 1:1770953/1‑71 (MQ=255) cTGATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAACTGGCTGTCga > 1:2302805/1‑70 (MQ=255) cTGATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAACTGGCTGTCGc < 1:2743828/71‑1 (MQ=255) cTGATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAACTGGCTGTCGc > 1:3063195/1‑71 (MQ=255) cTGATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGGTTTGCTTAACTGGCTGTCGc < 1:3825030/71‑1 (MQ=255) GATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTaa < 1:1538920‑M1/58‑1 (MQ=255) GATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCATTTTGCTTAACTGGCTGTCGCTg < 1:3452454‑M1/71‑1 (MQ=255) GATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCATTTTGCTTAACTGGCTGTCGCTg < 1:3457922‑M1/71‑1 (MQ=255) ATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCg > 1:627923‑M1/1‑47 (MQ=255) ATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAAc > 1:1565883‑M1/1‑58 (MQ=255) ATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAACTGGCTGTCGCTgg < 1:619787‑M1/71‑1 (MQ=255) ATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAACTGGCTGTCGCTgg > 1:3945154‑M1/1‑71 (MQ=255) TAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGAt < 1:1237512‑M1/41‑1 (MQ=255) TAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAACTGGCTGTCGCTgg < 1:3217660‑M1/70‑1 (MQ=255) AAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAACTGGCTGTCGCTgg < 1:2943081‑M1/69‑1 (MQ=255) aatagtgaaactgttcctgtttatcTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAACTGGCTGTCGCTGGTAg < 1:909918‑M2/46‑1 (MQ=255) AACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAACTGGCTGTCGCTGGTa > 1:3864435‑M1/1‑70 (MQ=255) AACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAACTGGCTGTCGCTGGTAg > 1:2305490‑M1/1‑71 (MQ=255) ACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAACTGGCTGTCGCTGGTAGc > 1:1711923‑M1/1‑71 (MQ=255) ACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAACTGGCTGTCGCTGGTAGc > 1:935166‑M1/1‑71 (MQ=255) agtgaaactgttcctgtttatcTTGATGCTACTGATTTCCGtttt > 1:2382347‑M2/23‑45 (MQ=255) agtgaaactgttcctgtttatcTTGATGCTACTGATTTCCGtttt > 1:207919‑M2/23‑45 (MQ=255) aGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGt < 1:2598746/42‑1 (MQ=255) aGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAACTGGCTGt > 1:3209987/1‑59 (MQ=255) aGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAACTGGCTGt > 1:2493105/1‑59 (MQ=255) aGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAACTGGCTGTCGc < 1:2741947/62‑1 (MQ=255) tgaaactgttcctgtttatcTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAACTGGCTGTCGCTGGTAGCgg < 1:4580155‑M2/49‑1 (MQ=255) gAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGtt < 1:104624/41‑1 (MQ=255) gAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTg > 1:992397/1‑44 (MQ=255) aCAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAACTgg > 1:244042/1‑51 (MQ=255) aCAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAACTGGCTGt > 1:75249/1‑55 (MQ=255) cAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGtttt > 1:2965497/1‑40 (MQ=255) cAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAAc < 1:586332/47‑1 (MQ=255) cAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAACTGGCTGTCGCTGGTAGCGGCaaa > 1:3199845/1‑70 (MQ=255) cAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAACTGGCTGTCGCTGGTAGCGGCaaa > 1:4037519/1‑70 (MQ=255) tttCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCtt < 1:107808/41‑1 (MQ=255) tttCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAACTGGCTGTCGCTGGTAGCGGCAaacaac < 1:2870059/71‑1 (MQ=255) tttCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAACTGGCTGTCGCTCGTAGCGGCAaacaac < 1:4605812/71‑1 (MQ=255) ttCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTg < 1:979970/37‑1 (MQ=255) ttCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAACTGGCTGTCGCTGGTAGCGGCAaac < 1:1865061/67‑1 (MQ=255) tCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAACTGGCTGTCGCt > 1:299609/1‑53 (MQ=255) tCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAACTGGCTGTCGCTGGTAGCGGCAaaca < 1:1854307/67‑1 (MQ=255) tCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAACTGGCTGTCGCTGGTAGCGGCAAacaaca < 1:4205876/70‑1 (MQ=255) tCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAACTGGCTGTCGCTGGTAGCGGCAAAcaacaa > 1:3409830/1‑71 (MQ=255) cACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAACTGGCTGTCGCTGGTAGCGGCAAAcaacaa < 1:3116710/70‑1 (MQ=255) aCTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAACTGGCTGTCGCTGGTAGCGGCAaacaa > 1:1208193/1‑66 (MQ=255) aCTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAACTGGCTGTCGCTGGTAGCGGCAAACAACAAt < 1:1926393/70‑1 (MQ=255) aCTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAACTGGCTGTCGCTGGTAGCGGCAAACAACAAt < 1:192026/70‑1 (MQ=255) aCTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAACTGGCTGTCGCTGGTAGCGGCAAACAACAATg < 1:2029892/71‑1 (MQ=255) tATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAACTGGCTGTc < 1:1605610/46‑1 (MQ=255) tttatcTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTACCTGGCt < 1:4442362‑M2/35‑1 (MQ=255) tttatcTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAACTgg > 1:179476‑M2/7‑39 (MQ=255) tttatcTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAACTGGCTGTCGc > 1:3075542‑M2/7‑46 (MQ=255) tttatcTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAACTGGCTGTCGc > 1:2874572‑M2/7‑46 (MQ=255) tttatcTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAACTGGCTGTCGc > 1:4485997‑M2/7‑46 (MQ=255) tttatcTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAACTGGCTGTCGCTGGTAGCGGCAAACAACAATGGCTc > 1:785746‑M2/7‑71 (MQ=255) ttatcTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAACTGGCTGTCGCTGGTAGc < 1:4022299‑M2/47‑1 (MQ=255) tatcTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAACTGGCTGTCGCTGGTAGCGGCAAACAACAATGGCTc > 1:1410763‑M2/5‑69 (MQ=255) atcTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAACTGGCTGTCGCTGGTAGCgg > 1:978233‑M2/4‑52 (MQ=255) | AGTCGCGAACATCAGGGCGTTATTGCCGTTATAGCGCAACTGATAAACAGGAACAGTTTCACTATTTATCTTGATGCTACTGATTTCCGTTTTGCTTAACTGGCTGTCGCTGGTAGCGGCAAACAACAATGGCTC > W3110S.gb/2340709‑2340843 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |