| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | 3589856 = | 40 (0.800) | 3 (0.070) | 3/86 | NT | 8.9% | intergenic (‑141/‑223) | polA/yihG | fused DNA polymerase I 5'‑>3' exonuclease, 3'‑>5' polymerase and 3'‑>5' exonuclease/predicted endonuclease |
| ? | W3110S.gb | 3589885 = | 28 (0.660) | intergenic (‑170/‑194) | polA/yihG | fused DNA polymerase I 5'‑>3' exonuclease, 3'‑>5' polymerase and 3'‑>5' exonuclease/predicted endonuclease | |||||
CTGGATCGCTCGCAAATCGTCATGTGGATAACTTTGTGCATAAATTATTTACATCGCTTTTAATTTATTATCATGCTTTTTACAGCATGATGTTTGTCTTTGTTTTTCATGCAGTTAAAAATAAATCCATCCCTAA > W3110S.gb/3589817‑3589952 | aaaaacaaagacaaacatcatgctgtaaaaagcatgataATAAATTATTTACATCGCTTTTAATttatta > 1:2562818‑M1/40‑70 (MQ=255) gATCGCTCGCAAATCGTCATGTGGATAACTTTGTGCATAAATTATTTACATCGCTTTTAATTTATTATc < 1:2083187/69‑1 (MQ=255) gATCGCTCGCAAATCGTCATGTGGATAACTTTGTGCATAAATTATTTACATCGCTTTTAATTTATTATCa < 1:3954708/70‑1 (MQ=255) cgctcgcAAATCGTCATGTGGATAACTTTGTGCATAAATTATTTACATCGCTTTTAATTTATTATCATGCt > 1:4551272/1‑71 (MQ=255) cgctcgcAAATCGTCATGTGGATAACTTTGTGCATAAATTATTTACATAGCTTTTAATTTATTATCATGc < 1:1986027/70‑1 (MQ=255) gctcgcAAATCGTCATGTGGATAACTTTGTGCATAAATTATTTACATCGCTTTTAATTTATTATCATGCtt > 1:3116131/1‑71 (MQ=255) gcAAATCGTCATGTGGATAACTTTGTGCATAAATTATTTACATCGCTTTTAATTtattat > 1:2005314/1‑60 (MQ=255) gcAAATCGTCATGTGGATAACTTTGTGCATAAATTATTTACATCGCTTTTAATTTATTATCATGCtttt < 1:553265/69‑1 (MQ=255) gcAAATCGTCATGTGGATAACTTTGTGCATAAATTATTTACATCGCTTTTAATTTATTATCATGCtttt < 1:3408239/69‑1 (MQ=255) aaaTCGTCATGTGGATAACTTTGTGCATAAATTATTTACATCGCTTTTAATTTATTATc < 1:2533229/59‑1 (MQ=255) tCGTCATGTGGATAACTTTGTGCATAAATTATTTACATCGCTTTTAATTTATTATCATGCTTTTTACAGCa > 1:617959/1‑71 (MQ=255) tCATGTGGATAACTTTGTGCATAAATTATTTACATCGCTTTTAATTTATTATCATGCTTTTTACAGCatga < 1:2733488/71‑1 (MQ=255) tgtgGATAACTTTGTGCATAAATTATTTACATCGCTTTTAATTTATTATCATGCTTTTTACAGCATGATGt < 1:3868521/71‑1 (MQ=255) tgGATAACTTTGTGCATAAATTATTTACATCGCTTTTAATttatt < 1:329079/45‑1 (MQ=255) aTAAATTTGTGCATAAATTATTTACATCGCTTTTAATTTATTATCATGCTTTTTACAGCATGATGTTTGt > 1:1916440/1‑70 (MQ=255) aaCTTTGTGCATAAATTATTTACATCGCTTTTAATTTATTATCATGCTTTTTa > 1:2967628/1‑53 (MQ=255) tttGTGCATAAATTATTTACATCGCTTTTAATTTATTATCATGCTTTTTACAGCATGATGTTTGTCtt < 1:3134774/68‑1 (MQ=255) tttGTGCATAAATTATTTACATCGCTTTTAATTTATTATCATGCTTTTTACAGCATGATGTTTGTCTTTg > 1:3301410/1‑70 (MQ=255) tgtgCATAAATTATTTACATCGCTTTTAATttatta > 1:281600/1‑36 (MQ=255) tgtgCATAAATTATTTACATCGCTTTTAATTTATTATCATGCTTTTTAAAGCATGATGTTTGTCTTTGt < 1:1137069/69‑1 (MQ=255) tgCATAAATTATTTACATCGCTTTTAATTTATTATCATGCTTTTTACAGCATGATGTTTGTGTTTGtttt < 1:648680/70‑1 (MQ=255) tgCATAAATTATTTACATCGCTTTTAATTTATTATCATGCTTTTTACAGCATGATGTTTGTCTTTGttttt < 1:381053/71‑1 (MQ=255) tgCATAAATTATTTACATCGCTTTTAATTTATTATCATGCTTTTTACAGCATGATGTTTGTCTTTGttttt < 1:1144093/71‑1 (MQ=255) tgCATAAATTATTTACATCGCTTTTAATTTATTATCATGCTTTTTACAGCATGATGTTTGTCTTTGttttt < 1:2578497/71‑1 (MQ=255) tgCATAAATTATTTACATCGCTTTTAATTTATTATCATGCTTTTTACAGCATGATGTTTGTCTTTGtttt < 1:1617968/70‑1 (MQ=255) taataaattaaaagcgatgtaaataatttatTATCATGCTTTTTACAGCATGATGTTTGTCTTTGttttt > 1:2562818‑M2/32‑70 (MQ=255) gCATATATTATTTAGATCGCTTTTAATTTATTATCATGCTTTTTACAGCATGATGTTTGTCTTTGt < 1:2631066/66‑1 (MQ=255) cATAAATTATTTACATCGCTTTTAATTTATTATCATGCTTTTTACAGCATGATGTTTGTCTTTGTTTTTCa < 1:2319961/71‑1 (MQ=255) ATAAATTATTTACATCGCTTTTAATTTATTATCATGCtttt > 1:942222‑M1/1‑41 (MQ=255) ATAAATTATTTACATCGCTTTTAATTTATTATCATGCTTTTTACAGCATGATGTTTGTCTTTg < 1:928459‑M1/63‑1 (MQ=255) ATAAATTATTTACATCGCTTTTAATTTATTATCATGCTTTTTACAGCATGATGTTTGTCTTTGTTTTTCAt > 1:1697101‑M1/1‑71 (MQ=255) TAAATTATTTACATCGCTTTTAATTTATTATCATGCTTTTTACAGCATGATGTTTGTCTTTGTTTTTCATg > 1:4096290‑M1/1‑71 (MQ=255) TAAATTATTTACATCGCTTTTAATTTATTATCATGCTTTTTACAGCATGATGTTTGTCTTTGTTTTTCATg > 1:4178769‑M1/1‑71 (MQ=255) AAATTATTTACATCGCTTTTAATTTATTATCATGCTTTTTACAGCATGATGTTTGTCTTTGTTTTTCa < 1:2581035‑M1/68‑1 (MQ=255) AATTATTTACATCGCTTTTAATTTATTATCATGCTTTTTa < 1:2511151‑M1/40‑1 (MQ=255) AATTATTTACATCGCTTTTAATTTATTATCATGCTTTTTa < 1:3212298‑M1/40‑1 (MQ=255) AATTATTTACATCGCTTTTAATTTATTATCATGCTTTTTa < 1:4434664‑M1/40‑1 (MQ=255) AATTATTTACATCGCTTTTAATTTATTATCATGCTTTTTACAGCATGATGttt > 1:899336‑M1/1‑53 (MQ=255) AATTATTTACATCGCTTTTAATTTATTATCATGCTTTTTACAGCATGATGTTTGTCTTTGTTTTTCATg < 1:4150411‑M1/69‑1 (MQ=255) AATTATTTACATCGCTTTTAATTTATTATCATGCTTTTTACAGCATGATGTTTGTCTTTGTTTTTCATg < 1:1394262‑M1/69‑1 (MQ=255) AATTATTTACATCGCTTTTAATTTATTATCATGCTTTTTACAGCATGATGTTTGTCTTTGTTTTTCATGc > 1:4138627‑M1/1‑70 (MQ=255) ATTATTTACATCGCTTTTAATTTATTATCATGCTTTTTACAGCATGATGTTTGTCTTTGTTTTTCAt < 1:1952321‑M1/67‑1 (MQ=255) TTATTTACATCGCTTTTAATTTATTATCATGCTTTTTACAGCATGATGTTTGTCtt > 1:1378565‑M1/1‑56 (MQ=255) aaaagcgatgtaaataatttatTATCATGCTTTTTACAGCATGATGTTTGTCTTTGTTTTTCATGCAGtt < 1:815386‑M2/48‑1 (MQ=255) ATTTACATCGCTTTTAATTTATTATCATGCTTTTTACAGCATGATGTTTGTCTTTGTTTTTCATGCAGtt > 1:453268‑M1/1‑70 (MQ=255) ATTTACATCGCTTTTAATTTATTATCATGCTTTTTACAGCATGATGTTTGTCTTTGTTTTTCATGCAGtt < 1:4018864‑M1/70‑1 (MQ=255) ttACATCGCTTTTAATTTTTTATCATGCTTTTTACAGCATGATGTTTGTCTTTGTTTTTCATGCAGTTaa > 1:2626646/1‑70 (MQ=255) agcgatgtaaataatttatTATCATGCTTTTTACAGCATGATGTTTGTCTTTGTTTTTc > 1:4353951‑M2/20‑59 (MQ=255) cATCGCTTTTAATTTATTATCATGCTTTTTACAGCATGATGTTTGTCTTTGTTTTTCATGCAGTTaaaaa > 1:552707/1‑70 (MQ=255) cATCGCTTTTAATTTATTATCATGCTTTTTACAGCATGATGTTTGTCTTTGTTTTTCATGCAGTTaaaaa > 1:3003422/1‑70 (MQ=255) cATCGCTTTTAATTTATTATCATGCTTTTTACAGCATGATGTTTGTCTTTGTTTTTCATGCAGTTAAaaat < 1:1496098/71‑1 (MQ=255) aTCGCTTTTAATTTATTATCATGCTTTTTACAGCATGATGTTTGTCTTTGTTTTTCATGCAGTTAAaaata < 1:3543961/71‑1 (MQ=255) tCGCTTTTAATTTATTATCATGCTTTTTACAGCATGATGTTTGTCTTTGttttt < 1:4560620/54‑1 (MQ=255) cGCTTTTAATTTATTATCATGCTTTTTACAGCATGATGt > 1:3202146/1‑39 (MQ=255) cGCTTTTAATTTATTATCATGCTTTTTACAGCATGATGt > 1:745491/1‑39 (MQ=255) cTTTTAATTTATTATCATGCTTTTTACAGCATGATGTTTGTCTTTGttt < 1:2269384/49‑1 (MQ=255) ttttAATTTATTATCATGCTTTTTACAGCATGATGTTTGTCTTTGt < 1:4225999/46‑1 (MQ=255) ttttAATTTATTATCATGCTTTTTACAGCATGATGTTTGTCTTTGTTTTTCAt < 1:2820261/53‑1 (MQ=255) tttAATTTATTATCATGCTTTTTACAGCATGATGTTTGTCTTTGttttt > 1:2095705/1‑49 (MQ=255) tttAATTTATTATCATGCTTTTTACAGCATGATGTTTGTCTTTGTTTTTCATGCAGTTAAAAATAAatcca > 1:3847726/1‑71 (MQ=255) ttAATTTATTATCATGCTTTTTACAGCATGATGTTTGTCTTTGTTTTTCATGCAGTTAAAAATAAatcca < 1:2823384/70‑1 (MQ=255) ttAATTTATTATCATGCTTTTTACAGCATGATGTTTGTCTTTGTTTTTCATGCAGTTAAAAATAAatcca < 1:4365369/70‑1 (MQ=255) taatttatTATCATGCTTTTTACAGCATGATGTTTGTCTTTGTTTTTCATGCAGTTAAAAATAAatccat < 1:3259763‑M2/62‑1 (MQ=255) atttatTATCATGCTTTTTACAGCATGATGTTTGTCTTTGTTTTTCATGCAGTTAAaaat < 1:2636851‑M2/54‑1 (MQ=255) tttatTATCATGCTTTTTACAGCATGATGTTTGTCTTTGttttt < 1:3378177‑M2/39‑1 (MQ=255) tatTATCATGCTTTTTACAGCATGATGTTTGTCTTTGTTTTTCATGCAGTTAAAAATAAATCCATCCCtaa > 1:860783‑M2/4‑71 (MQ=255) tatTATCATGCTTTTTACAGCATGATGTTTGTCTTTGTTTTTCATGCAGTTAAAAATAAATCCATCACtaa > 1:2368625‑M2/4‑71 (MQ=255) gtTATCATGCTTTTTACAGCATGATGTTTGTCTTTGTTTTTCATGCAGTTAAAAATAAATCCATCCCtaa > 1:2932400‑M2/3‑70 (MQ=255) atTATCATGCTTTTTACAGCATGATGTTTGTCTTTGTTTTTCATGCAGTTAAAAATAAATCCATCGCtaa > 1:2932398‑M2/3‑70 (MQ=255) | CTGGATCGCTCGCAAATCGTCATGTGGATAACTTTGTGCATAAATTATTTACATCGCTTTTAATTTATTATCATGCTTTTTACAGCATGATGTTTGTCTTTGTTTTTCATGCAGTTAAAAATAAATCCATCCCTAA > W3110S.gb/3589817‑3589952 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |