Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3097933	3098104	172	42 [1]	[0] 25	yggM	conserved hypothetical protein

AAAGTTCACCGACCAGCCAGACGCGGGCGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTAC  >  W3110S.gb/3097871‑3097933                                                              |  aaaGTTCACCGACCAGCCAGACGCGGGCGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTa   >  1:709040/1‑62 (MQ=255) aaaGTTCACCGACCAGCCAGACGCGGGCGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTa   >  1:1041498/1‑62 (MQ=255) aaaGTTCACCGACCAGCCAGACGCGGGCGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTa   >  1:408576/1‑62 (MQ=255) aaaGTTCACCGACCAGCCAGACGCGGGCGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTa   >  1:462764/1‑62 (MQ=255) aaaGTTCACCGACCAGCCAGACGCGGGCGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTa   >  1:517664/1‑62 (MQ=255) aaaGTTCACCGACCAGCCAGACGCGGGCGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTa   >  1:560983/1‑62 (MQ=255) aaaGTTCACCGACCAGCCAGACGCGGGCGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTa   >  1:580834/1‑62 (MQ=255) aaaGTTCACCGACCAGCCAGACGCGGGCGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTa   >  1:582009/1‑62 (MQ=255) aaaGTTCACCGACCAGCCAGACGCGGGCGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTa   >  1:609632/1‑62 (MQ=255) aaaGTTCACCGACCAGCCAGACGCGGGCGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTa   >  1:627203/1‑62 (MQ=255) aaaGTTCACCGACCAGCCAGACGCGGGCGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTa   >  1:664951/1‑62 (MQ=255) aaaGTTCACCGACCAGCCAGACGCGGGCGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTa   >  1:403362/1‑62 (MQ=255) aaaGTTCACCGACCAGCCAGACGCGGGCGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTa   >  1:731279/1‑62 (MQ=255) aaaGTTCACCGACCAGCCAGACGCGGGCGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTa   >  1:764386/1‑62 (MQ=255) aaaGTTCACCGACCAGCCAGACGCGGGCGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTa   >  1:816142/1‑62 (MQ=255) aaaGTTCACCGACCAGCCAGACGCGGGCGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTa   >  1:843842/1‑62 (MQ=255) aaaGTTCACCGACCAGCCAGACGCGGGCGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTa   >  1:903634/1‑62 (MQ=255) aaaGTTCACCGACCAGCCAGACGCGGGCGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTa   >  1:909909/1‑62 (MQ=255) aaaGTTCACCGACCAGCCAGACGCGGGCGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTa   >  1:911713/1‑62 (MQ=255) aaaGTTCACCGACCAGCCAGACGCGGGCGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTa   >  1:961368/1‑62 (MQ=255) aaaGTTCACCGACCAGCCAGACGCGGGCGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTa   >  1:979809/1‑62 (MQ=255) aaaGTTCACCGACCAGCCAGACGCGGGCGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTa   >  1:1302795/1‑62 (MQ=255) aaaGTTCACCGACCAGCCAGACGCGGGCGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTa   >  1:1104268/1‑62 (MQ=255) aaaGTTCACCGACCAGCCAGACGCGGGCGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTa   >  1:1136697/1‑62 (MQ=255) aaaGTTCACCGACCAGCCAGACGCGGGCGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTa   >  1:1178326/1‑62 (MQ=255) aaaGTTCACCGACCAGCCAGACGCGGGCGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTa   >  1:1185056/1‑62 (MQ=255) aaaGTTCACCGACCAGCCAGACGCGGGCGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTa   >  1:120775/1‑62 (MQ=255) aaaGTTCACCGACCAGCCAGACGCGGGCGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTa   >  1:1209084/1‑62 (MQ=255) aaaGTTCACCGACCAGCCAGACGCGGGCGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTa   >  1:1221336/1‑62 (MQ=255) aaaGTTCACCGACCAGCCAGACGCGGGCGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTa   >  1:1242431/1‑62 (MQ=255) aaaGTTCACCGACCAGCCAGACGCGGGCGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTa   >  1:1249288/1‑62 (MQ=255) aaaGTTCACCGACCAGCCAGACGCGGGCGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTa   >  1:393488/1‑62 (MQ=255) aaaGTTCACCGACCAGCCAGACGCGGGCGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTa   >  1:1312857/1‑62 (MQ=255) aaaGTTCACCGACCAGCCAGACGCGGGCGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTa   >  1:131409/1‑62 (MQ=255) aaaGTTCACCGACCAGCCAGACGCGGGCGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTa   >  1:1406657/1‑62 (MQ=255) aaaGTTCACCGACCAGCCAGACGCGGGCGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTa   >  1:1410485/1‑62 (MQ=255) aaaGTTCACCGACCAGCCAGACGCGGGCGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTa   >  1:1416638/1‑62 (MQ=255) aaaGTTCACCGACCAGCCAGACGCGGGCGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTa   >  1:230908/1‑62 (MQ=255) aaaGTTCACCGACCAGCCAGACGCGGGCGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTa   >  1:243733/1‑62 (MQ=255) aaaGTTCACCGACCAGCCAGACGCGCGCGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTa   >  1:127742/1‑62 (MQ=255) aaaGTTAACCGACCAGCCAGACGCGGGCGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTa   >  1:516519/1‑62 (MQ=255)  aaGTTCACCGACCAGCCAGACGCGGGCGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTAc  >  1:1368406/1‑62 (MQ=255)                                                              |  AAAGTTCACCGACCAGCCAGACGCGGGCGTTCCTTTACTGGTTAACATCGCCGAGAATTTTAC  >  W3110S.gb/3097871‑3097933

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑