Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3097933	3098104	172	42 [1]	[0] 25	yggM	conserved hypothetical protein

ATACTGCTTTTTGAATTGATCTTTTAAGATATTTTCAGTTGGCGGTTCGCCATCTGCC  >  W3110S.gb/3098105‑3098162 |                                                          aTACTGCTTTTTGAATTGATCTTTTAAGATATTTTCAGTTGGCGGTTCGCCATCTGcc  <  1:205621/58‑1 (MQ=255) aTACTGCTTTTTGAATTGATCTTTTAAGATATTTTCAGTTGGCGGTTCGCCATCTGcc  <  1:990967/58‑1 (MQ=255) aTACTGCTTTTTGAATTGATCTTTTAAGATATTTTCAGTTGGCGGTTCGCCATCTGcc  <  1:938632/58‑1 (MQ=255) aTACTGCTTTTTGAATTGATCTTTTAAGATATTTTCAGTTGGCGGTTCGCCATCTGcc  <  1:91377/58‑1 (MQ=255) aTACTGCTTTTTGAATTGATCTTTTAAGATATTTTCAGTTGGCGGTTCGCCATCTGcc  <  1:866331/58‑1 (MQ=255) aTACTGCTTTTTGAATTGATCTTTTAAGATATTTTCAGTTGGCGGTTCGCCATCTGcc  <  1:709867/58‑1 (MQ=255) aTACTGCTTTTTGAATTGATCTTTTAAGATATTTTCAGTTGGCGGTTCGCCATCTGcc  <  1:687749/58‑1 (MQ=255) aTACTGCTTTTTGAATTGATCTTTTAAGATATTTTCAGTTGGCGGTTCGCCATCTGcc  <  1:669444/58‑1 (MQ=255) aTACTGCTTTTTGAATTGATCTTTTAAGATATTTTCAGTTGGCGGTTCGCCATCTGcc  <  1:524417/58‑1 (MQ=255) aTACTGCTTTTTGAATTGATCTTTTAAGATATTTTCAGTTGGCGGTTCGCCATCTGcc  <  1:483222/58‑1 (MQ=255) aTACTGCTTTTTGAATTGATCTTTTAAGATATTTTCAGTTGGCGGTTCGCCATCTGcc  <  1:480908/58‑1 (MQ=255) aTACTGCTTTTTGAATTGATCTTTTAAGATATTTTCAGTTGGCGGTTCGCCATCTGcc  <  1:38221/58‑1 (MQ=255) aTACTGCTTTTTGAATTGATCTTTTAAGATATTTTCAGTTGGCGGTTCGCCATCTGcc  <  1:302120/58‑1 (MQ=255) aTACTGCTTTTTGAATTGATCTTTTAAGATATTTTCAGTTGGCGGTTCGCCATCTGcc  <  1:1019664/58‑1 (MQ=255) aTACTGCTTTTTGAATTGATCTTTTAAGATATTTTCAGTTGGCGGTTCGCCATCTGcc  <  1:196784/58‑1 (MQ=255) aTACTGCTTTTTGAATTGATCTTTTAAGATATTTTCAGTTGGCGGTTCGCCATCTGcc  <  1:183875/58‑1 (MQ=255) aTACTGCTTTTTGAATTGATCTTTTAAGATATTTTCAGTTGGCGGTTCGCCATCTGcc  <  1:163968/58‑1 (MQ=255) aTACTGCTTTTTGAATTGATCTTTTAAGATATTTTCAGTTGGCGGTTCGCCATCTGcc  <  1:1445843/58‑1 (MQ=255) aTACTGCTTTTTGAATTGATCTTTTAAGATATTTTCAGTTGGCGGTTCGCCATCTGcc  <  1:1436033/58‑1 (MQ=255) aTACTGCTTTTTGAATTGATCTTTTAAGATATTTTCAGTTGGCGGTTCGCCATCTGcc  <  1:1375663/58‑1 (MQ=255) aTACTGCTTTTTGAATTGATCTTTTAAGATATTTTCAGTTGGCGGTTCGCCATCTGcc  <  1:1353659/58‑1 (MQ=255) aTACTGCTTTTTGAATTGATCTTTTAAGATATTTTCAGTTGGCGGTTCGCCATCTGcc  <  1:12259/58‑1 (MQ=255) aTACTGCTTTTTGAATTGATCTTTTAAGATATTTTCAGTTGGCGGTTCGCCATCTGcc  <  1:1191049/58‑1 (MQ=255) aTACTGCTTTTTGAATTGATCTTTTAAGATATTTTCAGTTGGCGGTTCGCCATCTGcc  <  1:1091345/58‑1 (MQ=255) aTACTGCTTTTTGAATTGATCTTTTAAGATATTTTCAGTTGGCGGTTCGCCATCTGcc  <  1:1087041/58‑1 (MQ=255) |                                                          ATACTGCTTTTTGAATTGATCTTTTAAGATATTTTCAGTTGGCGGTTCGCCATCTGCC  >  W3110S.gb/3098105‑3098162

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑