Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3158166	3158298	133	19 [0]	[0] 29	ygiQ	conserved hypothetical protein

TACCTGCCTGTTTTGAGTAAGTATCGAACAGCTCTTTA  >  W3110S.gb/3158128‑3158165                                      | tACCTGCCTGTTTTGAGTAAGTATCGAACAGCTCTTTa  <  1:223287/38‑1 (MQ=255) tACCTGCCTGTTTTGAGTAAGTATCGAACAGCTCTTTa  <  1:899827/38‑1 (MQ=255) tACCTGCCTGTTTTGAGTAAGTATCGAACAGCTCTTTa  <  1:744241/38‑1 (MQ=255) tACCTGCCTGTTTTGAGTAAGTATCGAACAGCTCTTTa  <  1:713452/38‑1 (MQ=255) tACCTGCCTGTTTTGAGTAAGTATCGAACAGCTCTTTa  <  1:710357/38‑1 (MQ=255) tACCTGCCTGTTTTGAGTAAGTATCGAACAGCTCTTTa  <  1:692165/38‑1 (MQ=255) tACCTGCCTGTTTTGAGTAAGTATCGAACAGCTCTTTa  <  1:62756/38‑1 (MQ=255) tACCTGCCTGTTTTGAGTAAGTATCGAACAGCTCTTTa  <  1:569455/38‑1 (MQ=255) tACCTGCCTGTTTTGAGTAAGTATCGAACAGCTCTTTa  <  1:385076/38‑1 (MQ=255) tACCTGCCTGTTTTGAGTAAGTATCGAACAGCTCTTTa  <  1:376760/38‑1 (MQ=255) tACCTGCCTGTTTTGAGTAAGTATCGAACAGCTCTTTa  <  1:1017975/38‑1 (MQ=255) tACCTGCCTGTTTTGAGTAAGTATCGAACAGCTCTTTa  <  1:201533/38‑1 (MQ=255) tACCTGCCTGTTTTGAGTAAGTATCGAACAGCTCTTTa  <  1:180760/38‑1 (MQ=255) tACCTGCCTGTTTTGAGTAAGTATCGAACAGCTCTTTa  <  1:1426339/38‑1 (MQ=255) tACCTGCCTGTTTTGAGTAAGTATCGAACAGCTCTTTa  <  1:1424676/38‑1 (MQ=255) tACCTGCCTGTTTTGAGTAAGTATCGAACAGCTCTTTa  <  1:1408878/38‑1 (MQ=255) tACCTGCCTGTTTTGAGTAAGTATCGAACAGCTCTTTa  <  1:1386865/38‑1 (MQ=255) tACCTGCCTGTTTTGAGTAAGTATCGAACAGCTCTTTa  <  1:1087669/38‑1 (MQ=255) tACCTGCCTGTTTTGAGTAAGTATCGAACAGCTCTTTa  <  1:1027311/38‑1 (MQ=255)                                      | TACCTGCCTGTTTTGAGTAAGTATCGAACAGCTCTTTA  >  W3110S.gb/3158128‑3158165

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑