Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3158166	3158298	133	19 [0]	[0] 29	ygiQ	conserved hypothetical protein

CGGCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACG  >  W3110S.gb/3158299‑3158359 |                                                             cGGCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTa                   >  1:1406625/1‑44 (MQ=255) cGGCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCAcg  >  1:373111/1‑61 (MQ=255) cGGCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCAcg  >  1:986797/1‑61 (MQ=255) cGGCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCAcg  >  1:914405/1‑61 (MQ=255) cGGCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCAcg  >  1:809217/1‑61 (MQ=255) cGGCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCAcg  >  1:8066/1‑61 (MQ=255) cGGCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCAcg  >  1:80229/1‑61 (MQ=255) cGGCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCAcg  >  1:801705/1‑61 (MQ=255) cGGCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCAcg  >  1:790228/1‑61 (MQ=255) cGGCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCAcg  >  1:693943/1‑61 (MQ=255) cGGCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCAcg  >  1:612671/1‑61 (MQ=255) cGGCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCAcg  >  1:593474/1‑61 (MQ=255) cGGCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCAcg  >  1:538887/1‑61 (MQ=255) cGGCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCAcg  >  1:533957/1‑61 (MQ=255) cGGCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCAcg  >  1:494077/1‑61 (MQ=255) cGGCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCAcg  >  1:492490/1‑61 (MQ=255) cGGCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCAcg  >  1:1036139/1‑61 (MQ=255) cGGCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCAcg  >  1:303440/1‑61 (MQ=255) cGGCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCAcg  >  1:291968/1‑61 (MQ=255) cGGCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCAcg  >  1:194502/1‑61 (MQ=255) cGGCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCAcg  >  1:184181/1‑61 (MQ=255) cGGCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCAcg  >  1:131064/1‑61 (MQ=255) cGGCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCAcg  >  1:1294241/1‑61 (MQ=255) cGGCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCAcg  >  1:126558/1‑61 (MQ=255) cGGCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCAcg  >  1:1196134/1‑61 (MQ=255) cGGCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCAcg  >  1:1192162/1‑61 (MQ=255) cGGCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCAcg  >  1:1150223/1‑61 (MQ=255) cGGCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCAcg  >  1:1113943/1‑61 (MQ=255) cGGCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCAcg  >  1:1106960/1‑61 (MQ=255) |                                                             CGGCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACG  >  W3110S.gb/3158299‑3158359

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑