Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	3499107	3499305	199	39 [0]	[0] 35	yijF	conserved hypothetical protein

CTCAGCCTGCTAACGGCATTTACCAGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGT  >  W3110S.gb/3499045‑3499106                                                              | ctCAGTCTGCTAACGGCATTTACCAGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGt  >  1:1380926/1‑62 (MQ=255) ctCAGCCTGCTAACGGCATTTACCAGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGt  >  1:583372/1‑62 (MQ=255) ctCAGCCTGCTAACGGCATTTACCAGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGt  >  1:396322/1‑62 (MQ=255) ctCAGCCTGCTAACGGCATTTACCAGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGt  >  1:431765/1‑62 (MQ=255) ctCAGCCTGCTAACGGCATTTACCAGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGt  >  1:44748/1‑62 (MQ=255) ctCAGCCTGCTAACGGCATTTACCAGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGt  >  1:472827/1‑62 (MQ=255) ctCAGCCTGCTAACGGCATTTACCAGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGt  >  1:479753/1‑62 (MQ=255) ctCAGCCTGCTAACGGCATTTACCAGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGt  >  1:494612/1‑62 (MQ=255) ctCAGCCTGCTAACGGCATTTACCAGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGt  >  1:502368/1‑62 (MQ=255) ctCAGCCTGCTAACGGCATTTACCAGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGt  >  1:557803/1‑62 (MQ=255) ctCAGCCTGCTAACGGCATTTACCAGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGt  >  1:581601/1‑62 (MQ=255) ctCAGCCTGCTAACGGCATTTACCAGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGt  >  1:344991/1‑62 (MQ=255) ctCAGCCTGCTAACGGCATTTACCAGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGt  >  1:607934/1‑62 (MQ=255) ctCAGCCTGCTAACGGCATTTACCAGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGt  >  1:66987/1‑62 (MQ=255) ctCAGCCTGCTAACGGCATTTACCAGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGt  >  1:679682/1‑62 (MQ=255) ctCAGCCTGCTAACGGCATTTACCAGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGt  >  1:69067/1‑62 (MQ=255) ctCAGCCTGCTAACGGCATTTACCAGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGt  >  1:884080/1‑62 (MQ=255) ctCAGCCTGCTAACGGCATTTACCAGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGt  >  1:924015/1‑62 (MQ=255) ctCAGCCTGCTAACGGCATTTACCAGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGt  >  1:956686/1‑62 (MQ=255) ctCAGCCTGCTAACGGCATTTACCAGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGt  >  1:168840/1‑62 (MQ=255) ctCAGCCTGCTAACGGCATTTACCAGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGt  >  1:1029825/1‑62 (MQ=255) ctCAGCCTGCTAACGGCATTTACCAGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGt  >  1:1100086/1‑62 (MQ=255) ctCAGCCTGCTAACGGCATTTACCAGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGt  >  1:1161546/1‑62 (MQ=255) ctCAGCCTGCTAACGGCATTTACCAGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGt  >  1:1203990/1‑62 (MQ=255) ctCAGCCTGCTAACGGCATTTACCAGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGt  >  1:1240275/1‑62 (MQ=255) ctCAGCCTGCTAACGGCATTTACCAGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGt  >  1:138112/1‑62 (MQ=255) ctCAGCCTGCTAACGGCATTTACCAGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGt  >  1:1410186/1‑62 (MQ=255) ctCAGCCTGCTAACGGCATTTACCAGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGt  >  1:1457256/1‑62 (MQ=255) ctCAGCCTGCTAACGGCATTTACCAGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGt  >  1:1024850/1‑62 (MQ=255) ctCAGCCTGCTAACGGCATTTACCAGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGt  >  1:1704/1‑62 (MQ=255) ctCAGCCTGCTAACGGCATTTACCAGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGt  >  1:185553/1‑62 (MQ=255) ctCAGCCTGCTAACGGCATTTACCAGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGt  >  1:200256/1‑62 (MQ=255) ctCAGCCTGCTAACGGCATTTACCAGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGt  >  1:201408/1‑62 (MQ=255) ctCAGCCTGCTAACGGCATTTACCAGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGt  >  1:232367/1‑62 (MQ=255) ctCAGCCTGCTAACGGCATTTACCAGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGt  >  1:248839/1‑62 (MQ=255) ctCAGCCTGCTAACGGCATTTACCAGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGt  >  1:267626/1‑62 (MQ=255) ctCAGCCTGCTAACGGCATTTACCAGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGt  >  1:306175/1‑62 (MQ=255) ctCAGCCTGCTAACGGCATTTACCAGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGCTCCACCAACCGt  >  1:808713/1‑62 (MQ=255) ctCAGCCTGCTAACAGCATTTACCAGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGt  >  1:359793/1‑62 (MQ=255)                                                              | CTCAGCCTGCTAACGGCATTTACCAGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGT  >  W3110S.gb/3499045‑3499106

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑