Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3499107	3499305	199	39 [0]	[0] 35	yijF	conserved hypothetical protein

GAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAGCGCCCGGACA  >  W3110S.gb/3499306‑3499366 |                                                             gAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAATTGGAAGTTAAAGCGCCCGGACa  >  1:701704/1‑61 (MQ=255) gAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTa               >  1:925820/1‑48 (MQ=255) gAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAgc           >  1:221707/1‑52 (MQ=255) gAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAGCGCCCGGAc   >  1:1049002/1‑60 (MQ=255) gAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAGCGCCCGGAc   >  1:46399/1‑60 (MQ=255) gAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAGCGCCCGGAc   >  1:284134/1‑60 (MQ=255) gAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAGCGCCCGGACa  >  1:575947/1‑61 (MQ=255) gAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAGCGCCCGGACa  >  1:954876/1‑61 (MQ=255) gAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAGCGCCCGGACa  >  1:603697/1‑61 (MQ=255) gAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAGCGCCCGGACa  >  1:606790/1‑61 (MQ=255) gAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAGCGCCCGGACa  >  1:608572/1‑61 (MQ=255) gAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAGCGCCCGGACa  >  1:619714/1‑61 (MQ=255) gAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAGCGCCCGGACa  >  1:625281/1‑61 (MQ=255) gAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAGCGCCCGGACa  >  1:632405/1‑61 (MQ=255) gAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAGCGCCCGGACa  >  1:645532/1‑61 (MQ=255) gAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAGCGCCCGGACa  >  1:677106/1‑61 (MQ=255) gAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAGCGCCCGGACa  >  1:906049/1‑61 (MQ=255) gAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAGCGCCCGGACa  >  1:908753/1‑61 (MQ=255) gAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAGCGCCCGGACa  >  1:919230/1‑61 (MQ=255) gAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAGCGCCCGGACa  >  1:1025086/1‑61 (MQ=255) gAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAGCGCCCGGACa  >  1:551615/1‑61 (MQ=255) gAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAGCGCCCGGACa  >  1:530758/1‑61 (MQ=255) gAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAGCGCCCGGACa  >  1:502249/1‑61 (MQ=255) gAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAGCGCCCGGACa  >  1:473610/1‑61 (MQ=255) gAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAGCGCCCGGACa  >  1:393053/1‑61 (MQ=255) gAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAGCGCCCGGACa  >  1:305685/1‑61 (MQ=255) gAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAGCGCCCGGACa  >  1:291206/1‑61 (MQ=255) gAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAGCGCCCGGACa  >  1:258534/1‑61 (MQ=255) gAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAGCGCCCGGACa  >  1:174972/1‑61 (MQ=255) gAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAGCGCCCGGACa  >  1:1404385/1‑61 (MQ=255) gAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAGCGCCCGGACa  >  1:1381054/1‑61 (MQ=255) gAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAGCGCCCGGACa  >  1:1249470/1‑61 (MQ=255) gAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAGCGCCCGGACa  >  1:1188281/1‑61 (MQ=255) gAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAGCGCCCGGACa  >  1:1127966/1‑61 (MQ=255) gAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAGCGCCCGGACa  >  1:1118252/1‑61 (MQ=255) |                                                             GAAGATATGGCGAAGAATTTTGCTGAGTACCCGCAAAAATGGAAGTTAAAGCGCCCGGACA  >  W3110S.gb/3499306‑3499366

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑