Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	4544676	4544879	204	39 [0]	[0] 80	yjhA/fimB	N‑acetylnuraminic acid outer membrane channel protein/tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA

CCTGTTATACCAGATCAAAAATCACGCAATCCATACAACAAAACCAGATTTGCAATTCGTGT  >  W3110S.gb/4544614‑4544675                                                              | ccTGTTATACCAGATCAAAAATCACGCAATCCATACAACAAAACCAGATTTGCAATTCgtgt  <  1:623572/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATACCAGATCAAAAATCACGCAATCCATACAACAAAACCAGATTTGCAATTCgtgt  <  1:337391/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATACCAGATCAAAAATCACGCAATCCATACAACAAAACCAGATTTGCAATTCgtgt  <  1:37934/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATACCAGATCAAAAATCACGCAATCCATACAACAAAACCAGATTTGCAATTCgtgt  <  1:44343/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATACCAGATCAAAAATCACGCAATCCATACAACAAAACCAGATTTGCAATTCgtgt  <  1:445573/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATACCAGATCAAAAATCACGCAATCCATACAACAAAACCAGATTTGCAATTCgtgt  <  1:45507/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATACCAGATCAAAAATCACGCAATCCATACAACAAAACCAGATTTGCAATTCgtgt  <  1:519710/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATACCAGATCAAAAATCACGCAATCCATACAACAAAACCAGATTTGCAATTCgtgt  <  1:524392/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATACCAGATCAAAAATCACGCAATCCATACAACAAAACCAGATTTGCAATTCgtgt  <  1:559144/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATACCAGATCAAAAATCACGCAATCCATACAACAAAACCAGATTTGCAATTCgtgt  <  1:56672/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATACCAGATCAAAAATCACGCAATCCATACAACAAAACCAGATTTGCAATTCgtgt  <  1:336266/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATACCAGATCAAAAATCACGCAATCCATACAACAAAACCAGATTTGCAATTCgtgt  <  1:641895/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATACCAGATCAAAAATCACGCAATCCATACAACAAAACCAGATTTGCAATTCgtgt  <  1:66760/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATACCAGATCAAAAATCACGCAATCCATACAACAAAACCAGATTTGCAATTCgtgt  <  1:670596/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATACCAGATCAAAAATCACGCAATCCATACAACAAAACCAGATTTGCAATTCgtgt  <  1:678069/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATACCAGATCAAAAATCACGCAATCCATACAACAAAACCAGATTTGCAATTCgtgt  <  1:81307/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATACCAGATCAAAAATCACGCAATCCATACAACAAAACCAGATTTGCAATTCgtgt  <  1:868141/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATACCAGATCAAAAATCACGCAATCCATACAACAAAACCAGATTTGCAATTCgtgt  <  1:931468/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATACCAGATCAAAAATCACGCAATCCATACAACAAAACCAGATTTGCAATTCgtgt  <  1:933527/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATACCAGATCAAAAATCACGCAATCCATACAACAAAACCAGATTTGCAATTCgtgt  <  1:979188/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATACCAGATCAAAAATCACGCAATCCATACAACAAAACCAGATTTGCAATTCgtgt  <  1:1390033/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATACCAGATCAAAAATCACGCAATCCATACAACAAAACCAGATTTGCAATTCgtgt  <  1:1015524/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATACCAGATCAAAAATCACGCAATCCATACAACAAAACCAGATTTGCAATTCgtgt  <  1:1064652/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATACCAGATCAAAAATCACGCAATCCATACAACAAAACCAGATTTGCAATTCgtgt  <  1:1115339/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATACCAGATCAAAAATCACGCAATCCATACAACAAAACCAGATTTGCAATTCgtgt  <  1:1144439/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATACCAGATCAAAAATCACGCAATCCATACAACAAAACCAGATTTGCAATTCgtgt  <  1:1170789/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATACCAGATCAAAAATCACGCAATCCATACAACAAAACCAGATTTGCAATTCgtgt  <  1:1320846/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATACCAGATCAAAAATCACGCAATCCATACAACAAAACCAGATTTGCAATTCgtgt  <  1:1379537/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATACCAGATCAAAAATCACGCAATCCATACAACAAAACCAGATTTGCAATTCgtgt  <  1:1007857/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATACCAGATCAAAAATCACGCAATCCATACAACAAAACCAGATTTGCAATTCgtgt  <  1:162568/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATACCAGATCAAAAATCACGCAATCCATACAACAAAACCAGATTTGCAATTCgtgt  <  1:182979/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATACCAGATCAAAAATCACGCAATCCATACAACAAAACCAGATTTGCAATTCgtgt  <  1:199445/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATACCAGATCAAAAATCACGCAATCCATACAACAAAACCAGATTTGCAATTCgtgt  <  1:201436/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATACCAGATCAAAAATCACGCAATCCATACAACAAAACCAGATTTGCAATTCgtgt  <  1:204192/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATACCAGATCAAAAATCACGCAATCCATACAACAAAACCAGATTTGCAATTCgtgt  <  1:226569/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATACCAGATCAAAAATCACGCAATCCATACAACAAAACCAGATTTGCAATTCgtgt  <  1:247619/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATACCAGATCAAAAATCACGCAATCCATACAACAAAACCAGATTTGCAATTCgtgt  <  1:260940/62‑1 (MQ=255)  cTGTTATACCAGATCAAAAATCACGCAATCCATACAACAAAACCAGATTTGCAATTCgtgt  <  1:1333170/61‑1 (MQ=255)  cTGTTATACCAGATCAAAAATCACGCAATCCATACAACAAAACCAGATTTGCAATTCgtgt  <  1:1089811/61‑1 (MQ=255)                                                              | CCTGTTATACCAGATCAAAAATCACGCAATCCATACAACAAAACCAGATTTGCAATTCGTGT  >  W3110S.gb/4544614‑4544675

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑