Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4550399	4550520	122	35 [0]	[0] 18	fimD	outer membrane usher protein, type 1 fimbrial synthesis

CAATTATAATTTCAGCGGAAATAGTGTACAGAATCGGATTGGGGGTAACAGCCATTATGCA  >  W3110S.gb/4550338‑4550398                                                             | cAATTATAATTTCAGCGGAAATAGTGTACAGAATCGGATTGGGGGTAACAGCCATTATGCa  <  1:715052/61‑1 (MQ=255) cAATTATAATTTCAGCGGAAATAGTGTACAGAATCGGATTGGGGGTAACAGCCATTATGCa  <  1:413640/61‑1 (MQ=255) cAATTATAATTTCAGCGGAAATAGTGTACAGAATCGGATTGGGGGTAACAGCCATTATGCa  <  1:414091/61‑1 (MQ=255) cAATTATAATTTCAGCGGAAATAGTGTACAGAATCGGATTGGGGGTAACAGCCATTATGCa  <  1:447539/61‑1 (MQ=255) cAATTATAATTTCAGCGGAAATAGTGTACAGAATCGGATTGGGGGTAACAGCCATTATGCa  <  1:578528/61‑1 (MQ=255) cAATTATAATTTCAGCGGAAATAGTGTACAGAATCGGATTGGGGGTAACAGCCATTATGCa  <  1:588712/61‑1 (MQ=255) cAATTATAATTTCAGCGGAAATAGTGTACAGAATCGGATTGGGGGTAACAGCCATTATGCa  <  1:620236/61‑1 (MQ=255) cAATTATAATTTCAGCGGAAATAGTGTACAGAATCGGATTGGGGGTAACAGCCATTATGCa  <  1:660877/61‑1 (MQ=255) cAATTATAATTTCAGCGGAAATAGTGTACAGAATCGGATTGGGGGTAACAGCCATTATGCa  <  1:669288/61‑1 (MQ=255) cAATTATAATTTCAGCGGAAATAGTGTACAGAATCGGATTGGGGGTAACAGCCATTATGCa  <  1:400893/61‑1 (MQ=255) cAATTATAATTTCAGCGGAAATAGTGTACAGAATCGGATTGGGGGTAACAGCCATTATGCa  <  1:730059/61‑1 (MQ=255) cAATTATAATTTCAGCGGAAATAGTGTACAGAATCGGATTGGGGGTAACAGCCATTATGCa  <  1:743067/61‑1 (MQ=255) cAATTATAATTTCAGCGGAAATAGTGTACAGAATCGGATTGGGGGTAACAGCCATTATGCa  <  1:746181/61‑1 (MQ=255) cAATTATAATTTCAGCGGAAATAGTGTACAGAATCGGATTGGGGGTAACAGCCATTATGCa  <  1:803969/61‑1 (MQ=255) cAATTATAATTTCAGCGGAAATAGTGTACAGAATCGGATTGGGGGTAACAGCCATTATGCa  <  1:828619/61‑1 (MQ=255) cAATTATAATTTCAGCGGAAATAGTGTACAGAATCGGATTGGGGGTAACAGCCATTATGCa  <  1:87220/61‑1 (MQ=255) cAATTATAATTTCAGCGGAAATAGTGTACAGAATCGGATTGGGGGTAACAGCCATTATGCa  <  1:87296/61‑1 (MQ=255) cAATTATAATTTCAGCGGAAATAGTGTACAGAATCGGATTGGGGGTAACAGCCATTATGCa  <  1:874689/61‑1 (MQ=255) cAATTATAATTTCAGCGGAAATAGTGTACAGAATCGGATTGGGGGTAACAGCCATTATGCa  <  1:1415065/61‑1 (MQ=255) cAATTATAATTTCAGCGGAAATAGTGTACAGAATCGGATTGGGGGTAACAGCCATTATGCa  <  1:1030354/61‑1 (MQ=255) cAATTATAATTTCAGCGGAAATAGTGTACAGAATCGGATTGGGGGTAACAGCCATTATGCa  <  1:1044673/61‑1 (MQ=255) cAATTATAATTTCAGCGGAAATAGTGTACAGAATCGGATTGGGGGTAACAGCCATTATGCa  <  1:1045678/61‑1 (MQ=255) cAATTATAATTTCAGCGGAAATAGTGTACAGAATCGGATTGGGGGTAACAGCCATTATGCa  <  1:1187087/61‑1 (MQ=255) cAATTATAATTTCAGCGGAAATAGTGTACAGAATCGGATTGGGGGTAACAGCCATTATGCa  <  1:1193795/61‑1 (MQ=255) cAATTATAATTTCAGCGGAAATAGTGTACAGAATCGGATTGGGGGTAACAGCCATTATGCa  <  1:1211109/61‑1 (MQ=255) cAATTATAATTTCAGCGGAAATAGTGTACAGAATCGGATTGGGGGTAACAGCCATTATGCa  <  1:1270442/61‑1 (MQ=255) cAATTATAATTTCAGCGGAAATAGTGTACAGAATCGGATTGGGGGTAACAGCCATTATGCa  <  1:133353/61‑1 (MQ=255) cAATTATAATTTCAGCGGAAATAGTGTACAGAATCGGATTGGGGGTAACAGCCATTATGCa  <  1:1020948/61‑1 (MQ=255) cAATTATAATTTCAGCGGAAATAGTGTACAGAATCGGATTGGGGGTAACAGCCATTATGCa  <  1:24594/61‑1 (MQ=255) cAATTATAATTTCAGCGGAAATAGTGTACAGAATCGGATTGGGGGTAACAGCCATTATGCa  <  1:277348/61‑1 (MQ=255) cAATTATAATTTCAGCGGAAATAGTGTACAGAATCGGATTGGGGGTAACAGCCATTATGCa  <  1:318107/61‑1 (MQ=255) cAATTATAATTTCAGCGGAAATAGTGTACAGAATCGGATTGGGGGTAACAGCCATTATGCa  <  1:326851/61‑1 (MQ=255) cAATTATAATTTCAGCGGAAATAGTGTACAGAATCGGATTGGGGGTAACAGCCATTATGCa  <  1:335673/61‑1 (MQ=255) cAATTATAATTTCAGCGGAAATAGTGTACAGAATCGGATTGGGGGTAACAGCCATTATGCa  <  1:362445/61‑1 (MQ=255)                  gAAATAGTGTACAGAATCGGATTGGGGGTAACAGCCATTATGCa  <  1:361951/44‑1 (MQ=255)                                                             | CAATTATAATTTCAGCGGAAATAGTGTACAGAATCGGATTGGGGGTAACAGCCATTATGCA  >  W3110S.gb/4550338‑4550398

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑