Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4550399	4550520	122	35 [0]	[0] 18	fimD	outer membrane usher protein, type 1 fimbrial synthesis

CTGGCTTGAGCGAGACATAATACCGTTACGTTCCCGGCTGACGCTGGGTGATGGTTATACTC  >  W3110S.gb/4550521‑4550582 |                                                              cTGGCTTGAGCGAGACATAATACCGTTACGTTCCCGGCTGACGCtc                  >  1:1383276/1‑45 (MQ=255) cTGGCTTGAGCGAGACATAATACCGTTACGTTCCCGGCTGACGCTGGGTGATGGTTATACt   >  1:145430/1‑61 (MQ=255) cTGGCTTGAGCGAGACATAATACCGTTACGTTCCCGGCTGACGCTGGGTGATGGTTATACTc  >  1:1466277/1‑62 (MQ=255) cTGGCTTGAGCGAGACATAATACCGTTACGTTCCCGGCTGACGCTGGGTGATGGTTATACTc  >  1:864004/1‑62 (MQ=255) cTGGCTTGAGCGAGACATAATACCGTTACGTTCCCGGCTGACGCTGGGTGATGGTTATACTc  >  1:84435/1‑62 (MQ=255) cTGGCTTGAGCGAGACATAATACCGTTACGTTCCCGGCTGACGCTGGGTGATGGTTATACTc  >  1:820009/1‑62 (MQ=255) cTGGCTTGAGCGAGACATAATACCGTTACGTTCCCGGCTGACGCTGGGTGATGGTTATACTc  >  1:468555/1‑62 (MQ=255) cTGGCTTGAGCGAGACATAATACCGTTACGTTCCCGGCTGACGCTGGGTGATGGTTATACTc  >  1:377119/1‑62 (MQ=255) cTGGCTTGAGCGAGACATAATACCGTTACGTTCCCGGCTGACGCTGGGTGATGGTTATACTc  >  1:320094/1‑62 (MQ=255) cTGGCTTGAGCGAGACATAATACCGTTACGTTCCCGGCTGACGCTGGGTGATGGTTATACTc  >  1:239533/1‑62 (MQ=255) cTGGCTTGAGCGAGACATAATACCGTTACGTTCCCGGCTGACGCTGGGTGATGGTTATACTc  >  1:149069/1‑62 (MQ=255) cTGGCTTGAGCGAGACATAATACCGTTACGTTCCCGGCTGACGCTGGGTGATGGTTATACTc  >  1:1019904/1‑62 (MQ=255) cTGGCTTGAGCGAGACATAATACCGTTACGTTCCCGGCTGACGCTGGGTGATGGTTATACTc  >  1:1428236/1‑62 (MQ=255) cTGGCTTGAGCGAGACATAATACCGTTACGTTCCCGGCTGACGCTGGGTGATGGTTATACTc  >  1:1349858/1‑62 (MQ=255) cTGGCTTGAGCGAGACATAATACCGTTACGTTCCCGGCTGACGCTGGGTGATGGTTATACTc  >  1:1340886/1‑62 (MQ=255) cTGGCTTGAGCGAGACATAATACCGTTACGTTCCCGGCTGACGCTGGGTGATGGTTATACTc  >  1:1306466/1‑62 (MQ=255) cTGGCTTGAGCGAGACATAATACCGTTACGTTCCCGGCTGACGCTGGGTGATGGTTATACTc  >  1:1273780/1‑62 (MQ=255) cTGGCTTGAGCGAGACATAATACCGTTACGTTCCCGGCTGACGCTGGGTGATGGTTATACTc  >  1:1076951/1‑62 (MQ=255) |                                                              CTGGCTTGAGCGAGACATAATACCGTTACGTTCCCGGCTGACGCTGGGTGATGGTTATACTC  >  W3110S.gb/4550521‑4550582

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑