Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	117283	117537	255	27 [0]	[0] 14	ppdD	predicted major pilin subunit

TTAGCCCATTGAGACTTTCTTGCCCGGTCAGCGACACCACGCC  >  W3110S.gb/117240‑117282                                           | ttAGCCCATTGAGACTTTCTTGCCCGGTCAGCGACACCACGcc  >  1:1631/1‑43 (MQ=255) ttAGCCCATTGAGACTTTCTTGCCCGGTCAGCGACACCACGcc  >  1:995034/1‑43 (MQ=255) ttAGCCCATTGAGACTTTCTTGCCCGGTCAGCGACACCACGcc  >  1:93244/1‑43 (MQ=255) ttAGCCCATTGAGACTTTCTTGCCCGGTCAGCGACACCACGcc  >  1:921363/1‑43 (MQ=255) ttAGCCCATTGAGACTTTCTTGCCCGGTCAGCGACACCACGcc  >  1:891472/1‑43 (MQ=255) ttAGCCCATTGAGACTTTCTTGCCCGGTCAGCGACACCACGcc  >  1:799969/1‑43 (MQ=255) ttAGCCCATTGAGACTTTCTTGCCCGGTCAGCGACACCACGcc  >  1:566269/1‑43 (MQ=255) ttAGCCCATTGAGACTTTCTTGCCCGGTCAGCGACACCACGcc  >  1:53206/1‑43 (MQ=255) ttAGCCCATTGAGACTTTCTTGCCCGGTCAGCGACACCACGcc  >  1:473399/1‑43 (MQ=255) ttAGCCCATTGAGACTTTCTTGCCCGGTCAGCGACACCACGcc  >  1:438941/1‑43 (MQ=255) ttAGCCCATTGAGACTTTCTTGCCCGGTCAGCGACACCACGcc  >  1:430621/1‑43 (MQ=255) ttAGCCCATTGAGACTTTCTTGCCCGGTCAGCGACACCACGcc  >  1:268166/1‑43 (MQ=255) ttAGCCCATTGAGACTTTCTTGCCCGGTCAGCGACACCACGcc  >  1:217399/1‑43 (MQ=255) ttAGCCCATTGAGACTTTCTTGCCCGGTCAGCGACACCACGcc  >  1:179038/1‑43 (MQ=255) ttAGCCCATTGAGACTTTCTTGCCCGGTCAGCGACACCACGcc  >  1:1026854/1‑43 (MQ=255) ttAGCCCATTGAGACTTTCTTGCCCGGTCAGCGACACCACGcc  >  1:149849/1‑43 (MQ=255) ttAGCCCATTGAGACTTTCTTGCCCGGTCAGCGACACCACGcc  >  1:1441017/1‑43 (MQ=255) ttAGCCCATTGAGACTTTCTTGCCCGGTCAGCGACACCACGcc  >  1:1433040/1‑43 (MQ=255) ttAGCCCATTGAGACTTTCTTGCCCGGTCAGCGACACCACGcc  >  1:1396520/1‑43 (MQ=255) ttAGCCCATTGAGACTTTCTTGCCCGGTCAGCGACACCACGcc  >  1:1349916/1‑43 (MQ=255) ttAGCCCATTGAGACTTTCTTGCCCGGTCAGCGACACCACGcc  >  1:1343180/1‑43 (MQ=255) ttAGCCCATTGAGACTTTCTTGCCCGGTCAGCGACACCACGcc  >  1:1309090/1‑43 (MQ=255) ttAGCCCATTGAGACTTTCTTGCCCGGTCAGCGACACCACGcc  >  1:1226183/1‑43 (MQ=255) ttAGCCCATTGAGACTTTCTTGCCCGGTCAGCGACACCACGcc  >  1:1167934/1‑43 (MQ=255) ttAGCCCATTGAGACTTTCTTGCCCGGTCAGCGACACCACGcc  >  1:1092610/1‑43 (MQ=255) ttAGCCCATTGAGACTTTCTTGCCCGGTCAGCGACACCACGcc  >  1:1067366/1‑43 (MQ=255) ttAGCCCATTGAGACTTTCTTGCCCGGTCAGCGACACCACGcc  >  1:1065290/1‑43 (MQ=255)                                           | TTAGCCCATTGAGACTTTCTTGCCCGGTCAGCGACACCACGCC  >  W3110S.gb/117240‑117282

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑