Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	117283	117537	255	27 [0]	[0] 14	ppdD	predicted major pilin subunit

TTGCTTGTCCATCTGTTTCGCTCCTTGATTTGGTTGGCGCTACTTTGGCAAACGCCATCAG  >  W3110S.gb/117538‑117598 |                                                             ttGCTTGTCCATCTGTTTCGCTCCTTGATTTGGTTGGCGCTACTTTGGCAAACGCCATCAg  <  1:1021271/61‑1 (MQ=255) ttGCTTGTCCATCTGTTTCGCTCCTTGATTTGGTTGGCGCTACTTTGGCAAACGCCATCAg  <  1:1127509/61‑1 (MQ=255) ttGCTTGTCCATCTGTTTCGCTCCTTGATTTGGTTGGCGCTACTTTGGCAAACGCCATCAg  <  1:1315745/61‑1 (MQ=255) ttGCTTGTCCATCTGTTTCGCTCCTTGATTTGGTTGGCGCTACTTTGGCAAACGCCATCAg  <  1:1420991/61‑1 (MQ=255) ttGCTTGTCCATCTGTTTCGCTCCTTGATTTGGTTGGCGCTACTTTGGCAAACGCCATCAg  <  1:315877/61‑1 (MQ=255) ttGCTTGTCCATCTGTTTCGCTCCTTGATTTGGTTGGCGCTACTTTGGCAAACGCCATCAg  <  1:362934/61‑1 (MQ=255) ttGCTTGTCCATCTGTTTCGCTCCTTGATTTGGTTGGCGCTACTTTGGCAAACGCCATCAg  <  1:364618/61‑1 (MQ=255) ttGCTTGTCCATCTGTTTCGCTCCTTGATTTGGTTGGCGCTACTTTGGCAAACGCCATCAg  <  1:55513/61‑1 (MQ=255) ttGCTTGTCCATCTGTTTCGCTCCTTGATTTGGTTGGCGCTACTTTGGCAAACGCCATCAg  <  1:673776/61‑1 (MQ=255) ttGCTTGTCCATCTGTTTCGCTCCTTGATTTGGTTGGCGCTACTTTGGCAAACGCCATCAg  <  1:732529/61‑1 (MQ=255) ttGCTTGTCCATCTGTTTCGCTCCTTGATTTGGTTGGCGCTACTTTGGCAAACGCCATCAg  <  1:790835/61‑1 (MQ=255) ttGCTTGTCCATCTGTTTCGCTCCTTGATTTGGTTGGCGCTACTTTGGCAAACGCCATCAg  <  1:875303/61‑1 (MQ=255) ttGCTTGTCCATCTGTTTCGCTCCTTGATTTGGTTGGCGCTACTTTGGCAAACGCCATCAg  <  1:980497/61‑1 (MQ=255) ttGCTTGTCCATCTGTTTCGCTCCTTGATATGGTTGGCGCTACTTTGGCAAACGCCATCAg  <  1:821203/61‑1 (MQ=255) |                                                             TTGCTTGTCCATCTGTTTCGCTCCTTGATTTGGTTGGCGCTACTTTGGCAAACGCCATCAG  >  W3110S.gb/117538‑117598

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑