Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1039363	1039508	146	15 [0]	[0] 44	appC	cytochrome bd‑II oxidase, subunit I

ACCTCAGGTTGCGCCGGTATTCTGGAGTTTCCGCATCATGGTGGGCTGTGGTTCCCTGCTGC  >  W3110S.gb/1039301‑1039362                                                              | aCCTCAGGTTGCGCCGGTATTCTGGAGTTTCCGCATCATGGTGGGCTGTGGTTCCCtgctgc  <  1:1110969/62‑1 (MQ=255) aCCTCAGGTTGCGCCGGTATTCTGGAGTTTCCGCATCATGGTGGGCTGTGGTTCCCtgctgc  <  1:1125616/62‑1 (MQ=255) aCCTCAGGTTGCGCCGGTATTCTGGAGTTTCCGCATCATGGTGGGCTGTGGTTCCCtgctgc  <  1:1197024/62‑1 (MQ=255) aCCTCAGGTTGCGCCGGTATTCTGGAGTTTCCGCATCATGGTGGGCTGTGGTTCCCtgctgc  <  1:1307622/62‑1 (MQ=255) aCCTCAGGTTGCGCCGGTATTCTGGAGTTTCCGCATCATGGTGGGCTGTGGTTCCCtgctgc  <  1:1339715/62‑1 (MQ=255) aCCTCAGGTTGCGCCGGTATTCTGGAGTTTCCGCATCATGGTGGGCTGTGGTTCCCtgctgc  <  1:181636/62‑1 (MQ=255) aCCTCAGGTTGCGCCGGTATTCTGGAGTTTCCGCATCATGGTGGGCTGTGGTTCCCtgctgc  <  1:230657/62‑1 (MQ=255) aCCTCAGGTTGCGCCGGTATTCTGGAGTTTCCGCATCATGGTGGGCTGTGGTTCCCtgctgc  <  1:400372/62‑1 (MQ=255) aCCTCAGGTTGCGCCGGTATTCTGGAGTTTCCGCATCATGGTGGGCTGTGGTTCCCtgctgc  <  1:528601/62‑1 (MQ=255) aCCTCAGGTTGCGCCGGTATTCTGGAGTTTCCGCATCATGGTGGGCTGTGGTTCCCtgctgc  <  1:637869/62‑1 (MQ=255) aCCTCAGGTTGCGCCGGTATTCTGGAGTTTCCGCATCATGGTGGGCTGTGGTTCCCtgctgc  <  1:762557/62‑1 (MQ=255) aCCTCAGGTTGCGCCGGTATTCTGGAGTTTCCGCATCATGGTGGGCTGTGGTTCCCtgctgc  <  1:772671/62‑1 (MQ=255) aCCTCAGGTTGCGCCGGTATTCTGGAGTTTCCGCATCATGGTGGGCTGTGGTTCCCtgctgc  <  1:89983/62‑1 (MQ=255) aCCTCAGGTTGCGCCGGTATTCTGGAGTTTCCGCATCATGGTGGGCTGTGGTTCCCtgctgc  <  1:906120/62‑1 (MQ=255)            cgcCGGTATTCTGGAGTTTCCGCATCATGGTGGGCTGTGGTTCCCtgctgc  <  1:664583/51‑1 (MQ=255)                                                              | ACCTCAGGTTGCGCCGGTATTCTGGAGTTTCCGCATCATGGTGGGCTGTGGTTCCCTGCTGC  >  W3110S.gb/1039301‑1039362

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑