Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	1039363	1039508	146	15 [0]	[0] 44	appC	cytochrome bd‑II oxidase, subunit I

CCGTGGGCGATACAGGACATCTTACCGACATACTCCGCGCACTCCGCTTTAACCACAGGAC  >  W3110S.gb/1039509‑1039569 |                                                             ccGTGGGCGATACAGGACATCTTACGGACATACTCCGCGCACTCCGCTTTAACCACAGGAc  <  1:628655/61‑1 (MQ=255) ccGTGGGCGATACAGGACATCTTACCGACATACTCCGCGCACTCTGCTTTAACCACAGGAc  <  1:1117615/61‑1 (MQ=255) ccGTGGGCGATACAGGACATCTTACCGACATACTCCGCGCACTCCGCTTTAACCACAGGAc  <  1:748377/61‑1 (MQ=255) ccGTGGGCGATACAGGACATCTTACCGACATACTCCGCGCACTCCGCTTTAACCACAGGAc  <  1:418488/61‑1 (MQ=255) ccGTGGGCGATACAGGACATCTTACCGACATACTCCGCGCACTCCGCTTTAACCACAGGAc  <  1:475307/61‑1 (MQ=255) ccGTGGGCGATACAGGACATCTTACCGACATACTCCGCGCACTCCGCTTTAACCACAGGAc  <  1:548955/61‑1 (MQ=255) ccGTGGGCGATACAGGACATCTTACCGACATACTCCGCGCACTCCGCTTTAACCACAGGAc  <  1:554347/61‑1 (MQ=255) ccGTGGGCGATACAGGACATCTTACCGACATACTCCGCGCACTCCGCTTTAACCACAGGAc  <  1:560837/61‑1 (MQ=255) ccGTGGGCGATACAGGACATCTTACCGACATACTCCGCGCACTCCGCTTTAACCACAGGAc  <  1:569684/61‑1 (MQ=255) ccGTGGGCGATACAGGACATCTTACCGACATACTCCGCGCACTCCGCTTTAACCACAGGAc  <  1:646571/61‑1 (MQ=255) ccGTGGGCGATACAGGACATCTTACCGACATACTCCGCGCACTCCGCTTTAACCACAGGAc  <  1:717628/61‑1 (MQ=255) ccGTGGGCGATACAGGACATCTTACCGACATACTCCGCGCACTCCGCTTTAACCACAGGAc  <  1:739031/61‑1 (MQ=255) ccGTGGGCGATACAGGACATCTTACCGACATACTCCGCGCACTCCGCTTTAACCACAGGAc  <  1:377530/61‑1 (MQ=255) ccGTGGGCGATACAGGACATCTTACCGACATACTCCGCGCACTCCGCTTTAACCACAGGAc  <  1:749780/61‑1 (MQ=255) ccGTGGGCGATACAGGACATCTTACCGACATACTCCGCGCACTCCGCTTTAACCACAGGAc  <  1:751390/61‑1 (MQ=255) ccGTGGGCGATACAGGACATCTTACCGACATACTCCGCGCACTCCGCTTTAACCACAGGAc  <  1:761890/61‑1 (MQ=255) ccGTGGGCGATACAGGACATCTTACCGACATACTCCGCGCACTCCGCTTTAACCACAGGAc  <  1:830041/61‑1 (MQ=255) ccGTGGGCGATACAGGACATCTTACCGACATACTCCGCGCACTCCGCTTTAACCACAGGAc  <  1:833893/61‑1 (MQ=255) ccGTGGGCGATACAGGACATCTTACCGACATACTCCGCGCACTCCGCTTTAACCACAGGAc  <  1:871120/61‑1 (MQ=255) ccGTGGGCGATACAGGACATCTTACCGACATACTCCGCGCACTCCGCTTTAACCACAGGAc  <  1:935294/61‑1 (MQ=255) ccGTGGGCGATACAGGACATCTTACCGACATACTCCGCGCACTCCGCTTTAACCACAGGAc  <  1:945734/61‑1 (MQ=255) ccGTGGGCGATACAGGACATCTTACCGACATACTCCGCGCACTCCGCTTTAACCACAGGAc  <  1:990622/61‑1 (MQ=255) ccGTGGGCGATACAGGACATCTTACCGACATACTCCGCGCACTCCGCTTTAACCACAGGAc  <  1:1398425/61‑1 (MQ=255) ccGTGGGCGATACAGGACATCTTACCGACATACTCCGCGCACTCCGCTTTAACCACAGGAc  <  1:1019867/61‑1 (MQ=255) ccGTGGGCGATACAGGACATCTTACCGACATACTCCGCGCACTCCGCTTTAACCACAGGAc  <  1:1023546/61‑1 (MQ=255) ccGTGGGCGATACAGGACATCTTACCGACATACTCCGCGCACTCCGCTTTAACCACAGGAc  <  1:1103375/61‑1 (MQ=255) ccGTGGGCGATACAGGACATCTTACCGACATACTCCGCGCACTCCGCTTTAACCACAGGAc  <  1:1245854/61‑1 (MQ=255) ccGTGGGCGATACAGGACATCTTACCGACATACTCCGCGCACTCCGCTTTAACCACAGGAc  <  1:1255233/61‑1 (MQ=255) ccGTGGGCGATACAGGACATCTTACCGACATACTCCGCGCACTCCGCTTTAACCACAGGAc  <  1:131088/61‑1 (MQ=255) ccGTGGGCGATACAGGACATCTTACCGACATACTCCGCGCACTCCGCTTTAACCACAGGAc  <  1:1320868/61‑1 (MQ=255) ccGTGGGCGATACAGGACATCTTACCGACATACTCCGCGCACTCCGCTTTAACCACAGGAc  <  1:1339327/61‑1 (MQ=255) ccGTGGGCGATACAGGACATCTTACCGACATACTCCGCGCACTCCGCTTTAACCACAGGAc  <  1:1367106/61‑1 (MQ=255) ccGTGGGCGATACAGGACATCTTACCGACATACTCCGCGCACTCCGCTTTAACCACAGGAc  <  1:100577/61‑1 (MQ=255) ccGTGGGCGATACAGGACATCTTACCGACATACTCCGCGCACTCCGCTTTAACCACAGGAc  <  1:1418321/61‑1 (MQ=255) ccGTGGGCGATACAGGACATCTTACCGACATACTCCGCGCACTCCGCTTTAACCACAGGAc  <  1:1447327/61‑1 (MQ=255) ccGTGGGCGATACAGGACATCTTACCGACATACTCCGCGCACTCCGCTTTAACCACAGGAc  <  1:176116/61‑1 (MQ=255) ccGTGGGCGATACAGGACATCTTACCGACATACTCCGCGCACTCCGCTTTAACCACAGGAc  <  1:185369/61‑1 (MQ=255) ccGTGGGCGATACAGGACATCTTACCGACATACTCCGCGCACTCCGCTTTAACCACAGGAc  <  1:246905/61‑1 (MQ=255) ccGTGGGCGATACAGGACATCTTACCGACATACTCCGCGCACTCCGCTTTAACCACAGGAc  <  1:264991/61‑1 (MQ=255) ccGTGGGCGATACAGGACATCTTACCGACATACTCCGCGCACTCCGCTTTAACCACAGGAc  <  1:273111/61‑1 (MQ=255) ccGTGGGCGATACAGGACATCTTACCGACATACTCCGCGCACTCCGCTTTAACCACAGGAc  <  1:331774/61‑1 (MQ=255) ccGTGGGCGATACAGGACATCTTACCGACATACTCCGCGCACTCCGCTTTAACCACAGGAc  <  1:365872/61‑1 (MQ=255) ccGTGGGCGATACAGGACATCTTACCGACATACTCCGAGCACTCCGCTTTAACCACAGGAc  <  1:1307033/61‑1 (MQ=255) ccGTGGGCGATACAGGACATCTTACAGACATACTCCGCGCACTCCGCTTTAACCACAGGAc  <  1:553724/61‑1 (MQ=255) |                                                             CCGTGGGCGATACAGGACATCTTACCGACATACTCCGCGCACTCCGCTTTAACCACAGGAC  >  W3110S.gb/1039509‑1039569

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑