Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	1562829	1563197	369	51 [0]	[0] 44	ddpA	D‑Ala‑D‑Ala transporter subunit

CATCAATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTC  >  W3110S.gb/1562767‑1562828                                                              | catcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:68514/62‑1 (MQ=255) catcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:370441/62‑1 (MQ=255) catcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:425201/62‑1 (MQ=255) catcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:5071/62‑1 (MQ=255) catcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:508021/62‑1 (MQ=255) catcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:530805/62‑1 (MQ=255) catcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:536053/62‑1 (MQ=255) catcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:585141/62‑1 (MQ=255) catcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:634173/62‑1 (MQ=255) catcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:64791/62‑1 (MQ=255) catcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:669228/62‑1 (MQ=255) catcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:680539/62‑1 (MQ=255) catcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:359208/62‑1 (MQ=255) catcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:714979/62‑1 (MQ=255) catcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:726417/62‑1 (MQ=255) catcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:754570/62‑1 (MQ=255) catcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:760810/62‑1 (MQ=255) catcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:764027/62‑1 (MQ=255) catcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:775989/62‑1 (MQ=255) catcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:82146/62‑1 (MQ=255) catcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:87445/62‑1 (MQ=255) catcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:896021/62‑1 (MQ=255) catcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:963556/62‑1 (MQ=255) catcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:99196/62‑1 (MQ=255) catcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:1400047/62‑1 (MQ=255) catcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:1038888/62‑1 (MQ=255) catcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:1050759/62‑1 (MQ=255) catcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:1064137/62‑1 (MQ=255) catcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:1079976/62‑1 (MQ=255) catcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:1128826/62‑1 (MQ=255) catcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:1326634/62‑1 (MQ=255) catcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:1360210/62‑1 (MQ=255) catcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:139477/62‑1 (MQ=255) catcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:1403246/62‑1 (MQ=255) catcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:1434474/62‑1 (MQ=255) catcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:1446499/62‑1 (MQ=255) catcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:1450682/62‑1 (MQ=255) catcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:1455670/62‑1 (MQ=255) catcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:1461974/62‑1 (MQ=255) catcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:151565/62‑1 (MQ=255) catcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:233270/62‑1 (MQ=255) catcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:243018/62‑1 (MQ=255) catcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:332204/62‑1 (MQ=255) catcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTAGGTGGTc  <  1:219860/62‑1 (MQ=255)  atcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:335876/61‑1 (MQ=255)  atcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:695832/61‑1 (MQ=255)  atcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:710155/61‑1 (MQ=255)  atcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:1398364/61‑1 (MQ=255)  atcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:1331377/61‑1 (MQ=255)  atcaATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:1024416/61‑1 (MQ=255)     aaTGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTc  <  1:1304914/58‑1 (MQ=255)                                                              | CATCAATGACGATTTTCTGTGCCTGCTGGTAGTCCCGGGTACGCTGCGTCTGGTCGGTGGTC  >  W3110S.gb/1562767‑1562828

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑