Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	1562829	1563197	369	51 [0]	[0] 44	ddpA	D‑Ala‑D‑Ala transporter subunit

GTCGCATCGTAGCCCCACATGCCTTCCGGAATCGGGCCGCGCATCTGTTTTCCGTTACCAC  >  W3110S.gb/1563198‑1563258 |                                                             gTCGCATCGTAGCCGCACATGCCTTCCGGAATCGGGCCGCGCATCTGTTTTCCGTTACCAc  <  1:73655/61‑1 (MQ=255) gTCGCATCGTAGCCCCACATGCCTTCCGGTATCGGGCCGCGCATCTGTTTTCCGTTACCAc  <  1:615165/61‑1 (MQ=255) gTCGCATCGTAGCCCCACATGCCTTCCGGAATCGGGCCGCGCATCTGTTTTCCGTTACCAc  <  1:392426/61‑1 (MQ=255) gTCGCATCGTAGCCCCACATGCCTTCCGGAATCGGGCCGCGCATCTGTTTTCCGTTACCAc  <  1:380963/61‑1 (MQ=255) gTCGCATCGTAGCCCCACATGCCTTCCGGAATCGGGCCGCGCATCTGTTTTCCGTTACCAc  <  1:410481/61‑1 (MQ=255) gTCGCATCGTAGCCCCACATGCCTTCCGGAATCGGGCCGCGCATCTGTTTTCCGTTACCAc  <  1:4247/61‑1 (MQ=255) gTCGCATCGTAGCCCCACATGCCTTCCGGAATCGGGCCGCGCATCTGTTTTCCGTTACCAc  <  1:466864/61‑1 (MQ=255) gTCGCATCGTAGCCCCACATGCCTTCCGGAATCGGGCCGCGCATCTGTTTTCCGTTACCAc  <  1:536392/61‑1 (MQ=255) gTCGCATCGTAGCCCCACATGCCTTCCGGAATCGGGCCGCGCATCTGTTTTCCGTTACCAc  <  1:546896/61‑1 (MQ=255) gTCGCATCGTAGCCCCACATGCCTTCCGGAATCGGGCCGCGCATCTGTTTTCCGTTACCAc  <  1:551760/61‑1 (MQ=255) gTCGCATCGTAGCCCCACATGCCTTCCGGAATCGGGCCGCGCATCTGTTTTCCGTTACCAc  <  1:554102/61‑1 (MQ=255) gTCGCATCGTAGCCCCACATGCCTTCCGGAATCGGGCCGCGCATCTGTTTTCCGTTACCAc  <  1:562696/61‑1 (MQ=255) gTCGCATCGTAGCCCCACATGCCTTCCGGAATCGGGCCGCGCATCTGTTTTCCGTTACCAc  <  1:600400/61‑1 (MQ=255) gTCGCATCGTAGCCCCACATGCCTTCCGGAATCGGGCCGCGCATCTGTTTTCCGTTACCAc  <  1:64365/61‑1 (MQ=255) gTCGCATCGTAGCCCCACATGCCTTCCGGAATCGGGCCGCGCATCTGTTTTCCGTTACCAc  <  1:66566/61‑1 (MQ=255) gTCGCATCGTAGCCCCACATGCCTTCCGGAATCGGGCCGCGCATCTGTTTTCCGTTACCAc  <  1:681464/61‑1 (MQ=255) gTCGCATCGTAGCCCCACATGCCTTCCGGAATCGGGCCGCGCATCTGTTTTCCGTTACCAc  <  1:730155/61‑1 (MQ=255) gTCGCATCGTAGCCCCACATGCCTTCCGGAATCGGGCCGCGCATCTGTTTTCCGTTACCAc  <  1:74363/61‑1 (MQ=255) gTCGCATCGTAGCCCCACATGCCTTCCGGAATCGGGCCGCGCATCTGTTTTCCGTTACCAc  <  1:756166/61‑1 (MQ=255) gTCGCATCGTAGCCCCACATGCCTTCCGGAATCGGGCCGCGCATCTGTTTTCCGTTACCAc  <  1:767535/61‑1 (MQ=255) gTCGCATCGTAGCCCCACATGCCTTCCGGAATCGGGCCGCGCATCTGTTTTCCGTTACCAc  <  1:946941/61‑1 (MQ=255) gTCGCATCGTAGCCCCACATGCCTTCCGGAATCGGGCCGCGCATCTGTTTTCCGTTACCAc  <  1:974906/61‑1 (MQ=255) gTCGCATCGTAGCCCCACATGCCTTCCGGAATCGGGCCGCGCATCTGTTTTCCGTTACCAc  <  1:1407408/61‑1 (MQ=255) gTCGCATCGTAGCCCCACATGCCTTCCGGAATCGGGCCGCGCATCTGTTTTCCGTTACCAc  <  1:1118717/61‑1 (MQ=255) gTCGCATCGTAGCCCCACATGCCTTCCGGAATCGGGCCGCGCATCTGTTTTCCGTTACCAc  <  1:1145771/61‑1 (MQ=255) gTCGCATCGTAGCCCCACATGCCTTCCGGAATCGGGCCGCGCATCTGTTTTCCGTTACCAc  <  1:1160087/61‑1 (MQ=255) gTCGCATCGTAGCCCCACATGCCTTCCGGAATCGGGCCGCGCATCTGTTTTCCGTTACCAc  <  1:1175215/61‑1 (MQ=255) gTCGCATCGTAGCCCCACATGCCTTCCGGAATCGGGCCGCGCATCTGTTTTCCGTTACCAc  <  1:1217645/61‑1 (MQ=255) gTCGCATCGTAGCCCCACATGCCTTCCGGAATCGGGCCGCGCATCTGTTTTCCGTTACCAc  <  1:1226032/61‑1 (MQ=255) gTCGCATCGTAGCCCCACATGCCTTCCGGAATCGGGCCGCGCATCTGTTTTCCGTTACCAc  <  1:1237538/61‑1 (MQ=255) gTCGCATCGTAGCCCCACATGCCTTCCGGAATCGGGCCGCGCATCTGTTTTCCGTTACCAc  <  1:1250410/61‑1 (MQ=255) gTCGCATCGTAGCCCCACATGCCTTCCGGAATCGGGCCGCGCATCTGTTTTCCGTTACCAc  <  1:1310502/61‑1 (MQ=255) gTCGCATCGTAGCCCCACATGCCTTCCGGAATCGGGCCGCGCATCTGTTTTCCGTTACCAc  <  1:1324257/61‑1 (MQ=255) gTCGCATCGTAGCCCCACATGCCTTCCGGAATCGGGCCGCGCATCTGTTTTCCGTTACCAc  <  1:1063684/61‑1 (MQ=255) gTCGCATCGTAGCCCCACATGCCTTCCGGAATCGGGCCGCGCATCTGTTTTCCGTTACCAc  <  1:1441492/61‑1 (MQ=255) gTCGCATCGTAGCCCCACATGCCTTCCGGAATCGGGCCGCGCATCTGTTTTCCGTTACCAc  <  1:1445354/61‑1 (MQ=255) gTCGCATCGTAGCCCCACATGCCTTCCGGAATCGGGCCGCGCATCTGTTTTCCGTTACCAc  <  1:16737/61‑1 (MQ=255) gTCGCATCGTAGCCCCACATGCCTTCCGGAATCGGGCCGCGCATCTGTTTTCCGTTACCAc  <  1:171811/61‑1 (MQ=255) gTCGCATCGTAGCCCCACATGCCTTCCGGAATCGGGCCGCGCATCTGTTTTCCGTTACCAc  <  1:251976/61‑1 (MQ=255) gTCGCATCGTAGCCCCACATGCCTTCCGGAATCGGGCCGCGCATCTGTTTTCCGTTACCAc  <  1:261135/61‑1 (MQ=255) gTCGCATCGTAGCCCCACATGCCTTCCGGAATCGGGCCGCGCATCTGTTTTCCGTTACCAc  <  1:263486/61‑1 (MQ=255) gTCGCATCGTAGCCCCACATGCCTTCCGGAATCGGGCCGCGCATCTGTTTTCCGTTACCAc  <  1:293034/61‑1 (MQ=255) gTCGCATCGTAGCCCCACATGCCTTCCGGAATCGGGCCGCGCATCTGTTTTCCGTTACCAc  <  1:359356/61‑1 (MQ=255) gTCGCATCGTAGCCCCACATGCCTTACGGAATCGGGCCGCGCATCTGTTTTCCGTTACCAc  <  1:32898/61‑1 (MQ=255) |                                                             GTCGCATCGTAGCCCCACATGCCTTCCGGAATCGGGCCGCGCATCTGTTTTCCGTTACCAC  >  W3110S.gb/1563198‑1563258

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑