Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2074038	2074690	653	34 [0]	[1] 63	flu	antigen 43 (Ag43) phase‑variable biofilm formation autotransporter

GGGCAATGGGTACAGGATGGCGGAACAGCCAACAAAACGACTGTCACCAGTGGTGGTCTTCA  >  W3110S.gb/2073976‑2074037                                                              | gtgCAATGGGTACAGGATGGCGGAACAGCCAACAAAACGACTGTCACCAGTGGTGGTCTTCa  <  1:669305/60‑1 (MQ=255) gggCAATGGGTACAGTATGGCGGAACAGCCAACAAAACGACTGTCACCAGTGGTGGTCTTCa  <  1:552460/62‑1 (MQ=255) gggCAATGGGTACAGGATGGCGGAACAGCCAACAAAACGACTGTCACCAGTGGTGGTCTTCa  <  1:236896/62‑1 (MQ=255) gggCAATGGGTACAGGATGGCGGAACAGCCAACAAAACGACTGTCACCAGTGGTGGTCTTCa  <  1:695141/62‑1 (MQ=255) gggCAATGGGTACAGGATGGCGGAACAGCCAACAAAACGACTGTCACCAGTGGTGGTCTTCa  <  1:622759/62‑1 (MQ=255) gggCAATGGGTACAGGATGGCGGAACAGCCAACAAAACGACTGTCACCAGTGGTGGTCTTCa  <  1:621783/62‑1 (MQ=255) gggCAATGGGTACAGGATGGCGGAACAGCCAACAAAACGACTGTCACCAGTGGTGGTCTTCa  <  1:544987/62‑1 (MQ=255) gggCAATGGGTACAGGATGGCGGAACAGCCAACAAAACGACTGTCACCAGTGGTGGTCTTCa  <  1:529071/62‑1 (MQ=255) gggCAATGGGTACAGGATGGCGGAACAGCCAACAAAACGACTGTCACCAGTGGTGGTCTTCa  <  1:528549/62‑1 (MQ=255) gggCAATGGGTACAGGATGGCGGAACAGCCAACAAAACGACTGTCACCAGTGGTGGTCTTCa  <  1:365758/62‑1 (MQ=255) gggCAATGGGTACAGGATGGCGGAACAGCCAACAAAACGACTGTCACCAGTGGTGGTCTTCa  <  1:359525/62‑1 (MQ=255) gggCAATGGGTACAGGATGGCGGAACAGCCAACAAAACGACTGTCACCAGTGGTGGTCTTCa  <  1:711010/62‑1 (MQ=255) gggCAATGGGTACAGGATGGCGGAACAGCCAACAAAACGACTGTCACCAGTGGTGGTCTTCa  <  1:946891/62‑1 (MQ=255) gggCAATGGGTACAGGATGGCGGAACAGCCAACAAAACGACTGTCACCAGTGGTGGTCTTCa  <  1:957311/62‑1 (MQ=255) gggCAATGGGTACAGGATGGCGGAACAGCCAACAAAACGACTGTCACCAGTGGTGGTCTTCa  <  1:20485/62‑1 (MQ=255) gggCAATGGGTACAGGATGGCGGAACAGCCAACAAAACGACTGTCACCAGTGGTGGTCTTCa  <  1:978905/62‑1 (MQ=255) gggCAATGGGTACAGGATGGCGGAACAGCCAACAAAACGACTGTCACCAGTGGTGGTCTTCa  <  1:151786/62‑1 (MQ=255) gggCAATGGGTACAGGATGGCGGAACAGCCAACAAAACGACTGTCACCAGTGGTGGTCTTCa  <  1:1466150/62‑1 (MQ=255) gggCAATGGGTACAGGATGGCGGAACAGCCAACAAAACGACTGTCACCAGTGGTGGTCTTCa  <  1:1368446/62‑1 (MQ=255) gggCAATGGGTACAGGATGGCGGAACAGCCAACAAAACGACTGTCACCAGTGGTGGTCTTCa  <  1:1361439/62‑1 (MQ=255) gggCAATGGGTACAGGATGGCGGAACAGCCAACAAAACGACTGTCACCAGTGGTGGTCTTCa  <  1:995887/62‑1 (MQ=255) gggCAATGGGTACAGGATGGCGGAACAGCCAACAAAACGACTGTCACCAGTGGTGGTCTTCa  <  1:1359712/62‑1 (MQ=255) gggCAATGGGTACAGGATGGCGGAACAGCCAACAAAACGACTGTCACCAGTGGTGGTCTTCa  <  1:1309298/62‑1 (MQ=255) gggCAATGGGTACAGGATGGCGGAACAGCCAACAAAACGACTGTCACCAGTGGTGGTCTTCa  <  1:1221672/62‑1 (MQ=255) gggCAATGGGTACAGGATGGCGGAACAGCCAACAAAACGACTGTCACCAGTGGTGGTCTTCa  <  1:1157693/62‑1 (MQ=255) gggCAATGGGTACAGGATGGCGGAACAGCCAACAAAACGACTGTCACCAGTGGTGGTCTTCa  <  1:1069625/62‑1 (MQ=255) gggCAATGGGTACAGGATGGCGGAACAGCCAACAAAACGACTGTCACCAGTGCTGGTCTTCa  <  1:154086/62‑1 (MQ=255)  ggaaaTGGGTACAGGATGGCGGAACAGCCAACAAAACGACTGTCACCAGTGGTGGTCTTCa  <  1:1071949/58‑1 (MQ=255)  ggCAATGGGTACAGGATGGCGGAACAGCCAACAAAACGACTGTCACCAGTGGTGGTCTTCa  <  1:662877/61‑1 (MQ=255)  ggCAATGGGTACAGGATGGCGGAACAGCCAACAAAACGACTGTCACCAGTGGTGGTCTTCa  <  1:301224/61‑1 (MQ=255)  ggCAATGGGTACAGGATGGCGGAACAGCCAACAAAACGACTGTCACCAGTGGTGGTCTTCa  <  1:292857/61‑1 (MQ=255)  ggCAATGGGTACAGGATGGCGGAACAGCCAACAAAACGACTGTCACCAGTGGTGGTCTTCa  <  1:274973/61‑1 (MQ=255)  ggCAATGGGTACAGGATGGCGGAACAGCCAACAAAACGACTGTCACCAGTGGTGGTCTTCa  <  1:185170/61‑1 (MQ=255)                          cAGCCAACAAAACGACTGTCACCAGTGGTGGTCTTCa  <  1:1360779/37‑1 (MQ=255)                                                              | GGGCAATGGGTACAGGATGGCGGAACAGCCAACAAAACGACTGTCACCAGTGGTGGTCTTCA  >  W3110S.gb/2073976‑2074037

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑