Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3212179	3212248	70	61 [0]	[0] 27	rpoD	RNA polymerase, sigma 70 (sigma D) factor

TCTGAGCTTTCCCAGGAAGATCTGGACGATGACGAAGATGAAGA  >  W3110S.gb/3212249‑3212292 |                                            tCTGAGCTTTCCCAGGAAGATCTGGACTATGACGAAGATGAAGa  <  1:1450802/44‑1 (MQ=255) tCTGAGCTTTCCCAGGAAGATCTGGACGATGACGAAGATGAAGa  <  1:165496/44‑1 (MQ=255) tCTGAGCTTTCCCAGGAAGATCTGGACGATGACGAAGATGAAGa  <  1:989200/44‑1 (MQ=255) tCTGAGCTTTCCCAGGAAGATCTGGACGATGACGAAGATGAAGa  <  1:892500/44‑1 (MQ=255) tCTGAGCTTTCCCAGGAAGATCTGGACGATGACGAAGATGAAGa  <  1:840711/44‑1 (MQ=255) tCTGAGCTTTCCCAGGAAGATCTGGACGATGACGAAGATGAAGa  <  1:811736/44‑1 (MQ=255) tCTGAGCTTTCCCAGGAAGATCTGGACGATGACGAAGATGAAGa  <  1:663751/44‑1 (MQ=255) tCTGAGCTTTCCCAGGAAGATCTGGACGATGACGAAGATGAAGa  <  1:66127/44‑1 (MQ=255) tCTGAGCTTTCCCAGGAAGATCTGGACGATGACGAAGATGAAGa  <  1:655223/44‑1 (MQ=255) tCTGAGCTTTCCCAGGAAGATCTGGACGATGACGAAGATGAAGa  <  1:582825/44‑1 (MQ=255) tCTGAGCTTTCCCAGGAAGATCTGGACGATGACGAAGATGAAGa  <  1:542090/44‑1 (MQ=255) tCTGAGCTTTCCCAGGAAGATCTGGACGATGACGAAGATGAAGa  <  1:450526/44‑1 (MQ=255) tCTGAGCTTTCCCAGGAAGATCTGGACGATGACGAAGATGAAGa  <  1:406106/44‑1 (MQ=255) tCTGAGCTTTCCCAGGAAGATCTGGACGATGACGAAGATGAAGa  <  1:303026/44‑1 (MQ=255) tCTGAGCTTTCCCAGGAAGATCTGGACGATGACGAAGATGAAGa  <  1:287817/44‑1 (MQ=255) tCTGAGCTTTCCCAGGAAGATCTGGACGATGACGAAGATGAAGa  <  1:110163/44‑1 (MQ=255) tCTGAGCTTTCCCAGGAAGATCTGGACGATGACGAAGATGAAGa  <  1:1453196/44‑1 (MQ=255) tCTGAGCTTTCCCAGGAAGATCTGGACGATGACGAAGATGAAGa  <  1:1427489/44‑1 (MQ=255) tCTGAGCTTTCCCAGGAAGATCTGGACGATGACGAAGATGAAGa  <  1:134199/44‑1 (MQ=255) tCTGAGCTTTCCCAGGAAGATCTGGACGATGACGAAGATGAAGa  <  1:1197212/44‑1 (MQ=255) tCTGAGCTTTCCCAGGAAGATCTGGACGATGACGAAGATGAAGa  <  1:1171193/44‑1 (MQ=255) tCTGAGCTTTCCCAGGAAGATCTGGACGATGACGAAGATGAAGa  <  1:1162586/44‑1 (MQ=255) tCTGAGCTTTCCCAGGAAGATCTGGACGATGACGAAGATGAAGa  <  1:1143996/44‑1 (MQ=255) tCTGAGCTTTCCCAGGAAGATCTGGACGATGACGAAGATGAAGa  <  1:1135562/44‑1 (MQ=255) tCTGAGCTTTCCCAGGAAGATCTGGACGATGACGAAGATGAAGa  <  1:1120941/44‑1 (MQ=255) tCTGAGCTTTCCCAGGAAGATCTGGACGATGACGAAGATGAAGa  <  1:111919/44‑1 (MQ=255) tCTGAGCTTTCCCAGGAAGATCTGGACGATGACGAAGATGAAGa  <  1:110548/44‑1 (MQ=255) |                                            TCTGAGCTTTCCCAGGAAGATCTGGACGATGACGAAGATGAAGA  >  W3110S.gb/3212249‑3212292

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑