Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4017055	4017362	308	33 [0]	[0] 21	rhsB	rhsB element core protein RshB

TTATTTAAGGCGTCATATGCGGTGCTATCTATAGAATCAA  >  W3110S.gb/4017363‑4017402 |                                        ttatttaAGGCGTCATATGCGGTGCTATCTATAGAATCaa  <  1:279563/40‑1 (MQ=255) ttatttaAGGCGTCATATGCGGTGCTATCTATAGAATCaa  <  1:934204/40‑1 (MQ=255) ttatttaAGGCGTCATATGCGGTGCTATCTATAGAATCaa  <  1:913007/40‑1 (MQ=255) ttatttaAGGCGTCATATGCGGTGCTATCTATAGAATCaa  <  1:858749/40‑1 (MQ=255) ttatttaAGGCGTCATATGCGGTGCTATCTATAGAATCaa  <  1:856210/40‑1 (MQ=255) ttatttaAGGCGTCATATGCGGTGCTATCTATAGAATCaa  <  1:834638/40‑1 (MQ=255) ttatttaAGGCGTCATATGCGGTGCTATCTATAGAATCaa  <  1:785919/40‑1 (MQ=255) ttatttaAGGCGTCATATGCGGTGCTATCTATAGAATCaa  <  1:640647/40‑1 (MQ=255) ttatttaAGGCGTCATATGCGGTGCTATCTATAGAATCaa  <  1:403276/40‑1 (MQ=255) ttatttaAGGCGTCATATGCGGTGCTATCTATAGAATCaa  <  1:402685/40‑1 (MQ=255) ttatttaAGGCGTCATATGCGGTGCTATCTATAGAATCaa  <  1:293477/40‑1 (MQ=255) ttatttaAGGCGTCATATGCGGTGCTATCTATAGAATCaa  <  1:1012601/40‑1 (MQ=255) ttatttaAGGCGTCATATGCGGTGCTATCTATAGAATCaa  <  1:197547/40‑1 (MQ=255) ttatttaAGGCGTCATATGCGGTGCTATCTATAGAATCaa  <  1:1469213/40‑1 (MQ=255) ttatttaAGGCGTCATATGCGGTGCTATCTATAGAATCaa  <  1:1448578/40‑1 (MQ=255) ttatttaAGGCGTCATATGCGGTGCTATCTATAGAATCaa  <  1:1366615/40‑1 (MQ=255) ttatttaAGGCGTCATATGCGGTGCTATCTATAGAATCaa  <  1:1325148/40‑1 (MQ=255) ttatttaAGGCGTCATATGCGGTGCTATCTATAGAATCaa  <  1:1236347/40‑1 (MQ=255) ttatttaAGGCGTCATATGCGGTGCTATCTATAGAATCaa  <  1:1179568/40‑1 (MQ=255) ttatttaAGGCGTCATATGCGGTGCTATCTATAGAATCaa  <  1:111501/40‑1 (MQ=255) ttatttaAGGCGTCATATGCGGTGCTATCTATAGAATCaa  <  1:1109834/40‑1 (MQ=255) |                                        TTATTTAAGGCGTCATATGCGGTGCTATCTATAGAATCAA  >  W3110S.gb/4017363‑4017402

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑